1 17 kỹ thuật giải trình tự vùng gen α globin phát hiện đột biến

Định enotyp và phát hiện đột biến YMDD kháng lamivudine của HBV bằng kỹ thuật giải trình tự vùng gene rt của HBV pot

Ngày tải lên : 01/08/2014, 03:21

... B L180M M204I C 1 2 1 B C 1 1 C 1 1 1 L180M M204V Tổng 1 1 B 2 0 27 2C: Mang ba kiểu gene đột biến V173Lh L180Mh M204Ih đột biến Genotype

7
783
4

Một số phương pháp cụ thể thường được dùng cho kỹ thuật giải trình tự ADN - Phương pháp 1 ppsx

Ngày tải lên : 30/07/2014, 03:20

... ADN dùng cột Qiagene: Các cột Qiagene chuẩn bị dễ dàng nhanh để tinh ADN không cần dùng gradient CsCl ADN chuẩn bị theo phương pháp đạt kết tốt cho việc biến nạp giải trình tự gene Có hai ý quan ... QBT 750mM NaCl,50mM MOPS ,15 % ethanol, pH 7,0, Nhiệt 0 ,15 % Triton X -10 0 phòng độ Đệm QC 1M NaCl, 50mM MOPS, 15 % ethanol, pH 7,0 Nhiệt độ phòng Đệm QF 1, 25M NaCl, 50mM MOPS, 15 % ethanol, pH 8,2 Nhiệt ... loại dịch đệm dùng cho cột Qiagene: Đệm P1 50 mM Tris -HCl, 10 mM EDTA, pH 8.0, Rnase A Bảo quản pha trước dùng đệm P1 nồng độ 10 0 4oC µg/ml Đệm P2 200 mM NaOH ,1% SDS Nhiệt độ phòng Đệm P3 2,55M...

6
543
3

Xác định kiểu gen của HCV bằng kỹ thuật giải trình tự trực tiếp sản phẩm PCR thu nhận được từ thử nghiệm RT real-time PCR dùng mồi và taqman probe đặc hiệu vùng 5’ NC pdf

Ngày tải lên : 01/08/2014, 03:21

... 1( 3), 1a(3), 1b(28), 1a/1b (1) , 2(4), 2a(4), 2c(2), 2a/2c (1) , 6a (11 ) 10 0.000 – 999.999 12 3 (A) 1( 1), 1a(8), 1b(63), 1a/1b (1) , 2 (12 ), 2a(7), 2b (1) , 6a(30) 1. 000.000 – 9.999.999 37 1a (1) , 1b(27), ... Bảng 1: Kết định genotype so với kết định lượng Kết định lượng copies/ml Số mẫu Genotype(số mẫu) 10 0 – 999 1* 1b (1) 1. 000 – 9.999 14 1a (1) , 1b (10 ), 2a (1) , 2a/2c (1) , 6a (1) 10 .000 – 99.999 57 1( 3), ... 1. 000.000 – 9.999.999 37 1a (1) , 1b(27), 2(5), 6a(4) 10 .000.000 – 99.999.999 2** 1( 1), 1b (1) Tổng cộng 234 1( 5), 1a (13 ), 1b (13 0), 1a/1b(2), 2( 21) , 2a (12 ), 2b (1) , 2c(2), 2a/2c(2), 6a(46) * mẫu có kết định...

6
904
9

Kỹ thuật giải trình tự trực tiếp sản phẩm pcr

Ngày tải lên : 16/11/2012, 09:22

... 6a (11 ) 1( 1), 10 0.000 1a(8), 1b(63), – 12 3 1a/1b (1) , 2 (12 ), 2a(7), 999.999 2b (1) , 6a(30) 1. 000.000 – 37 1a (1) , 1b(27), 2(5), 6a(4) 9.999.999 10 .000.000 – 2** 1( 1), 1b (1) 99.999.999 1( 5), 1a (13 ), ... Số Genotype(số mẫu) lượng mẫu copies/ml 1* 10 0 – 999 1. 000 – 1b (1) 1a (1) , 1b (10 ), 2a (1) , 14 9.999 2a/2c (1) , 6a (1) 1( 3), 10 .000 1a(3), 1b(28), – 57 1a/1b (1) , 2(4), 2a(4), 99.999 2c(2), 2a/2c (1) , ... trăm genotype HCV 2000 mẫu huyết thử nghiệm Kết cho thấy có đến 1. 156 (57,8%) mẫu thuộc genotype 1b, 348 (17 ,4%) thuộc genotype 6a, 19 8 (9,9%) genotype 2a, 15 6 (7,8%) genotype 1a, 10 8 (5,4%) genotype...

