Sự đóng góp nổi bật nhất trong lĩnh vực nông nghiệp là việc ứng dụng công nghệ sinh học trong chọn, lai tạo để nâng cao chất lượng giống cây trồng, vật nuôi nhằm cung cấp cho sản xuất đạt hiệu quả. Cụ thể:
2.2.2.1. Cây trồng
Cây ăn quả: Qua nghiên cứu, khảo nghiệm, bình tuyển cơ bản xác định nhóm cây đầu dòng chất lượng cao như giống sầu riêng cơm vàng hạt lép 9 Hoá và bưởi da xanh đã được công nhận là giống quốc gia. Các giống nhập nội như: Nhãn xuồng cơm vàng, bòn bon thái, mận Ấn Độ và một số giống tại địa phương như măng cụt, chôm chôm nhãn,
xoài cát Hoà Lộc, bưởi da xanh được khảo nghiệm thích nghi. Công nghệ sản xuất giống cây bằng kỹ thuật vô tính từ một phôi cây để tạo ra quần thể cây có đặc tính di truyền từ cây bố mẹ với tính năng sạch bệnh, cùng với kỹ thuật chiết, ghép, giâm cành truyền thống sớm được người dân tiếp thu làm chủ. Đến nay có trên 60% diện tích trồng cây ăn quả sử dụng giống mới, đã nhân và sản xuất cung ứng giống chất lượng cao với số lượng hàng chục triệu cây/năm. Ngoài ra, còn nghiên cứu, ứng dụng Khoa học kỹ thuật chiết, ghép, chuyển đổi từ vườn tạp sang vườn chuyên, kỹ thuật tạo tán… đã tạo được sự chuyển biến đáng kể trong việc nâng cao diện tích và chủng loại cây ăn quả trên địa bàn tỉnh.
Trong sản xuất giống cây ăn quả, người ta sử dụng các chất kích thích tạo rễ, điều chỉnh lượng phân bón khi ươm, chọn tuổi mắt ghép, gốc ghép phù hợp với từng chủng loại làm tăng tỷ lệ sống của cây từ 60% lên 90-95%. Nhờ vậy nghề sản xuất giống ở Bến Tre đã nổi tiếng khắp cả nước với số luợng sản xuất hàng năm khoảng 20 triệu cây các loại [41, tr.4].
Cây lúa: Đã tập trung nghiên cứu, ứng dụng các giống lúa có năng suất cao, chất lượng gạo tốt, phù hợp với điều kiện canh tác của từng vùng sinh thái trong tỉnh. Qua khảo nghiệm, bình tuyển, đã chọn lọc được 7 giống lúa mới có năng suất, chất lượng, có tính kháng rầy nâu, đạo ôn và phèn tương đối cao, né tránh được phèn mặn, phù hợp với mọi loại đất như: LD 1261, OM 3536, OM 4284, OM 4384, OM 1348-9, Khao Dawk Mali 105.Các giống lúa này năng suất đạt từ 7 đến 8 tấn/ha (2007), góp phần nâng cao tỷ lệ sử dụng giống đạt chất lượng toàn tỉnh 84%. Đến nay, có khoảng 90% diện tích trồng lúa sử dụng giống mới [39, tr.7].
Cây dừa: Đây là loại cây có lợi thế của tỉnh chiếm ưu thế trên thị trường trong và ngoài nước, giải quyết việc làm và tăng thu nhập cho nông dân. Bên canh dự án phát triển 5.000 ha dừa, năm 2006-2007 đã trồng 1.511 ha với 271.980 cây giống. Sở Khoa học và công nghệ phối hợp với các đơn vị chuyển giao (Trung tâm giống cây trồng tỉnh, Trung tâm thực nghiệm dừa Đồng Gò ), triển khai dự án “Du nhập phát triển 500 ha dừa dứa”, đến nay đã trồng 50 ha với 10.000 cây của 136 hộ ở các huyện Mỏ Cày, Giồng Trôm, Châu Thành, hiện tại đang tiếp tục nhân rộng 300 ha trong các năm 2008-2010 [36, tr.8].
Khắc phục thiệt hại do bão số 9 năm 2006, Bộ Khoa học và Công nghệ đã đầu tư cho huyện Bình Đại thực hiện dự án “Xây dựng mô hình ứng dụng tiến bộ khoa học kỹ thuật nhằm khôi phục và đầu tư thâm canh tăng năng suất vườn dừa trên địa bàn huyện Bình Đại” với kinh phí hỗ trợ 965 triệu đồng để đầu tư giống mới và cải tạo kỹ thuật canh tác truyền thống hiệu quả không cao. Ngoài ra, còn nhân rộng và phát triển vườn dừa giống xiêm xanh cho năng suất, chất lượng cao hơn so với dừa tam quan của Bình Định. Bằng kỹ thuật chọn giống và ươm truyền thống đã tạo ra một lượng giống lớn không chỉ cung cấp cho thị trường trong tỉnh mà còn cung cấp ra thị trường các tỉnh đồng bằng Sông Cửu Long mang lại hiệu quả kinh tế cho người nông dân.
