Hiện nay, một số chớnh sỏch đó ban hành từ trước khi Luật Đất đai năm 2003 cú hiệu lực thi hành nhưng vẫn đang được tiếp tục ỏp dụng, điều này đó dẫn đến trờn cựng một địa bàn, cựng một nội dung cụng việc nhưng lại cú hai cơ chế cựng chi phối dẫn đến khụng thống nhất, khú khăn trong tổ chức thực hiện, điển hỡnh là:
- Việc bỏn nhà thuộc sở hữu nhà nước: ngày 05/7/1994 Chớnh phủ ban hành Nghị định số 61/CP về việc bỏn nhà thuộc sở hữu nhà nước, phạm vi của chớnh sỏch này là nhà nước bỏn nhà thuộc sở hữu nhà nước cho người đang thuờ, trong đú thành phần chủ yếu là cỏn bộ, cụng nhõn viờn chức cú thu nhập thấp, khú khăn về nhà ở với mức thu tiền sử dụng đất, tiền bỏn nhà bằng 40% tiền sử dụng đất theo giỏ đất do UBND tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương quy định; từ khi triển khai thực hiện, giỏ đất tớnh thu tiền sử dụng đất là giỏ đất do UBND cấp tỉnh ban hành theo Nghị định 87/CP ngày 17/8/1994 của Chớnh phủ; cơ chế này đó được thực hiện trong hơn 10 năm, giỳp cho hàng vạn hộ gia đỡnh được ổn định chỗ ở.
Thi hành Luật Đất đai năm 2003, từ ngày 01/01/2005 cỏc địa phương đó ban hành và ỏp dụng giỏ đất mới theo quy định tại Nghị định số 188/2004/NĐ- CP ngày 16/11/2004 của Chớnh phủ về phương phỏp xỏc định giỏ đất và khung giỏ cỏc loại đất; giỏ đất mới được ban hành trờn nguyờn tắc sỏt với giỏ chuyển nhượng thực tế trờn thị trường trong điều kiện bỡnh thường, và thực tế là từ đầu năm 2005 cỏc địa phương đó điều chỉnh giỏ đất tăng từ 2 đến 7 lần so với giỏ trước đú. Áp dụng giỏ đất do cỏc địa phương ban hành theo Nghị định số 188/2004/NĐ-CP của Chớnh phủ để tớnh thu tiền khi bỏn
nhà thuộc sở hữu nhà nước theo Nghị định 61/CP là phự hợp với quy định hiện hành của phỏp luật, nhưng sẽ dẫn đến sự mất cụng bằng giữa người được mua trước và người mua sau vỡ người mua sau sẽ phải trả tiền tăng tương ứng với mức tăng giỏ đất so với người mua trước, và sẽ cú nhiều hộ gia đỡnh khụng cú đủ điều kiện về kinh tế để mua nhà; nhưng nếu thực hiện theo giỏ cũ thỡ lại trỏi với quy định của Luật Đất đai năm 2003. Thực tế hiện nay cỏc địa phương vẫn đang tiếp tục thực hiện bỏn nhà theo Nghị định 61/CP, nhưng giỏ tớnh thu tiền sử dụng đất lại khỏc nhau cú nơi theo giỏ cũ, cú nơi theo giỏ mới. - Cỏc khoản thuế, lệ phớ liờn quan đến đất: theo quy định hiện hành, cỏc khoản thuế, lệ phớ nhà nước thu liờn quan đến đất, giỏ đất bao gồm: thuế sử dụng đất, thuế chuyển QSDĐ, lệ phớ trước bạ; cụng thức tớnh đối với cỏc khoản thu này là:
Số tiền thuế, lệ phớ phải nộp = diện tớch đất X giỏ đất X thuế suất. Cỏc chớnh sỏch này đó được ban hành và thực hiện nhiều năm nay với mức thuế suất ổn định. Nhưng từ 01/01/2005, giỏ đất do cỏc địa phương ban hành đó tăng nhiều lần so với trước đú và cú xu hướng tiếp tục tăng trong cỏc năm tới để đỳng theo quy định của Chớnh phủ là sỏt với giỏ chuyển nhượng thực tế trờn thị trường; điều này dẫn đến cỏc khoản thu trờn sẽ tăng tương ứng với giỏ do giỏ tăng nhưng thuế suất vẫn khụng thay đổi. Đứng trờn gúc độ Nhà nước thỡ sẽ cú lợi do thu ngõn sỏch được nhiều hơn; nhưng đối với người sử dụng đất sẽ là rất khú khăn do số tiền phải nộp tăng khỏ cao và đột ngột. Ngoài ra, đõy cũng là một nguyờn nhõn gõy ảnh hưởng làm giảm giao dịch của thị trường BĐS thời gian qua.