13
771
0

Giới thiệu kỹ thuật giải trình tự gen và Real - Time PCR pot

Ngày tải lên : 10/03/2014, 22:20

... E +11 = 10 11) Ký hiƯu mÉu Gi¸ trÞ Ct Copies/ml 83 2,0 7,8E +11 * 35 8,2 3,7E +11 13 16 ,1 7,5E+09 10 17 ,9 2,8E+09 14 17 ,4 2,4E+09 18 ,4 7,6E+08 41 20,4 2,7E+08 66 Không xác định 68 Không xác định 11 0 ... CGCTGGTCACAACTTTAAAGCACAGCCAGAGCTGGCTGAAGCGGCTGCTGCAACCACCGA 12 17 FliC - b 11 58: AAAAGGGCATAATTTCCAGAGTGGTGGCGCTTTAAGCGAGGCTGTAACCACTAAAACTGA 12 17 FliC - c 11 76: CGCTGGGCACAACTTCAAAGCACAGCCAGAGCTGGCGGAAGCGGCTGCTACAACCACTGA 12 35 FliC - d 11 91: TGACAAACATAACTTCAGAACAGGCGGTGAGCTTAAAGAGGTTAATACAGATAAGACTGA ... TCGACGGTAAAACCTACAATGCCAGCAAAGC 11 57 FliC - b 10 98: GAATGGTAAAACTGAAGTTGTGACCACCGTTGATGGTAATACTTATCAGGCTAGTGATGT 11 57 FliC - c 11 19: AGACGGTAAAACCGAAGTTGTTACTA - - - TCGACGGTAAAACCTACAATGCCAGCAAAGC 11 75 FliC - d 11 31: AAATGGTAAATCTGAAGTTGTTACTGCTACCGATGGTAAGACTTACTTAGCAAGCGACCT...

9
730
6

Ứng dụng kỹ thuật giải trình tự chuỗi để xác định kiểu gen virus viêm gan B doc

Ngày tải lên : 22/07/2014, 07:21

... Các đột biến virus B Nhiều kiểu đột biến HBV nhận diện Đa số đột biến thầm lặng khơng có ý nghĩa lâm sàng nào, nhiên có số đột biến có ý nghĩa q trình diễn tiến bệnh Đột biến gen S: Một số đột biến ... biến gen S có ý nghĩa đột biến “thốt”, ví dụ đột biến G145A, làm cho việc tiêm ngừa khơng có hiệu bệnh nhân nhiễm bệnh Đột biến vùng trước lõi (Pre-core) Core promoter: Đột biến hay gặp đột biến ... thành vùng đặt tên từ A – G Vì vùng RT đích tác động thuốc Lamivudine nên đột biến vùng trình phát triển tự nhiên siêu vi B tác động thuốc điều trị dẫn tới vấn đề đột biến kháng thuốc Quy trình giải...

6
548
2

XÁC ĐỊNH KIỂU GEN VI RÚT VIÊM GAN B VÀ CÁC ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC BẰNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ CHUỖI docx

Ngày tải lên : 27/07/2014, 10:21

... CẤU TẠO BỘ GEN HBV CẤU TẠO GEN P VÀ VÙNG RT 3, QUI TRÌNH THỰC HIỆN GIẢI TRÌNH TỰ CHUỖI TRÊN HỆ THỐNG SEQUENCING TRUGENE Để thực kỹ thuật giải trình tự chuỗi, phải thực bước sau: (1) Thực PCR; ... Polymerase mutations) đột biến liên quan đến ung thư tế bào gan (X mutants) 1, Đột biến gen S (S mutants): Một số đột biến gen S có ý nghĩa đột biến “thốt”, ví dụ đột biến G145A, làm cho việc tiêm ... tốt 4, Đột biến gen X (HBX): Dữ liệu đột biến vai trò đột biến hạn chế, nhiên kết nghiên cứu bước đầu cho thấy đột biến có liên quan đến ung thư tế bào gan Với việc thực kỹ thuật giải trình tự chuỗi...

22
655
6

ỨNG DỤNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ CHUỖI ĐỂ XÁC ĐỊNH KIỂU GEN VÀ CÁC ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC CỦA SIÊU VI VIÊM GAN B ppt

Ngày tải lên : 27/07/2014, 11:20

... Serine (Đột biến rtM204V/I/S) Những đột biến khác liên quan đến kháng Lamivudine đột biến thay Leucine thành Methionine vùng B (Domain B) đột biến rtL180M; Đột biến V173L; Đột biến V207I Trong 12 2 ... immunoassay) Kỹ thuật dùng để xác định kiểu gen HBV kỹ thuật giải trình tự chuỗi bên cạnh việc xác định kiểu gen HBV chúng tơi tìm đột biến kháng Lamivudine lần thực giải trình tự chuỗi Vai trò kiểu gen ... có đột biến kháng Lamivudine Bảng Tỷ lệ loại đột biến kháng Lamivudine tỉ lệ phần trăm Loại L180M, Số 14 L180M, L180M, M204V M204V & M204V V173L đột biến M204I L180M, M204I M204I, V207I 44 1 15...

