Ngợc dòng thời gian, chúng ta thấy rằng công cuộc khai phá đất đai vùng phía tây Nghệ An có từ thời Lý. Khi đó, các vua triều Lý đã tiến hành khai khẩn, mở mang thêm diện tích trồng trọt và thành lập nhiều làng mới. Lý Nhật Quang trong thời gian làm tri châu Nghệ An đã mở mang đợc 5 châu, 22 trại, 56 sách tập trung dọc sông Lam, sông La, vùng Nam Kim (Nam Đàn), vùng Khe Bố, Vĩnh Hòa (Tơng Dơng), vùng Cự Đồn (Con Cuông).
Sang thời Trần vùng đất Con Cuông ngày nay đợc gọi với tên là Mật Châu hay Kiềm Châu. Trong cuốn “Đại Việt sử kí toàn th” của Ngô Sĩ Liên có ghi: “thế kỷ XIII Con Cuông có tên gọi là Nam Nhung, Kiềm Châu, sau đổi thành Mật Châu”. Cho đến cuối thời Lê Sơ vẫn còn là phủ Ki Mi, thủ phủ đóng ở Thành Nam”. Năm Minh Mạng thứ hai (1822) đổi tên phủ Trà Lân thành phủ Tơng Dơng (gồm 3 tổng), Vĩnh Hoà (3 tổng), Hội Nguyên (3 tổng) Kỳ Sơn (5 tổng). Cho đến năm 1866, huyện Tơng Dơng có 3 tổng là:
- Tổng An Duyệt gồm 4 xã: Chính Yên, Chi Khê, Thạnh Ngàn, Mậu Đức.
- Tổng Lục Dạ gồm hai xã: Cẩm Đờng, Hữu Lệ.
- Tổng Tứ Dơng gồm xã Môn Sơn.
Về sau cắt tổng Lịch Cốc (2 xã) của huyện Vĩnh Hoà nhập vào huyện T- ơng Dơng nhng trong th từ giao dịch, dân trong huyện ghi lại địa danh là Cồn
Cuông. Trong các bản sao lục của Thừa phái nha huyện Tơng Dơng cũng ghi địa danh sao lục là Cồn Cuông.
Huyện Vĩnh Hoà sau khi phân chia, một phần thuộc xã Lạng Khê ngày nay (thuộc Thai Lạng cũ) nhập vào huyện Tơng Dơng. Sau Cách mạng Tháng Tám - 1945, huyện Tơng Dơng đổi lấy tên là huyện Con Cuông gồm 6 xã: Môn Sơn, Lục Dạ, Chính Yên, Châu Khê, Mậu Thạch, Cam Phục. Đến 1958 xã Chính Yên tách thành 2 xã mới là Bồng Khê và Yên Khê.
Ngày 27-2-1961 tách xã Châu Khê thành 3 xã là Chi Khê, Châu Khê và Lạng Khê.
Ngày 5-7-1963 xã Bình Chuẩn của huyện Tơng Dơng sát nhập vào huyện Con Cuông, tách xã Mậu Thạch thành 2 xã Mậu Đức và Thạch Ngàn, tách xã Cam Phục thành 2 xã Cam Lâm và Đôn Phục. Sát nhập chòm Muỗng và Bỏi thuộc xã Đôn Phục vào xã Mậu Đức. Sát nhập chòm Hua Nà thuộc xã Môn Sơn vào xã Lục Dạ.
Ngày 1-3-1988, tách các xóm Đồng Tiến, Tân Yên, Tân Tiến, Việt Tiến của xã Bồng Khê thành lập thị trấn Con Cuông. Đến ngày 19-8-1988 Uỷ ban nhân dân lâm thời thị trấn chính thức hoạt động.
Nh vậy, đến tháng 8-1988 huyện Con Cuông đã có 12 xã và 1 thị trấn là: Môn Sơn, Lục Dạ, Yên Khê, Bồng Khê, Châu Khê, Chi Khê, Lạng Khê, Cam Lâm, Thạch Ngàn, Mậu Đức, Đôn Phục, Bình Chuẩn và thị trấn Con Cuông [43, tr.10-11].
Kể từ năm 1988 cho đến nay, địa lý - hành chính huyện Con Cuông không có sự thay đổi lớn nào. Nhờ sự ổn định của hệ thống hành chính mà các dân tộc anh em chung sống trên địa bàn huyện có điều kiện cùng chung sức xây dựng huyện ngày càng giàu đẹp hơn.