Mặc dù đã có sự hợp tác giữa các Nhóm nghiên cứu mạnh, giải quyết được những nhiệm vụ lớn, nhưng chưa đều, số lượng chuyên gia đầu ngành trong Học viện chưa nhiều. Việc đăng ký xét duyệt chức danh sĩ quan - chuyên môn - kỹ thuật và chức danh GS, PGS còn thấp so với Kế hoạch đã được phê duyệt.
Công tác xây dựng đội ngũ, phát triển nguồn nhân lực giảng viên, nghiên cứu viên có một số tồn tại như: (1) Nguồn vào đội ngũ giảng viên, nghiên cứu viên chưa thực sự đa dạng; đội ngũ có học hàm GS, PGS có xu hướng trẻ hóa nhưng độ tuổi trung bình vẫn còn cao, chưa đồng đều ở các nhóm ngành; (2) Một số giảng viên, nghiên cứu viên có học vị TS nhưng chuyên ngành được đào tạo chưa thực sự sát với chuyên ngành giảng dạy và hướng nghiên cứu chuyên sâu nên cơ cấu chuyên môn ở một số ít bộ môn, nhóm nghiên cứu chưa thực sự phù hợp; số giảng viên, nghiên cứu viên mới được đào tạo ở nước ngoài còn thiên nhiều về lý thuyết, kiến thức thực tế hạn chế; một số lĩnh vực còn thiếu chuyên gia đầu ngành; (3) Tỷ lệ giảng viên, nghiên cứu viên có chứng chỉ ngoại ngữ quốc tế vẫn còn thấp, khả năng giảng dạy bằng ngoại ngữ của giảng viên chưa đáp ứng tốt yêu cầu hội nhập quốc
tế. Khả năng giao tiếp và trao đổi chuyên môn bằng tiếng Anh vẫn còn là điểm yếu của phần đông đội ngũ của Học viện; (4) Có thời điểm, cơ cấu đội ngũ giảng viên, nghiên cứu viên chưa phù hợp, số thừa không thay thế được số thiếu, cơ cấu độ tuổi có biểu hiện mất cân đối, chưa cập nhật các phương pháp giảng dạy tiên tiến...
Về nhận thức, một số bộ phận cán bộ, giảng viên chưa nhận thức sâu sắc tầm quan trọng của việc hội nhập CMCN 4.0. Chưa tích cực tìm hiểu, nâng cao nhận thức để thấy được vai trò, trách nhiệm của mình trước yêu cầu của CMCN 4.0 (vai trò tuyên tuyền, chuẩn bị kiến thức, phương pháp làm việc).
Nguyên nhân của các mặt hạn chế: (1) Học viện triển khai thực hiện Chương trình hành động đáp ứng yêu cầu CMCN 4.0 giai đoạn 2018 - 2025 và những năm tiếp theo, trong bối cảnh Học viện đang xây dựng và triển khai nhiều Kế hoạch khác nên công tác triển khai có mặt còn thiếu đồng bộ hoặc bị chồng chéo; (2) Một số nội dung phụ thuộc kế hoạch của trên như (đào tạo, khảo thí và đảm bảo chất lượng,...); (3) Số lượng và quy mô các đề tài lớn còn tập trung vào một số ít Nhóm nghiên cứu mạnh, trong khi nhân lực hạn chế và sự phối hợp giữa các Nhóm nghiên cứu mạnh chưa sâu. Kinh phí đảm bảo chưa kịp thời (thường cấp vào cuối năm) nên khó khăn trong thực hiện.