19
552
1

Nhân gene và kỹ thuật giải trình tự ADN ppt

Ngày tải lên : 30/07/2014, 03:20

... (19 91) Coxiella burneti Stein an Raoult (19 92) Cryptosporidium parvum Laxer et al (19 91) Cytomegalovirus Gozlan et al (19 91) Dengue virus Henchal et al (19 91) Epstein-barr virus Samoszuk (19 91) ... 000 lần Mặt khác dùng kỹ thuật miễn dịch với kháng thể phải cần tới ngày có đáp ứng miễn dịch máu, với kỹ thuật PCR tồn quy trình phát vài (đối với nguồn ADN hay RNA) Lợi kỹ thuật PCR tận dụng cho ... et al (19 92) (HIV) Claas et al (19 92) Influenza virus Merien et al (19 92) Leptospira spp Niederhauser et al (19 92) Litsteria monocytogenees Robertson et al (19 91) Luteovirus Hackel et al (19 90)...

7
465
1

Một số phương pháp cụ thể thường được dùng cho kỹ thuật giải trình tự ADN - Phương pháp 2 potx

Ngày tải lên : 30/07/2014, 03:20

... khác (vấn đề bàn luận kỹ tài liệu USB sequenase) b Kỹ thuật giải trình tự ADN thiết bị giải trình tự ADN tự động: Hình 1. 12 Thiết bị giải trình tự ADN tự độngg ( 310 0-Avant Genetic Analyzer) Trong ... việc giải trình tự ADN plasmid nên tái tinh với Genee-Clean sắc ký trao đổi ion Hình 1. 11 Tra mẫu thiết bị chạy gel Các phần đề cập đến số vấn đề nảy sinh cách giải tiến hành giải trình tự ADN ... bắt cặp với ADN mồi dùng để giải trình tự Phương pháp giải trình tự ADN với sợi đôi cần lượng ADN mồi cao gấp 10 -20 lần so với sợi đơn Việc giải trình tự gồm hai phản ứng: phản ứng đánh dấu phản...

25
474
0

XÁC ĐỊNH KIỂU GEN VÀ CÁC ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC CỦA SIÊU VI VIÊM GAN B BẰNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ CHUỖI potx

Ngày tải lên : 01/08/2014, 18:21

... Serine (Đột biến rtM204V/I/S) Những đột biến khác liên quan đến kháng Lamivudine đột biến thay Leucine thành Methionine vùng B (Domain B) đột biến rtL180M; Đột biến V173L; Đột biến V207I3,9 ,12 ,19 ,20, 21, 24 ... loại đột biến kháng Lamivudine tỉ lệ phần trăm L L1 L1 L1 oại đột 80M, 80M, biến 80M, M M204V M204V M204V M204I 80M, L1 204I M 204I, M 204V V207I & V173L & V207I S 14 44 1 15 T 11 , 36, 0.8 0,8 12 ... immunoassay) Kỹ thuật dùng để xác định kiểu gen HBV kỹ thuật giải trình tự chuỗi bên cạnh việc xác định kiểu gen HBV chúng tơi tìm đột biến kháng Lamivudine lần thực giải trình tự chuỗi Vai trò kiểu gen...

17
577
3

xây dựng quy trình cải tiến kỹ thuật giải trình tự dna phù hợp việc tiến hành tự động và phân tích bằng phần mềm từ phương pháp sanger kinh điển

Ngày tải lên : 10/10/2014, 01:52

... giải trình tự DNA tự động 33 4.2 Kỹ thuật giải trình tự DNA tự động (Dye termination sequencing) 4.2 .1 Chuẩn bị DNA cần giải trình tự * DNA khn DNA khn để giải trình tự đa dạng, gen tế bào (genomic ... di gel phát kỹ thuật xạ ký tự ghi Hình 8: Xác định trình tự DNA sau đánh dấu mồi dNTP 3.2 Giải trình tự DNA kỹ thuật pyrosequencing 454 Kỹ thuật sáng tạo Pål Nyrén Mostafa Ronaghi Viện Kỹ thuật ... 2.2.3 .1 Các kỹ thuật định tính * Kỹ thuật PCR Kỹ thuật PCR (Polymerase Chain Reaction) kỹ thuật tổng hợp DNA nhờ enzym Polymerase nhà bác học người Mỹ có tên Kary Mulis phát minh năm 19 83 Kỹ thuật...

