Hiện nay, chưa cú một cơ quan nào quản lý thống nhất và đầy đủ cỏc thụng tin liờn quan đến lý lịch tư phỏp. Những thụng tin liờn quan đến lý lịch tư phỏp đang bị phõn tỏn ở nhiều cơ quan khỏc nhau: Toà ỏn, Kiểm sỏt, Cụng an… do vậy, mà trong hệ thống hồ sơ thường chỉ cú cỏc thụng tin ban đầu cũn những thụng tin tiếp theo thỡ khụng được cập nhật, lưu trữ một cỏch cẩn thận, khiến cho cụng tỏc xỏc minh bị kộo dài, cú trường hợp khụng nhận được kết quả, gõy phiền hà cho người dõn.
- Thứ hai, hoạt động quản lý lý lịch tư phỏp hiện nay chưa đảm bảo
được mục đớch cơ bản và chủ yếu là nhằm hỗ trợ cho hoạt động tố tụng và quản lý nhà nước.
Lý lịch tư phỏp được coi là nguồn cung cấp những cứ liệu chớnh thức về quỏ khứ nhõn thõn của bị can, bị cỏo để cơ quan điều tra, truy tố, xột xử xem xột, giải quyết vụ ỏn. Việc cấp Phiếu lý lịch tư phỏp theo quy định tại Thụng tư liờn tịch số 07 chỉ là một phần cụng việc của quản lý lý lịch tư phỏp. Đặc biệt trong giai đoạn hiện nay, hệ thống hỡnh phạt trong Bộ luật tố tụng Hỡnh sự năm 1999 cú nhiều hỡnh phạt mà người phạm tội khụng bị giam giữ nhưng cần được theo dừi, quản lý chặt chẽ (cải tạo khụng giam giữ, quản chế…) nhưng hiện nay chỳng ta chưa cú cơ chế chặt chẽ nhằm quản lý, theo dừi cỏc đối tượng này.
- Thứ ba, lý lịch tư phỏp là phương tiện để thực hiện xoỏ ỏn tớch theo quy định của phỏp luật
Xoỏ ỏn tớch là một chớnh sỏch thể hiện tớnh nhõn đạo sõu sắc của Nhà nước ta. Tuy nhiờn, hiện nay, việc thực hiện chớnh sỏch này chưa thực sự được coi trọng. Hạn chế này xuất phỏt từ trỏch nhiệm của cỏc cơ quan Nhà nước cú thẩm quyền cũng như về phớa người dõn. Theo quy định của Bộ Luật
hỡnh sự , người được xoỏ ỏn tớch coi như chưa bị kết ỏn và được Toà ỏn cấp Giấy chứng nhận. Nhưng trờn thực tế người dõn chưa nhận thức đầy đủ về tầm quan trọng của việc xoỏ ỏn tớch. Về phớa cỏc cơ quan Nhà nước cú thẩm quyền trong việc xoỏ ỏn tớch cũng chưa thực sự chủ động trong việc triển khai cụng việc này. Vỡ vậy, đó cú khụng ớt trường hợp, kết quả xỏc minh lý lịch tư phỏp của Cụng an chuyển sang Sở Tư phỏp trả lời là cú tiền ỏn, nhưng trờn thực tế, đương sựđó đủ thời hạn được xoỏ ỏn tớch. Do đú, việc xõy dựng một tổ chức tập trung thống nhất quản lý lý lịch tư phỏp nhằm theo dừi và thực hiện việc xoỏ ỏn tớch là rất cần thiết