Trình độ công nghệ thông tin ngày càng cao đồng nghĩa với rủi ro trong hoạt động ngân hàng ngày càng lớn. NHCT cũng đã có nhiều biện pháp hạn chế rủi ro như: NHCT mua và sử dụng các công nghệ bảo mật tốt nhất trên thế giới, các công nghệ đã được kiểm tra, thẩm định bởi các công ty bảo mật uy tín thông qua; đưa ra hướng dẫn các sản phẩm chi tiết; từng bước nâng cao năng lực phát hiện khả năng xâm nhập từ bên ngoài và từ nội bộ. Cho đến nay, chưa có vụ việc nào đáng tiếc xảy ra do rủi ro về công nghệ. Tuy nhiên, trong thời gian tới, chính sách về an toàn thông tin, đặc biệt là việc sử dụng mạng và thiết bị công nghệ thông tin bên trong nội bộ NHCT cần phải được kiểm soát chặt chẽ bởi Trung tâm công nghệ thông tin.
Hiện nay, các chương trình giao dịch trực tuyến vẫn còn xảy ra lỗi mạng làm cho các giao dịch thanh toán của khách hàng không được thực hiện kịp thời và chất lượng dịch vụ giảm sút. Một số giao dịch trực tuyến của khách hàng chưa được tự động xử lý hoặc xử lý theo lô mà phải qua cán bộ kiểm soát và thao tác thủ công, làm phát sinh thêm nhiều chi phí hơn so với giao dịch trực tiếp tại quầy.
Việc triển khai hệ thống core-banking mới trong thời gian sắp tới phải khắc phục những tồn tại của core-banking hiện tại, trong đó đặc biệt là tăng tốc độ xử lý, giảm tải cho hệ thống, tăng cường khả năng xử lý tự động, giảm thao tác thủ công, chuyển đổi toàn vẹn dữ liệu từ hệ thống cũ sang hệ thống mới. Đối với tài khoản thẻ ATM và tài khoản tiền gửi thanh toán đang theo dõi trên hai hệ thống song song, Trung tâm công nghệ thông tin cần nghiên cứu tích hợp làm một để tiện cho công
tác quản lý khách hàng cũng như tiện lợi cho khách hàng quản lý tài khoản của mình và thực hiện các giao dịch qua tài khoản.
Nâng cao chất lượng dịch vụ ngân hàng điện tử trên các phương diện:
Sự tin cậy: Đảm bảo được trang web của ngân hàng luôn hoạt động thông suốt, đem lại cảm giác an tâm, tin tưởng cho khách hàng, đáp ứng được sự tin cậy từ phía khách hàng. Đường truyền phải luôn đảm bảo không để xảy ra tình trạng nghẽn mạch khiến khách hàng không truy cập được, giao dịch online của khách hàng không thực hiện được.
Khả năng đáp ứng: Khi khách hàng có những thắc mắc cần giải đáp, hoặc có sự cố xảy ra cần sự hỗ trợ, ngân hàng nhận được những thông tin khiếu nại từ phía khách hàng cần có thông tin phản hồi. Để làm tốt điều này thì việc cần thiết phải làm là thiết lập những tiêu chuẩn, những tình huống mang tính định lượng. Chẳng hạn như: khi nhận được email yêu cầu hỗ trợ việc sử dụng các dịch vụ điện tử của khách hàng, ngân hàng phải hồi âm trong vòng 12 giờ qua thư điện tử, và trong vòng 24 giờ có tiếp xúc trực tiếp với khách hàng qua điện thoại hoặc văn bản…
Sự thuận tiện: Sự thuận tiện đảm bảo cho việc dễ dàng truy nhập, truy xuất vào tài khoản cá nhân, tốc độ truy cập nhanh, giao diện thân thiện và dễ hiểu, dễ sử dụng. Một số giao diện hiện nay rất phức tạp, chưa thân thiện và chưa thuận tiện cho khách hàng khi sử dụng.
Sự bảo mật: Đây là vấn đề luôn được các ngân hàng ưu tiên đặt lên hàng đầu khi xây dựng hệ thống giao dịch điện tử. Bởi vì công nghệ bảo mật không ngừng được cải tiến và thay đổi liên tục. Trong môi trường kinh doanh đầy biến động, khi nền kinh tế càng phát triển thì việc đánh cắp thông tin, đánh cắp tiền mặt trên mạng, nạn tin tặc… cũng không ngừng phát triển. Chính vì vậy, công nghệ bảo mật cũng phải luôn cải tiến, đổi mới. Hệ thống dịch vụ được phải được thiết kế trên nền tảng công nghệ thông tin hiện đại, bảo mật đảm bảo an toàn tuyệt đối cho các giao dịch trên kênh ngân hàng điện tử. Chính việc xây dựng được công nghệ bảo mật, an toàn
sẽ tạo dựng được lòng tin nơi khách hàng, tạo cho họ sự thoải mái, yên tâm khi giao dịch với ngân hàng.