Nguồn chi ngõn sỏch nhà nước dành cho phỏt triển nụng nghiệp rất thấp so với tổng giỏ trị sản xuất nụng nghiệp, chiếm khoảng 5-6% tổng ngõn sỏch nhà nước (8-16% ở cỏc nước khỏc).
Cỏc chớnh sỏch trong nhúm “Hộp màu hổ phỏch” chiếm 4,9% tổng kinh phớ hỗ trợ, lượng trợ cấp tớnh gộp (AMS) dưới 10%-mức tối thiểu. Trong những năm gần đõy, Nhà nước đó thực hiện giảm đỏng kể biện phỏp hỗ trợ trực tiếp vào thị trường nụng sản. Tuy nhiờn, Việt Nam vẫn đang duy trỡ cỏc biện phỏp như hỗ trợ về vốn, hỗ trợ về lói suất tớn dụng để thu mua nụng sản, xúa nợ và gión nợ cho doanh nghiệp Nhà nước.v.v..Đõy là
những biện phỏp hỗ trợ bị cấm trong WTO yờu cầu Việt Nam phải cắt giảm nếu khụng cú thể sẽ bị ỏp dụng thuế đối khỏng. Về hỗ trợ giỏ thị trường, Chớnh phủ vẫn ỏp dụng một số kiểm soỏt về giỏ thụng qua hạn ngạch và giới hạn nhà xuất khẩu tham gia vào thương mại quốc tế đối với hai mặt hàng gạo và đường. Nhà nước đó hỗ trợ lói suất mua tạm trữ lỳa gạo (1999-2002), cà phờ (1999-2001). Về hỗ trợ giống, Việt Nam đó xõy dựng một chiến lược phỏt triển giống và hàng năm đó chi hỗ trợ cho cỏc cơ sở sản xuất giống để họ bỏn sản phẩm với giỏ thấp hơn (mỗi năm Việt Nam chi khoảng 15 tỷ đồng cho cỏc cơ sở này). Nhà nước cũng đầu tư cho cỏc hoạt động nghiờn cứu khoa học về giống, sản xuất giống gốc, nhập khẩu nguồn gen và giống mới. Ngoài ra, Nhà nước cũng cung cấp cỏc khoản vay ưu đói dành cho tất cả cỏc thành phần kinh tế để sản xuất giống thương mại.
Cỏc chớnh sỏch trong nhúm “hộp xanh da trời” chiếm tỷ lệ 10,7% tổng kinh phớ hỗ trợ. Hiện tại Việt Nam khụng ỏp dụng biện phỏp phi thuế quan nào thuộc dạng hỗ trợ trực tiếp theo cỏc chương trỡnh hạn chế sản xuất.
Hỗ trợ trong nước chủ yếu ở “Hộp xanh lỏ cõy" (chiếm 84,5% tổng mức hỗ trợ của chớnh phủ). Tuy nhiờn, yờu cầu về mức độ minh bạch trong hoạt động của cỏc biện phỏp này chưa được thực hiện tốt. Mức hỗ trợ tập trung chủ yếu vào kết cấu hạ tầng nụng nghiệp, trong đú đầu tư cho thủy lợi chiếm hơn 50%. Ngõn sỏch nhà nước dành cho cụng tỏc nghiờn cứu về nụng nghiệp bao gồm cỏc đề tài nghiờn cứu giống cõy con, kỹ thuật canh tỏc, nụng húa, thổ nhưỡng, nguồn nước v.v..rất thấp, chỉ chiếm khoảng 1,7% tổng ngõn sỏch chớnh phủ dành cho nụng nghiệp, trong khi đú Trung Quốc: 6%, Malaysia: 10%, Thỏi Lan: 10%. Cỏc chương trỡnh phổ biến kỹ thuật về giống mới (lỳa, cà phờ, chố, cao su v.v..), kỹ thuật canh tỏc, phũng trừ sõu bệnh tổng hợp, kỹ thuật bảo quản, chế biến nụng sản, cụng nghệ sau thu hoạch.v.v.chủ yếu được thực hiện qua hệ thống khuyến nụng của nhà nước từ Trung ương đến cấp huyện (được thành lập theo Nghị định số 13/CP ngày 2/3/1993).
Để đảm bảo an ninh lương thực, Nhà nước đó thực hiện dự trữ quốc gia để phục vụ mục tiờu an ninh lương thực như gạo, muối, ngụ, giống cõy trồng, thuốc thỳ y, thuốc trừ sõu. Trợ cấp lương thực, thực phẩm cho cỏc vựng sõu, vựng xa trong nước nhằm xúa đúi giảm nghốo, trợ giỳp cỏc vựng khi xảy ra thiờn tai (quỹ dự phũng thiờn tai). Sử dụng tớn dụng với lói suất ưu đói cho nụng nghiệp thụng qua cỏc chương trỡnh phỏt triển nụng thụn, xúa đúi giảm nghốo. Ngoài ra, chớnh phủ cũn trợ cấp cho người cú mức thu nhập dưới
từng đợt, chuẩn nghốo quốc gia. Những vựng sản xuất nguyờn liệu tập trung gắn với cơ sở chế biến, tiờu thụ nụng sản hàng húa (cú hợp đồng tiờu thụ nụng sản hàng húa) được Nhà nước trớch ngõn sỏch hỗ trợ đầu tư xõy dựng cơ sở hạ tầng, hệ thống chợ bỏn buụn, kho bảo quản, mạng lưới thụng tin thị trường, cỏc cơ sở kiểm định chất lượng nụng sản hàng húa (theo Quyết định số 132/2001/QĐ-TTg ngày 07/9/2001 của Thủ tướng chớnh phủ).Việt Nam chưa ỏp dụng một số chương trỡnh như chương trỡnh an toàn và bảo hiểm thu nhập cho nụng dõn, trợ cấp chuyển dịch cơ cấu nụng nghiệp thụng qua chương trỡnh trợ giỳp nụng dõn nghỉ hưu, chương trỡnh mụi trường.
Về hỗ trợ dưới dạng “chương trỡnh phỏt triển”, Nhà nước đó thực hiện hỗ trợ lói suất đầu tư, sau đầu tư cho một số ngành hàng, nhà mỏy chế biến như mớa đường, rau quả. Nhà nước hỗ trợ một phần vốn đầu tư từ nguồn vốn xõy dựng cơ bản tập trung (theo Thụng tư số 95/2004/TT-BTC) cho cỏc cơ sở chế biến nụng, lõm sản gắn với cỏc vựng nguyờn liệu tập trung. Áp dụng trợ cấp đầu vào cho người nghốo cú thu nhập thấp hoặc nụng dõn ở cỏc vựng khú khăn như vận chuyển phõn bún, giống lờn xuống miền nỳi qua hệ thống Ngõn hàng người nghốo với lói suất cho vay thấp rất ớt. Đối với một số khoản nợ khú đũi của người nghốo, Nhà nước cho cấp bự chờnh lệch lói suất, khoanh nợ và xúa nợ. Áp dụng hỗ trợ cho nụng dõn để họ chuyển từ trồng cõy thuốc phiện sang trồng cõy khỏc (như hỗ trợ giống, hướng dẫn kỹ thuật và kiểm tra, kiểm soỏt quỏ trỡnh thực hiện chuyển dịch cõy trồng này) rất ớt.