Mục tiêu tổng quát trong QLNN đối với TTCK là tạo ra một thị trường hoạt động ổn định, hiệu quả, phát huy tốt nhất vai trò của TTCK đối với quá trình phát triển kinh tế- xã hội của đất nước.Trong đó, có hướng tới những mục tiêu cụ thể sau:
Một là, mục tiêu phát triển thị trường. Mục tiêu cuối cùng của QLNN nói chung và quản lý TTCK nói riêng là nhằm phát triển thị trường, cả thị trường trái phiếu, thị trường cổ phiếu, tăng khối lượng giao dịch và mức vốn hóa thị trường,
đưa thị trường trở thành một trong những kênh quan trọng huy động vốn và nguồn lực của xã hội vào phát triển kinh tế đất nước.
Hai là, bảo vệ nhà đầu tư, ổn định thị trường và giảm thiểu rủi ro. IOSCO khuyến nghị: mục tiêu cơ bản trong quản lý TTCK là bảo vệ nhà đầu tư; đảm bảo thị trường công bằng, minh bạch và giảm thiểu rủi ro hệthống; tăng cường ổn định thị trường trong nước; phối hợp, chia sẻ thông tin để ổn định thị trường khu vực, toàn cầu. Trong đó, bảo vệ NĐT; đảm bảo thị trường công bằng, hiệu quả, minh bạch và giảm rủi ro hệ thống là ba mục tiêu cơ bản được IOSCO khuyến nghị cho mọi thị trường có tính tới yếu tố môi trường của từng quốc gia. Bảo vệquyền và lợi ích hợp pháp của NĐT không chỉ là mục tiêu mà còn là nguyên tắc hoạt động của TTCK, thểhiện vai trò của QLNN. Mọi chính sách, quy định, cơ chế hoạt động đều phải thể hiện trách nhiệm bảo vệ nhà đầu tư và mang tính quyết định đến sự phát triển của TTCK. QLNN đối với TTCK cần hướng tới việc quản lý rủi ro có hệ
thống, tránh những tác động dây chuyền của đổ vỡ thị trường, giảm thiểu tổn thất cho nền kinh tếkhi khủng hoảng xảy ra.
Ba là, đảm bảo tính công bằng, minh bạch và hiệu quả của thị trường. TTCK
chỉ có thể hoạt động ổn định và bền vững khi các thông tin cung cấp và các giao dịch trên thị trường bảo đảm được tính công bằng, minh bạch, trung thực, đầy đủ và kịp thời. Bởi vì đây chính là cơ sở giúp cho tổ chức phát hành và nhà đầu tư có được những quyết định đúng, giúp các tổ chức kinh doanh chứng khoán có được
những kết quả phân tích và dự báo chính xác. Để góp phần tạo ra sự ổn định, năng
động và hiệu quả của TTCK thì hoạt động quản lý của nhà nước phải tạo ra sự bình
đẳng cho các chủ thể tham gia TTCK trong khuôn khổ pháp luật và hướng tới lợi
ích chung. Để thực hiện được các yêu cầu này, QLNN phải đảm bảo việc cung cấp
thông tin về chứng khoán và TTCK được thực hiện một cách kịp thời, đầy đủ, chính xác làm cơ sở cho việc định giá chứng khoán; các quy luật của thị trường phải được
tôn trọng. Đồng thời, việc sử dụng các công cụ và biện pháp quản lý để tác động,
can thiệp vào thị trường cần có sự cân nhắc, tính toán cẩn trọng; tránh khuynh hướng sử dụng các biện pháp trái quy luật và can thiệp thô bạo bằng những biện
pháp hành chính có thể đưa đến những hậu quả xấu với thị trường.