48
483
0

nhân gene và kỹ thuật giải trình tự adn

Ngày tải lên : 05/12/2014, 08:38

... luận kỹ tài liệu USB sequenase) 28/ 31 Nhân gene kỹ thuật giải trình tự ADN Kỹ thuật giải trình tự ADN thiết bị giải trình tự ADN tự động: Hình 1. 12 Thiết bị giải trình tự ADN tự độngg ( 310 0-Avant ... Microbiology Bảng 1. 7 Một số ví dụ ứng dụng kỹ thuật PCR xác định vi sinh vât 2/ 31 Nhân gene kỹ thuật giải trình tự ADN 3/ 31 Nhân gene kỹ thuật giải trình tự ADN Sau nét chung kỹ thuật PCR: Nguyên ... Weish &McClellADN (19 90) Streptococcus uberis Jayarao &ctv (19 92) 10 / 31 Nhân gene kỹ thuật giải trình tự ADN Hình 1. 9 Minh hoạ kết phân tích sử dụng kỹ thuật RADP Giải trình tự ADN Phương pháp...

31
535
0

xây dựng và ứng dụng kỹ thuật giải trình tự để xác định kiểu gene virút viêm gan siêu vi c

Ngày tải lên : 09/02/2015, 08:58

... 2a/2c (1) , 6a (1) 1a (1) , 1b (10 ), 2a(2), 6a (1) 1( 3), 1a(3), 1b(28), 1a/1b (1) , 2(4), 2a(4), 2c(2), 2a/2c (1) , 6a (11 ) 1a(3), 1b(32), 2a(9), 2c(2), 6a (11 ) 1( 1), 1a(8), 1b(63), 1a/1b (1) , 2 (12 ), 2a(7), 2b (1) , ... 1a(8), 1b(65), 2a (15 ), 2b(5), 6a(30) 1a (1) , 1b(27), 2a(5), 6a(4) 1a (1) , 1b(27), 2a(5), 6a(4) 1( 1), 1b (1) 1b(2) 1( 5), 1a (13 ), 1b (13 0), 1a/1b(2), 2( 21) , 2a (12 ), 2b (1) , 2c(2), 2a/2c(2), 6a(46) 1a (13 ), ... kiểu gene HCV Trugene kết đònh kiểu gene blast search trình tự giải với mồi giải trình tự 292R Mẫu Kiểu gene KQ giải trình tự với mồi 19 2R (Trugene) 2a 2a 1b 1b 1c 6a 6a 1a 2b 10 3a Kieåu gene...

32
429
0

Nghiên cứu giải trình tự vùng gen trong hệ gen ty thể của loài sán lá ruột nhỏ haplorchis taichui phân lập tại việt nam

Ngày tải lên : 16/08/2015, 17:56

... 11 .504 -11 .573 11 .574 -11 .582 11 .583 -11 .648 11 .649 11 .650 -13 .236 13 .237 -13 .247 13 .248 -13 .320 13 .3 21- 13.332 13 .323 -15 .032 15 .033 -15 .034 15 035 -15 093 Gen lồng (2 bp) nad5 15 87 tRNA-Glu 73 Vùng lặp AT 17 10 ... 67 10 .847 -11 .305 11 .306 -11 .372 Vùng giao gen (3 bp) ATG TAG Vùng giao gen (13 bp) Vùng giao gen (7 bp) Vùng giao gen (4 bp) ATG TAG Vùng giao gen (1bp) Vùng giao gen (1 bp) ATG TAG ATG TAG Gen ... TAA Vùng giao gen (25bp) Vùng giao gen (4 bp) Vùng giao gen (1 bp) Vùng giao gen (2 bp) GTG TAG Vùng giao gen (2 bp) Vùng giao gen (4 bp) Gen overlap (4 bp) cox1 15 42 tRNA-Thr 16 S rRNA 61 979 619 9-6263...

