Nhận thức một bộ phận cán bộ quản lý chưa chủ động cao trong công tác, chưa xem hoạt động quản lý bồi dưỡng là nhiệm vụ. Trình độ chuyên môn đội ngũ CBQL đạt chuẩn và trên chuẩn nhưng không được đào tạo chuyên ngành quản lý giáo dục, kỹ năng điều hành quản lí còn bất cập. Một số giảng viên của trường CBQLGD thực hiện bồi dưỡng còn nặng về trình bày lý thuyết, thiếu thực tiễn nên chưa tạo lôi cuốn cho người học là yếu tố ảnh hưởng đến công tác tổ chức bồi dưỡng.
Trình độ, năng lực, điều kiện của học viên tham dự các lớp bồi dưỡng CBQL các trường THPT về trình độ chuyên môn, được bổ nhiệm quản lý do có chuyên môn cao đạt chuẩn và trên chuẩn, được tín nhiệm của tập thể nhà trường nhưng chưa qua đào tạo quản lý, chưa coi trọng việc hoạt động bồi dưỡng CBQL, tham gia bồi dưỡng vì bắt buộc, nên đi trể về sớm… Tính chuyên nghiệp chưa cao, đặc biệt trong việc thực thi công vụ, khả năng tham mưu, đề xuất, chỉ đạo và tổ chức thực hiện các lĩnh vực còn hạn chế. Đa số còn làm việc dựa trên kinh nghiệm cá nhân, chưa chú trọng công tác dự báo, xây dựng chiến lược và kế hoạch hoạt động. Điều kiện tham gia của một số trường THPT trên địa bàn khoảng cách xa với trung tâm nên đi lại gặp khó khăn, thời gian ảnh hưởng đến hiệu quả công tác bồi dưỡng.
Môi trường học tập cũng ảnh hưởng rất lớn tới công tác quản lý. Bầu không khí làm việc trong trung tâm chân tình, thân ái, tất cả vì học viên, nội bộ đoàn kết sẽ là động lực thúc đẩy mọi hoạt động của trung tâm.
Điều kiện CSVC cũng đóng vai trò rất quan trọng. Nếu CSVC không đáp ứng được yêu cầu ngày càng cao của xã hội hiện đại thì không thể nâng cao chất lượng. Các điều kiện đảm bảo hoạt động bồi dưỡng bao gồm CSVC, phòng bộ môn, thư viện, trang thiết bị phục vụ công tác bồi dưỡng... Trong quá trình hoạt động, trung tâm cần chú trọng xây dựng các kế hoạch nguồn tài chính nhằm bảo trì, bổ sung, nâng cấp cơ sở vật chất, thiết bị đảm bảo đồng bộ, đón đầu giúp cho hiệu quả công tác bồi dưỡng đạt chuẩn đề ra. Đây là điều kiện, là động lực thúc đẩy hoạt động bồi dưỡng đạt chất lượng và hiệu quả.