- Công ty Cổ phần PYMEPHARCO được thành lập từ cổ phần hoá doanh nghiệp của công ty dược và vật tư Y tế Phú Yên theo quyết định số 242/QĐ_UB ngày 10/02/2006 của UBND tỉnh Phú Yên và căn cứ giấy chứng nhận ĐKKD số: 3603000168 do sở kế hoạch và đầu tư tỉnh Phú Yên cấp ngày 03/05/2006, với cổ phần chi phối nhà nước nắm giữ 51% vốn điều lệ và chính thức đi vào hoạt động từ tháng 05/2006.
- Công ty Cổ phần PYMEPHARCO tiếp tục kế thừa và phát huy hoạt động sản xuất kinh doanh từ công ty dược và vật tư Y tế Phú Yên.
- Công ty dược và vật tư Y tế Phú yên là một DNNN mà tiền thân của nó là xí nghiệp liên hiệp dược Phú Khánh trước đây. Sau khi nhà nước có quyết định tách tỉnh Phú Khánh thành hai tỉnh Phú Yên và Khánh Hoà, vào tháng 07/1989 cũng như các doanh nghiệp khác công ty dược và vật tư Y tế Phú Yên được UBND tỉnh Phú Yên cho phép thành lập theo quyết định số 94/QĐ_UB ngày
28/07/1989 với các chức năng nhiệm vụ kinh doanh chính là: tổ chức cung ứng thuốc và trang thiết bị y tế, nuôi trồng, thu mua và nghiên cứu dược liệu.
- Lúc mới thành lập cơ cấu bộ máy của công ty chỉ có 4 người, tài sản hầu như không có gì. Công ty được sở Y tế tỉnh Phú Yên cho mượn một căn nhà trước đây là khu tập thể dành cho CBCNV của ngành mới được chuyên về từ Khánh Hòa để làm văn phòng làm việc với diện tích chỉ có 120 m2.
- Cuối năm 1989 công ty mới được UBND tỉnh Phú Yên cấp vốn lưu động 50.000.000 đồng để phục vụ cho hoạt động kinh doanh. Nếu so sánh với thời điểm này thì vốn kinh doanh của các công ty dược vùng Tây Nam Bộ là khoảng 2 tỷđồng và các công ty khác khoảng 1,5 tỷ đồng, thấp nhất là 700.000.000 - 800.000.000 đồng.
Việc khởi sự kinh doanh của công ty với một nguồn lực không cân sức với các đơn vị trong ngành đã đặt cho ban lãnh đạo của công ty trước thử thách gay go nhưng với sựđoàn kết và nhất trí trong nội bộ công ty đã vạch ra một chương trình, kế hoạch riêng và mục tiêu hàng đầu lúc bấy giờ của công ty là tạo uy tín với khách hàng, với cơ quan đầu ngành và chính quyền.
- Đến năm 1991 được UBND tỉnh cấp cho một lô đất khoảng 3000 m2 trên đường Nguyễn Huệ thị xã Tuy Hòa nay là thành phố Tuy Hòa để xây dựng cơ sở mới và trụ sở chính.
- Qua hơn một năm hoạt động công ty đã đạt được những thành công ban đầu, các công ty lớn ở thành phố Hồ Chí Minh đã biết đến tên tuổi của công ty dược và vật tư Y tế Phú Yên.
- Năm 1993 thành lập chi nhánh tại thành phố Hồ Chí Minh
- Ngày 21/09/1993 công ty đã được bộ trưởng bộ thương mại cấp giấy phép số 30991014/GP cho phép công ty được kinh doanh xuất nhập khẩu trực tiếp các mặt hàng thuốc tân dược và trang thiết bị y tế. Công ty đã trở thành công ty duy nhất ở khu vực miền Trung và là một trong tổng 26 công ty trong cả nước được phép kinh doanh xuất nhập khẩu trực tiếp trong ngành. Đây là bước đột phá lớn nhất sau 3 năm hoạt động của công ty.
Đầu tháng 10/2003, nhà máy dược phẩm PYMEPHARCO đạt tiêu chuẩn GMP-WHO chính thức đi vào hoạt động với 3 phân xưởng: β-Lactam, Non β- Lactam và viên nang mềm.
- Đầu năm 2004 công ty bắt đầu đi vào hoạt động sản xuất với hơn 40 loại thuốc tân dược các loại.
- Ngày 17/01/2006, nhà máy được cấp giấy chứng nhận thực hành tốt sản xuất thuốc của tổ chức y tế thế giới (WHO-GMP).
- Đến cuối năm 2006, biên chế của công ty tăng lên đến 465 người, nguồn vốn chủ sở hữu tăng lên đến trên 48 tỷđồng, thu nhập bình quân một cán bộ là 1.810.000 đồng /tháng. Phạm vi hoạt động của công ty được mở rộng trên toàn quốc và nhiều nước trên thế giới như: Đức, Pháp, Mỹ, Ấn Độ, Trung Quốc, Hàn Quốc, Thái Lan, Singapore,...
- Hiện tại, trụ sở chính của công ty đã được mở rộng ra 13.000 m2đặt tại 166 - 170 Nguyễn Huệ.
- Song song đó, PYMEPHARCO đang xúc tiến đầu tư một nhà máy thuốc tiêm và xây dựng chi nhánh R&F của công ty STADA - CHLB Đức tại Việt Nam nhằm nghiên cứu và phát triển một số sản phẩm đáp ứng nhu cầu ngành y tế.