Quản lý quy trình luôn là điểm mạnh của văn phòng miền Bắc. Tất cả các công việc, các vị trí đều được thực hiện theo một quy trình cụ thể, phù hợp với từng thời điểm. Tổng số quy trình mà Văn phòng miền Bắc hiện đang thực hiện và quản lý là 73 quy trình như Quy trình xử lý giá adhoc, quy trình phục vụ khách hàng, quy trình sửa chữa và bảo dưỡng trang thiết bị, quy trình bán không vận đơn và tiếp nhận hàng hóa… Mỗi quy trình đều có một người phụ trách quản lý, gọi là phụ trách quy
trình hay là chủ quy trình. Những người này thường là cán bộ quản lý, có trách nhiệm và kinh nghiệm nghề nghiệp cao. Các quy trình này luôn được cải tiến, cập nhật thường xuyên để thích ứng với sự thay đổi của thị trường và đảm bảo cung cấp cho khách hàng với dịch vụ tốt nhất, đồng đều nhất.
Làm việc và quản lý bằng quy trình mang lại hiệu quả nhất định cho văn phòng. Tuy nhiên, bên cạnh đó, thực trạng trong quá trình làm việc hiện nay tại VPMB, một số quy trình đã trở nên quá lỗi thời nhưng chưa được sửa đổi, điều chỉnh. Một số quy trình bị trùng lặp, chồng chéo với nhau, gây khó khăn cho cán bộ công nhân viên trong quá trình làm việc và quản lý.
Mặc khác, xử lý công việc theo quy trình nhiều khi gây sự cứng nhắc, mất nhiều thời gian, không đáp ứng được yêu cầu đối với khách hàng. Đặc biệt đối với khách hàng Nhật bản, họ rất ý thức và tiết kiệm thời gian, họ không có nhiều thời gian và không hài lòng khi phải chờ đợi để được phục vụ.