Cục Hải quan Lào Cai thực hiện quản lý nhà nước về Hải quan đối với hoạt động XNK qua biên giới đường bộ và các khu công nghiệp bao gồm cả địa bàn tỉnh Yên Bái. Lực lượng KTSTQ - Cục Hải quan Lào Cai được thành lập từ tháng 8/2006 với quân số ban đầu gồm 5 công chức, đến ngày 31/12/2013 là 16 người. Hoạt động KTSTQ của Cục Hải quan Lào Cai tập trung trọng tâm kiểm tra hồ sơ đối với các lô hàng luồng xanh tại các Chi Cục Hải quan cửa khẩu để kịp thời phát hiện sai phạm của các doanh nghiệp, đảm bảo 100% các tờ khai đã được thông quan đều được rà soát, đánh giá về mức độ rủi ro.
Để làm tốt công tác này, Cục Hải quan Lào Cai định kỳ tiến hành kiểm tra công tác phúc tập hồ sơ tại các Chi Cục Hải quan cửa khẩu trực thuộc nhằm kịp thời phát hiện và xử lý, chấn chỉnh, khắc phục sai sót trong nội bộ; trên cơ sở đó rà soát, phân loại doanh nghiệp để tiến hành KTSTQ. Các hình thức, thủ đoạn gian lận đã được phát hiện và xử lý trong thời gian vừa qua tại Cục Hải quan Lào Cai phổ biến là: doanh nghiệp mô tả và áp sai mã số, sai thuế suất đối với hàng hoá XNK dẫn đến thiếu số tiền thuế phải nộp; doanh nghiệp khai báo không đầy đủ các khoản chi phí phải cộng trong trị giá tính thuế như: chi phí vận tải, chi phí bốc xếp hàng xuất khẩu… Cục Hải quan Lào Cai thường xuyên phối hợp tốt với các cơ quan liên quan như: Ngân hàng, cơ quan thuế nội địa, công an... để thu thập thông tin doanh nghiệp và phối hợp trong công tác quản lý, kiểm soát hoạt động xuất nhập khẩu của các doanh nghiệp trên địa bàn. Số liệu kết quả hoạt động KTSTQ đạt được trong 5 năm gần đây thể hiện như sau:
Năm Số DN được kiểm tra Số tiền truy thu thuế (đồng) 2009 20 863.960.123 2010 35 2.220.798.000 2011 50 3.122.965.000 2012 56 3.954.145.652 2013 58 4.128.654.000
Nguồn: Chi cục KTSTQ - Cục Hải quan Lào Cai
Kết quả KTSTQ của Cục Hải quan Lào Cai mặc dù chưa cao nhưng đã thể hiện sự nỗ lực cố gắng của hoạt động KTSTQ; một số nguyên nhân dẫn đến hiệu quả hoạt động KTSTQ chưa cao, đó là:
+ Số lượng và chất lượng công chức KTSTQ chưa đáp ứng được yêu cầu (tỷ lệ công chức KTSTQ chỉ đạt hơn 7 % so với tổng quân số toàn Cục; đa số công chức mới tuyển dụng chưa có kinh nghiệm và kỹ năng kiểm tra).
+ Các doanh nghiệp có hoạt động XNK qua địa bàn nhưng chủ yếu có trụ sở nằm ngoài địa bàn (ở các địa phương như Hà Nội, thành phố Hồ Chí Minh, Hải Phòng, Bắc Ninh…) dẫn đến gặp nhiều khó khăn trong việc kiểm tra, cung cấp hồ sơ phục vụ KTSTQ [5].