Cơ quan quản lý thị trường bao gồm ba cấp: Cục Quản lý thị trường thuộc Bộ Công Thương, Chi cục thuộc Sở Công Thương cấp tỉnh và Đội quản lý thị trường cấp quận, huyện. Cục quản lý thị trường là cơ quan giúp Bộ trưởng Bộ Thương mại thực hiện chức năng quản lý nhà nước và tổ chức chỉ đạo nhiệm vụ kiểm tra, kiểm soát thị trường, chống các vi phạm pháp luật trong hoạt động thương mại ở thị trường trong nước. Các chi Cục quản lý thị trường có chức năng giúp Giám đốc Sở Thương mại thực hiện chức năng quản lý nhà nước đối với hoạt động thương mại trên địa bàn tỉnh. Các cơ quan quản lý thị trường có chức năng kiểm tra, kiểm sốt thị trường, đấu tranh chống các hành vi buôn bán hàng giả, thanh tra việc chấp hành pháp luật thương mại đối với các tổ chức, cá nhân hoạt động thương mạị Cùng với sự phân cấp và phối hợp với các cơ quan chức năng, nhiều hoạt động buôn lậu, buôn bán hàng giả đã được phát hiện và xử lý. Tuy nhiên, hiện nay các Đội quản lý thị trường cịn ít, Chính phủ cần có cơ chế để tuyển dụng, hợp đồng lao động và chế độ phù hợp để đáp ứng cơng việc ngày càng gia tăng.
Trong tiến trình cải cách cũng cần có quy định bảo đảm cơ chế phối hợp chặt chẽ giữa các cơ quan như cơ quan ĐKKD, cơ quan thuế, cơ quan quản lý thị trường, cơ quan quản lý ngành, thực hiện giám định hàng hóa, cơ quan quản lý cạnh tranh, cơ quan công an kinh tế, điều tra, xét xử và thi hành án trong việc điều tra, xử lý hay điều tra, truy tố, xét xử, bảo vệ trật tự kinh doanh theo pháp luật.