Cây mía: Đã khảo nghiệm bình tuyển, du nhập 8 giống có năng suất, chữ đường cao như VĐ 86-368, ROC 16, QĐ 11, VN 84-4137, K 84-200, R 570…đến nay đã có 70% diện tích sử dụng giống mới với năng suất từ 80-100 tấn/ha/năm, chử đạt 9-11 CCS. Mô hình trồng thâm canh cây mía trên vùng đất lúa gò cao nhiễm phèn, mặn với giống mía VN 84-4137 vượt trội cho năng suất trên 100 tấn/ha tăng 170% đang được nhân rộng hình thành vùng chuyên canh mía trên vùng đất lúa gò cao nhiễm phèn, mặn ở 3 huyện vùng biển Bến Tre [39, tr.8].
Cây hoa kiểng: Bằng phương pháp kỹ thuật nuôi cấy mô thực vật trên cây hoa lan (để tạo ra cây Dendrobium, Ocinium, phalanopsis ), cúc hai màu, cát tường, hoa ly ly, hoa nhớ nhung (Gloxinia), hoa dạ yến thảo, hoa hồng môn, cây bắt ruồi, cây bạch mai. Ngoài ra, còn dùng phương pháp nhân giống hữu tính (sử dụng hạt), vô tính (giâm cành, chiết cành, tháp cành ) để tạo ra giống mới có chất lượng như giống kiểng bon sai, mai vàng 10 cánh, mai kiếng thuỷ lá kim và các dạng cây kiểng cổ thụ, để cung cấp cho thị trường trong nước và xuất khẩu.
Nghề nuôi trồng hoa kiểng phát triển mạnh chung quanh khu vực Vĩnh Thành (Chợ Lách) và ngoại thành Thị Xã Bến Tre, hình thành các làng nghề sản xuất , trong đó khu vực Cái Mơn là hạt nhân phát triển hoa kiểng. Ngoài các loại hoa kiểng truyền thống có thế mạnh hàng đầu vùng đồng bằng sông Cửu Long (kiểng thú, kiểng cổ, kiểng thế, hoa tạo hình) sẽ phát triển mạnh các loại kiểng lá và hoa tươi dạng nhập nội, lai tạo, khu vực hoá,
đồng thời từng bước phát triển thêm loại hình phong lan và xương rồng với kỹ thuật truyền thống.
2.2.2. Vật nuôi
Thực hiện chương trình ứng dụng công nghệ sinh học phục vụ phát triển nông nghiệp toàn diện, nhất là trong lĩnh vực chăn nuôi tạo ra giống vật nuôi có lợi thế cung cấp cho sản xuất.
Giống gia súc
Heo giống, bò lai sind, dê, cừu là 4 đối tượng được nghiên cứu và triển khai khá hiệu quả trong thời gian qua. Các chương trình dự án về phát triển giống, nâng cao chất lượng đàn gia súc tạo nguồn nguyên liệu cho chăn nuôi, làm nền tảng cho phát triển chăn nuôi theo hướng trang trại chất lượng cao. Qua sự cố gắng đầu tư nghiên cứu con giống (Landrace, Yorkshire, Duroc) và ứng dụng tiến bộ kỹ thuật trong chăm sóc, chuồng trại, thú y và quản lý, các chỉ tiêu kỹ thuật về chất lượng của đàn heo, cùng với cơ chế xã hội hoá trong việc nhân giống và gieo tinh nhân tạo đã hạn chế cho heo phối giống trực tiếp, từ đó làm giảm đáng kể lây lan dịch bệnh, đồng huyết thoái hoá cũng như bảo vệ môi trường. Kết quả đến nay cho thấy có trên 90% heo nái được gieo tinh nhân tạo giống (22.500 liều tinh) chất lượng cao, hơn 85% đàn heo đã được nạc hoá. Các nghiên cứu về quản lý, lai tạo, chọn lọc và phát triển đàn bò ở huyện Ba Tri được tích cực thực hiện, nâng cao chất lượng đàn bò vàng. Ngoài ra, việc gieo tinh nhân tạo đã đưa được tinh bò giống sind, Brahman phối với giống đàn bò nền trong tỉnh, hiện đang nhập tinh các giống Limousin, Herofor để tiếp tục sản xuất giống mới. Đến nay, toàn tỉnh đã thực hiện việc zebu hoá đàn bò, nâng nhanh tỷ lệ đàn bò có chất lượng cao trong tỉnh từ 15 lên 35% năm 2007 [40, tr.6-7]. Mặt khác, đã du nhập khảo nghiệm cho thấy triển vọng một số giống vật nuôi mới như dê, cừu có chất lượng cao, có khả năng nhân rộng các vùng sinh thái khác nhau trong tỉnh.
