Phát triển KH&CN được Đảng, Nhà nước coi là khâu quan trọng để đẩy sự phát triển của đất nước. Việc đổi mới, phát triển KH&CN thời gian qua được thể hiện qua nhiều chính sách điều hành ở cả tầm vĩ mơ và vi mô. Tham nhũng trong việc thực hiện các nhiệm vụ KH&CN nảy sinh khi cơ chế quản lý khơng rõ ràng, minh bạch. Có chủ thể tham nhũng ln muốn duy trì sự tồn tại của cơ chế như vậy. Điều đó làm cản trở và đi ngược lại với những nỗ lực đổi mới, phát triển KH&CN ở nước ta là: công bằng, dân chủ, minh bạch…
Ngồi ra, tham nhũng cịn triệt tiêu động lực sáng tạo của các nhà khoa học vốn là tiền đề để phát triển KH&CN. Khi hậu quả của tham nhũng làm cho một đề tài xuất sắc về mặt khoa học không được đánh giá đúng với giá trị của nó hoặc được đánh giá tốt nhưng khơng được cấp kinh phí tương xứng, so với một đề tài khác tuy kém hơn về khoa học nhưng lại được "vận động hành lang" tốt hơn…, thì các nhà khoa học sẽ không muốn làm khoa học nghiêm túc nữa.
Sự cản trở nỗ lực đổi mới và phát triển KH&CN của tham nhũng còn thể hiện ở chỗ làm giảm chất lượng nghiên cứu KH&CN, chậm sự phát triển về chất cũng như lượng của tiềm lực KH&CN, ảnh hưởng đến vị thế của nền KH&CN nước nhà trên trường quốc tế.
Diễn ra ở quy mô và phạm vi không lớn, nhưng tham nhũng trong việc thực hiện các nhiệm vụ KH&CN để lại những hậu quả không nhỏ cho xã hội. Đảng, Nhà nước và Nhân dân đã xác định "cùng với giáo dục, KH&CN là quốc sách hàng đầu", đồng thời tin tưởng và đầu tư lớn cho KH&CN. Nhưng những hành vi tham nhũng đã phần nào làm suy giảm lòng tin của nhân dân đối với định hướng, chính sách phát triển KH&CN nước nhà. Những thiệt hại không chỉ về kinh tế, cản trở nỗ lực đổi mới, làm mất đi cơ hội nghiên cứu và nhu cầu thực tiễn về nghiên cứu KH&CN, ảnh hưởng xấu đến giá trị đạo đức và chuẩn mực xã hội… mà làm giảm lòng tin của nhân dân. Đây là hậu quả
gián tiếp nhưng nghiêm trọng, bởi vì để nhân dân mất niềm tin là mất đi động lực, mất đi mục đích của cách mạng nói chung và sự nghiệp phát triển KH&CN nói riêng.