Theo Power (2003), chính những hạn chế trong chức năng kiểm toán truyền thống trong lĩnh vực công đã thúc đẩy phát triển kiểm toán hoạt động do các SAI thường xuyên phải duy trì vị thế và uy tín của mình thông qua hoạt động kiểm toán.
Kết quả phân tích báo cáo kiểm toán chỉ ra, hầu hết các cuộc kiểm toán đều áp dụng lồng ghép cả ba loại hình kiểm toán trong đó có kiểm toán hoạt động. Mặc dù vậy, nhiều nội dung kiểm toán liên quan đến việc xem xét trách nhiệm trong việc quản lý, sử dụng nguồn lực công chưa được quan tâm, trình bày đúng mức trong báo cáo kiểm toán. Kết quả kiểm toán cũng chưa đáp ứng được yêu cầu, đòi hỏi của xã hội trong việc chỉ ra, phát hiện những tồn tại, yếu kém trong quản lý, sử dụng tài sản quốc gia. Nhiều vụ tiêu cực, tham nhũng chưa được phát hiện (kết quả khảo sát tình huống). Hai nguyên nhân này chỉ ra lý do tại sao SAV cần phải triển khai kiểm toán hoạt động. KTV1 tham gia trả lời phỏng vấn cho rằng, do thiếu những quy định pháp luật, vì vậy, nhiều trường hợp phát hiện ra hiện tượng thất thoát, lãng phí nhưng không có các quy định tham chiếu để xử lý, nên các kiến nghị không đủ hiệu lực. Trái lại, việc kết hợp các loại hình kiểm toán trong một cuộc kiểm toán nhưng không kéo dài thời gian thực hiện, thay đổi phương pháp tổ chức kiểm toán dẫn tới, KTV không thể thu thập được đầy đủ các bằng chứng thích hợp phục vụ cho việc đánh giá và hình thành ý kiến kiểm toán (KTV5). Kết quả phân tích báo cáo kiểm
toán trong giai đoạn 2005-2013 cũng chỉ ra rằng, kết quả kiểm toán truyền thống vẫn tăng dần qua các năm.
Từ những phân tích trên, có thể khẳng định rằng, mặc dù kiểm toán truyền thống có một số hạn chế nhất định khi không đi sâu khảo sát, đánh giá được những vấn đề mà xã hội và công chúng quan tâm. Tuy nhiên, hiện nay, việc SAV vẫn tập trung nhiều nguồn lực, thời gian hơn cho loại hình kiểm toán truyền thống chính là nguyên nhân giải thích, kiểm toán hoạt động chậm phát triển. Ngoài ra, việc tổ chức lồng ghép kiểm toán hoạt động cùng với kiểm toán truyền thống trong khi hạn chế về thời gian, nguồn lực cũng là một thách thức khi triển khai kiểm toán hoạt động.