Hoạt động phát triển dịch vụ thanh tốn thẻ cũng tiềm tàng rất nhiều rủi ro, trong đĩ cĩ sự tham gia của ngân hàng, chủ thẻ, ĐVCNT và các thiết bị đầu cuối (ATM, POS...). Các loại rủi ro thường gặp trong hoạt động phát triển dịch vụ thanh tốn thẻ bao gồm
- Thẻ giả: thẻ thật đã bị thay đổi thơng tin, thẻ chỉ giả mạo thơng tin trên dải băng từ hoặc thẻ bị sao chép làm giả hồn tồn để rút tiền tại máy ATM.
- Dữ liệu băng từ hoặc dữ liệu trên đường truyền bị đánh cắp; Thẻ bị mất/mất trộm ; Chủ thẻ để lộ số PIN.
- Tài khoản của chủ thẻ bị lợi dụng: Sử dụng trong mơi trường thanh tốn khơng phải xuất trình thẻ (thanh tốn qua thư/điện thoại hoặc thương mại điện tử), thay đổi số tiền trên hĩa đơn, đánh cắp tiền trong tài khoản.
- ĐVCNT giả mạo; ĐVCNT thơng đồng với chủ thẻ: đánh cắp dữ liệu thẻ sử dụng vào mục đích bất hợp pháp hoặc thơng đồng với chủ thẻ chấp nhận thanh tốn thẻ giả; Nhân viên ĐVCNT in nhiều hố đơn thanh tốn của một thẻ, nhưng chỉ giao một bộ hố đơn cho chủ thẻ ký thanh tốn. Sau đĩ bộ hố đơn in dư sẽ bị giả mạo chữ ký của khách hàng để yêu cầu ngân hàng thanh tốn chi trả; Các ĐVCNT cĩ tỷ lệ rủi ro cao: Hàng hĩa, dịch vụ cĩ giá trị lớn, cĩ tính chất dễ chuyển đổi sang tiền mặt; ĐVCNT gian lận: Thực hiện giao dịch khơng đúng loại hình giao dịch đã đăng ký, sửa đổi số tiền giao dịch, khơng tuân theo qui định đã thoả thuận. Ngồi các rủi ro chính trên, cịn một số nguy cơ rủi ro khác cĩ thể xuất hiện nếu các ngân hàng khơng chú trọng đúng mức tới việc quản lí hệ thống xử lí dữ liệu và quản trị hệ thống kỹ thuật.