- cDNA mới tạo ra này cú những đoạn tự lặp lại với kớch thước khỏc nhau được gọi là đoạn cuối dài tự lặp lại (long terminal repeat), nhờ vậy
b. Lớp vỏ trong (vỏ capsid)
1.4. PHÂN LOẠI H
HIV là virus cú độ biến đổi cao, đột biến dễ dàng. Điều này cú nghĩa là trong một cơ thể của một người nhiễm bệnh cũng cú nhiều chủng HIV. Dựa trờn những điểm tương tự về di truyền, HIV được chia làm 2 type là: HIV-1 và HIV-2. Hai type này cựng gõy nờn AIDS trờn người với bệnh cảnh lõm sàng khụng thể phõn biệt được và đường lõy hoàn toàn giống nhau. Tuy nhiờn, HIV-1 là type gõy bệnh chủ yếu và là nguyờn nhõn chớnh gõy AIDS ở
tất cả cỏc chõu lục trờn thế giới, khi núi nhiễm HIV mà khụng kốm theo type HIV tức là núi đến HIV-1. HIV-2 chỉ lưu hành ở chõu Phi, cú khả năng gõy bệnh và tiến triển bệnh lõu hơn, khú lõy hơn HIV-1 [41], [102].
1.4.1. HIV-1
Dựa vào sự biến đổi về gen của HIV-1, người ta chia HIV-1 ra thành 3 nhúm là nhúm M (major), nhúm N (new) và O (outlier). Cỏc nhúm này cú thể khỏc nhau 30-40% trong trỡnh tự cỏc axit amin nằm ở gp120. Ba nhúm này đại diện cho đợt du nhập riờng rẽ của SIV gõy suy giảm miễn dịch từ khỉ
sang người. Nhúm O hầu như chỉ khu trỳ tại Tõy Phi, nhúm N rất hiếm gặp và chỉ mới được phỏt hiện tại Cameroon (1998) cũn lại là trờn 90% cỏc trường hợp nhiễm HIV-1 đều thuộc nhúm M.
21
Nhúm M là nhúm lớn nhất và được chia làm 8 phõn type [(A1, A2), (B), (C), (D), (CRF01_AE), (F1, F2, K) (G, J), (H)]; mỗi phõn type cú phõn vựng địa lý khỏc nhau [40], [98].
Ngoài cỏc phõn type, cỏc thể tỏi tổ hợp giữa cỏc phõn type (CRF) cũng
đang xuất hiện ngày càng nhiều và làm cho cỏc việc nghiờn cứu về HIV-1 ngày càng trở nờn phức tạp và khú khăn. Sự hỡnh thành cỏc thể tỏi tổ hợp là do 2 virus thuộc 2 phõn type khỏc nhau cựng hiện diện trong tế bào người nhiễm và hũa trộn cỏc chất liệu di truyền để tạo thành một virus lai mới, mặc dự đa số virus thuộc chủng mới này khụng sống sút lõu được, nhưng nếu chủng nào lõy nhiễm tồn tại được sẽ tạo ra thể tỏi tổ hợp. Hiện nay, cỏc nhà khoa học đó phỏt hiện được khoảng 30 CRF. CRF A/E được coi là sự lai tạo giữa phõn type A và một phõn type gốc E, cho đến nay người ta vẫn chưa tỡm thấy được phõn type E ở dạng riờng rẽ vỡ vậy CRF A/E cú thể được coi là phõn type E [41].
Hỡnh 1.3: Sơđồ phõn bố cỏc phõn type HIV [104].
Kết qủa nghiờn cứu phõn tớch mức độ lưu hành của cỏc phõn type HIV -1 toàn cầu năm 2004 cho thấy [41], [39]:
22
+ Về tỷ lệ %: Phõn type C chiếm đa số (47,2%), phõn type A 27%, phõn type B chiếm 12,3%, phõn type D chiếm 5,3%, phõn type E chiếm 3,2%, cỏc phõn type cũn lại (F, G, H, J,) và cỏc CRF khỏc chỉ chiếm 5 %.
+ Về phõn vựng địa lý: Cỏc phõn type HIV-1 và cỏc CRF được phõn bố
khụng đều trờn thế giới, trong đú cỏc phõn type B và C phõn bố rộng rói nhất. Phõn type B xuất hiện chủ yếu tại Bắc Mỹ, chõu Âu và chõu Úc. Tuy nhiờn, hiện nay tại chõu Âu đang dần cú sự du nhập của cỏc phõn type khỏc, khoảng 25% những trường hợp nhiễm HIV tại chõu Âu khụng phải do phõn type B. Điều này cú thểđược giải thớch là do sự lai tạp về dõn số vỡ đó cú một số lượng lớn dõn di cư du nhập đến chõu Âu kể từ sau thế chiến thứ 2.
Phõn type C là phõn type thường gõy ra cỏc vụ dịch HIV nặng nề chủ yếu tại chõu Phi, chõu Á, Ấn Độ, Nepal và là nguyờn nhõn của khoảng một nửa cỏc trường hợp nhiễm HIV hiện nay trờn thế giới.
Phõn type A xuất hiện nhiều tại Nga và chõu Phi, chủ yếu tại Tõy Phi và Trung Phi cũn phõn type D lại thường khu trỳ tại Đụng Phi.
Phõn type F được tỡm thấy tại Trung Phi, Nam Mỹ và Đụng Âu nhưng phõn type G và CRF A/G lại là nguyờn nhõn gõy bệnh chủ yếu tại Tõy Phi,
Đụng Phi và tại Trung Âu.
Phõn type H chỉ tỡm thấy tại Trung Phi; phõn type J chỉ cú tại Trung Mỹ; và phõn type K chỉ cú tại Cộng hũa Dõn chủ Congo và Cameroon.
Theo cỏc cụng bố gần đõy của cỏc nước khu vực Đụng Nam Á thỡ phõn type lưu hành chủ yếu ở khu vực này lại là CRF01_AE (nhưng nguồn gốc từ
Trung Phi). Tại Việt Nam, hiện nay thường xuất hiện HIV-1 phõn type CRF01_AE và B phõn bố tựy theo nhúm đối tượng vớ dụ như HIV-1 phõn type CRF01_AE lõy truyền chủ yếu trong nhúm đối tượng là những người tiờm chớch [63], [64], [79].
23
1.4.2. HIV- 2
Cỏc chủng HIV-2 ớt gặp hơn HIV-1, thường chỉ gặp ở Tõy Phi mà hiếm khi thấy ở nơi khỏc. HIV-2 được chia thành 8 phõn typ là A, B, C, D, E, F, G, H.
Hỡnh 1.4: Sơ đồ phõn type của HIV [41].