Bên cạnh những thuận lợi nêu trên, công tác GDCTTT và QL công tác GDCTTT vẫn còn một số khó khăn, tồn tại sau:
Vẫn còn một bộ phận nhỏ CBGV, SV chưa nhận thức được vai trò và tầm quan trọng của công tác GDCTTT, cũng như chưa nhận thức đầy đủ vai trò của mình đối với công tác này.
Nhà trường mặc dù đã cụ thể hóa các văn bản chỉ đạo của cấp trên về công tác GDCTTT, tuy nhiên việc xây dựng các kế hoạch sát với tình hình thực tế của nhà trường vẫn chưa đạt hiệu quả tốt nhất.
Các phương pháp, hình thức tổ chức GDCTTT cho sinh viên còn đơn điệu, mang tính rập khuôn và chưa đổi mới.
Công tác GDCTTT cho sinh viên còn mang tính hình thức. Việc học tập, giảng dạy các bộ môn khoa học Mác – Lênin, tư tưởng Hồ Chí Minh,…còn chưa thực sự hiệu quả, phần lớn sinh viên chưa hào hứng với các môn học này. Việc tổ chức các buổi sinh hoạt chính trị, học tập theo chuyên đề vẫn chưa thay đổi hình thức nên kết quả đạt được chưa như mong muốn.
75
Công tác GDCTTT cho sinh viên hiện nay vẫn còn thiên về mệnh lệnh, tổ chức hành chính. Việc phối hợp các phương pháp GDCTTT chưa thật sự hiệu quả.
Một số nội dung của công tác GDCTTT vẫn chưa được thực hiện thường xuyên và hiệu quả cũng chưa cao.
Cơ chế phối hợp giữa các lực lượng trong và ngoài Nhà trường chưa thực sự đồng bộ và hiệu quả.
Công tác kiểm tra, đánh giá chất lượng GDCTTT cho sinh viên còn sơ sài, qua loa, chưa thống nhất theo một khung đánh giá chung.
Sinh viên còn thụ động, chưa mạnh dạn phát huy tính tự chủ, sáng tạo của bản thân trong các hoạt động rèn luyện chính trị tư tưởng.
Cơ chế hoạt động công tác GDCTTT cho đội ngũ CBGV, trang thiết bị, cơ sở vật chất, kinh phí cho công tác GDCTTT chưa được quan tâm đầu tư đúng mức.