74
443
1

Luận văn : PHÂN LẬP VÀ ĐỊNH DANH TÁC NHÂN GÂY BỆNH ĐỐM LÁ CÂY CẢI NGỌT TẠI TP. HCM BẰNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ VÙNG 16S – 23S rDNA part 1 ppt

Ngày tải lên : 28/07/2014, 02:20

... dòng vi khuẩn gây bệnh đốm vùng trồng rau thuộc huyện Củ Chi, Hóc Mơn quận 12 , Tp HCM Sử dụng kỹ thuật PCR khuyếch đại vùng 16 S – 23S rDNA ITS làm vật liệu giải trình tự gen hrpF đặc trƣng vi khuẩn ... nƣớc 12 2.3 Vùng ITS (rDNA intergenic spacer) gen hrpF (hypersensitive reaction and pathogenicity) 13 2.3 .1 Gen hrpF (hypersensitive reaction and pathogenicity) 13 iii 2.3.2 ... (rDNA) 13 VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP TIẾN HÀNH 15 3 .1 Thời gian địa điểm 15 3 .1. 1 Thời gian 15 3 .1. 2 Địa điểm 15 3.2 Vật liệu 15 3.3 Hóa...

18
373
1

PHÂN LẬP VÀ ĐỊNH DANH TÁC NHÂN GÂY BỆNH ĐỐM LÁ CÂY CẢI NGỌT TẠI TP. HCM BẰNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ VÙNG 16S – 23S rDNA docx

Ngày tải lên : 19/03/2014, 18:20

... phản ứng đọc trình tự Sản phẩm PCR Lƣợng 10 0-200 bp 1- 3 ng 200-500 bp 3 -10 ng 500 -10 00 bp 5-20 ng 24 10 00-2000 bp 10 -40 ng 3.5.7.2 Phản ứng đọc trình tự sử dụng BigDye Terminator v3 .1 Cycle Sequencing ... 355 – 3 61 10 John P Curran, 2002 Automated DNA sequencing (ABI PRISM 310 0) Training Manuals/Protocols 11 Klement, Z., 19 82 Hypersensitivity Phytopathogenic Prokaryotes Pages 14 9 – 17 7 12 M S Krause, ... (rDNA) 13 VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP TIẾN HÀNH 15 3 .1 Thời gian địa điểm 15 3 .1. 1 Thời gian 15 3 .1. 2 Địa điểm 15 3.2 Vật liệu 15 3.3 Hóa...

52
608
1

Luận văn : PHÂN LẬP VÀ ĐỊNH DANH TÁC NHÂN GÂY BỆNH ĐỐM LÁ CÂY CẢI NGỌT TẠI TP. HCM BẰNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ VÙNG 16S – 23S rDNA part 3 pdf

Ngày tải lên : 28/07/2014, 02:20

... 355 – 3 61 10 John P Curran, 2002 Automated DNA sequencing (ABI PRISM 310 0) Training Manuals/Protocols 11 Klement, Z., 19 82 Hypersensitivity Phytopathogenic Prokaryotes Pages 14 9 – 17 7 12 M S Krause, ... 4 .10 Kết khuếch đại đoạn DNA vùng hrpF 1: HM1, 2: HM2, 3: CC1, 4: Ladder 1kb, 5: CC2, 6: Q12 – 1, 7: DC Chƣơng KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 5 .1 Kết luận Kết thúc đề tài, chúng tơi thiết lập đƣợc quy trình ... pháp PCR khuếch đại vùng 16 S – 23S rDNA có kích thƣớc 1, 1 kb sử dụng cặp primer Xan1330 Xan322 làm vật liệu giải trình tự Thực phản ứng với thành phần nêu Bảng 3 .1 theo chu trình nhiệt Bảng 3.2...

16
504
0

Luận văn : PHÂN LẬP VÀ ĐỊNH DANH TÁC NHÂN GÂY BỆNH ĐỐM LÁ CÂY CẢI NGỌT TẠI TP. HCM BẰNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ VÙNG 16S – 23S rDNA part 2 doc

Ngày tải lên : 28/07/2014, 02:20

... phản ứng đọc trình tự Sản phẩm PCR Lƣợng 10 0-200 bp 1- 3 ng 200-500 bp 3 -10 ng 500 -10 00 bp 5-20 ng 24 10 00-2000 bp 10 -40 ng 3.5.7.2 Phản ứng đọc trình tự sử dụng BigDye Terminator v3 .1 Cycle Sequencing ... họ thập tự nói chung Việt Nam 2.3 Vùng 16 S – 23S rDNA ITS (rDNA intergenic spacer) gen hrpF (hypersensitive reaction and pathogenicity) 2.3 .1 Gen hrpF (hypersensitive reaction and pathogenicity) ... gốc phát sinh nhƣ quan hệ loài Ngoài ra, vùng ITS đƣợc sử dụng giải trình tự, đối chiếu với liệu ngân hàng gen để định danh sinh vật 15 Chƣơng VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP 3 .1 Thời gian địa điểm 3 .1. 1.Thời...

18
389
0