Nhờ áp dụng nhanh các tiến bộ kỹ thuật trong chăn nuôi đã góp phần chuyển dịch cơ cấu trong nông nghiệp nâng cao tỷ lệ giá trị sản phẩm chăn nuôi lên 7,2% so với tổng giá trị sản phẩm nông nghiệp, bước đầu đã hình thành một số trang trai hoạt động có hiệu quả kinh tế.
Giống gia cầm
Hiện nay, các trung tâm nghiên cứu, ứng dụng tiến bộ KH, CN của tỉnh đã tập trung nghiên cứu khảo sát khả năng thích nghi của một số loài gia cầm như: gia cầm chuyên trứng Goldline, CV 2000, Hubbard, Comet; chuyên thịt Hybro, Hubbard, super M2, super meat và một số giống gà địa phương, gà thả vườn, gà ri, vịt siêu thịt, vịt siêu trứng…chuyển giao cho nông dân để đưa vào sản xuất. Bằng phương pháp phối, lai tạo, chọn lọc nhân thuần giống, quần thể nhỏ giúp cho người nông dân vừa sản xuất giống mới vừa giữ được giống gốc. Kết quả nghiên cứu và khảo sát đã được triển khai ứng dụng rộng rãi trong nông dân đã đem lại hiệu quả kinh tế cao, làm cho đàn gia cầm của tỉnh ngày càng đa dạng về chủng loại, tăng nhanh về số lượng từ 2.897.135 con năm 2000 lên 3.132.458 con năm 2007 đến cuối năm 2008 đạt 4.500.024 con đã vượt kế hoạch đề ra [41, tr.9].
Giống thuỷ sản
Mặc dù chưa đáp ứng đầy đủ nhu cầu nuôi nhưng về cơ bản đã nghiên cứu triển khai làm chủ được công nghệ sản xuất giống tôm sú, tôm càng xanh, giống cua biển và một số loài cá nước ngọt ( cá rô đồng, rô phi, cá lóc, cá trê, cá sặc rằn, cá kèo) bằng phương pháp nhân tạo. Toàn tỉnh hiện có 69 trại sản xuất giống đảm bảo chất lượng, trong đó có 50 trại sản xuất giống với 420 triệu post/năm, 12 trại sản xuất tôm càng xanh với năng suất 12 triệu post, 4 trại sản xuất cá giống với năng lực 65 triệu cá bột/năm. Từ năm 2001-2005 đã sản xuất giống tôm sú đạt 124 triệu post, ươn và dịch vụ 225 triệu post, tôm càng xanh 12 triệu post, sản xuất cá 150 triệu con và đã cung ứng khoảng 20% nhu cầu tôm sú cho thị trường, so với năm 2001 năng lực sản xuất giống tôm sú tăng gấp 10 lần, tôm càng xanh tăng gấp 4 lần [41, tr.13].
Thông qua thực hiện các đề tài, dự án khoa học, công nghệ đã thực hiện thành công chuyển giao công nghệ sản xuất giống cua biển (đã sản xuất ra khoảng 60.000 con cua giống). Hoàn chỉnh quy trình du nhập và thuần dưỡng tôm sú bố mẹ, đã cung cấp được 19 triệu con giống sạch bệnh và nuôi thử nghiệm 65 ha tại huyện Thạnh Phú năng suất đạt khoảng 5,7 tấn/ha. Hoàn thiện và chuyển giao quy trình sản xuất cá tra bột giống theo tiêu chuẩn SQF 1000CM. Tỷ lệ thuần thục đàn cá bố mẹ đạt 93%, tỷ lệ thụ tinh 92%,
tỷ lệ nở 90%, sản xuất và cung cấp cho thị trường trong tỉnh năm 2007 đạt 67,7 triệu giống cá bột [36, tr.5].
Về nghiên cứu ứng dụng và chuyển giao tiến bộ KH, CN, đã xây dựng trên 60 mô hình nuôi, các mô hình nuôi nước ngọt ngày càng được đa dạng hoá, vừa bảo vệ giống bản địa (cá rô đồng, lóc, trê, sặc rằn, cá kèo, tôm càng xanh), vừa du nhập có chọn lọc các đối tượng mới có giá trị kinh tế cao ( cá tra, cá điêu hồng, ba sa, cá rô phi dòng Gift). Đến nay, đã hoàn thiện các quy trình nuôi vỗ cho sinh sản và ươn nuôi các loài cá nước ngọt: cá mè, trấm, trôi, chép, mè vinh, cá rô, bóng tượng, sặc rằn; quy trình sinh sản ươn tôm càng xanh…