Chương trình 327 đã kết thúc và chương trình trồng mới 5 triệu ha rừng kế tiếp, đồng thời Nhà nước cũng ban hành quyết định 661/TTg. Về mục tiêu, nhiệm vụ, chính sách và tổ chức thực hiện dự án trồng mới 5 triệu ha rừng. Nguyên tắc chỉ đạo là chương trình sẽ được thực hiện thông qua các Dự án có sự tham gia của người dân, nghĩa là nhân dân là lực lượng chủ yếu trồng, bảo vệ, khoanh nuôi tái sinh rừng và được hưởng lợi từ nghề rừng. Năm 1999 là năm bắt đầu thực hiện dự án, với sự chỉ đạo của Chính phủ, sự phối hợp của Bộ Nông nghiệp và PTNT, Bộ Kế hoạch - Đầu tư, Bộ Tài chính và các Bộ ngành có liên quan, đồng thời có sự tham gia của các địa phương, sự quan tâm chỉ đạo của các cấp ủy, sự giám sát của đoàn đại biểu quốc hội và Hội đồng nhân dân các cấp, chương trình này đến này vẫn được triển khai ở địa phương. Nhưng qua các năm thực hiện cho thấy có một số vấn đề cần xem xét:
- Vấn đề quy hoạch đất đai ảnh hưởng rất lớn đến thực thi dự án trồng rừng, nhiều địa phương khó khăn trong việc xác định quỹ đất bởi các vướng mắc: Thiếu số liệu đáng tin cậy về đất trống, đất đai bị xâm canh, thiếu quy hoạch sử dụng đất.
- Tuy đã có chính sách khuyến khích và hưởng lợi trong trồng rừng, nhưng sự tham gia của người dân, cộng đồng còn hạn chế. Trong thực tế đã chứng minh sự thất bại của một số mô hình trồng rừng tập trung của Nhà nước là do sự thiếu tham gia tích cực của người dân sẽ ảnh hưởng đến khả năng thực thi cũng như những hiệu quả về phát triển kinh tế xã hội đặt ra.
- Việc huy động nội lực và tạo ra cơ hội tiếp cận vốn vay ưu đãi cho các hộ nghèo chưa được rộng rãi, người nhận đất chưa có đủ nguồn lực để phát triển trồng rừng chu kỳ dài.
- Yêu cầu bức xúc cần được giải quyết là phải đẩy mạnh quá trình giao đất và cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất.