Agribank hiện được tổ chức hoạt động theo mô hình trong đó NHTM giữ vai trò là mảng hoạt động kinh doanh chính, hoạt động như một công ty mẹ, các hoạt động tài chính và phi tài chính khác có vai trò như các công ty con.(http://agribank.com.vn/101/788/gioi-thieu/bo-may-to-chuc.aspx)
Tính đến ngày 31/12/2016 số lượng cán bộ tại Agribank bao gồm 35.903 người. cơ cấu tổ chức của Agribank gồm có: Hội đồng thành viên, giúp việc cho Hội đồng thành viên gồm có thư ký Hội đồng thành viên, Tổng giám đốc, Ủy ban quản lý rủi ro và Ban Kiểm soát. Tham mưu cho Tổng giám đốc trong hoạt động điều hành gồm có Kế toán trưởng, Phó tổng giám đốc, hệ thống kiểm soát nội bộ, trưởng các phòng Ban và Giám đốc chi nhánh…
Agribank hoạt động theo mô hình tổng công ty, là doanh nghiệp Nhà nước hạng đặc biệt, chịu sự quản lý trực tiếp của Ngân hàng Nhà nước Việt Nam và hệ thống hiện tại bao gồm: 155 chi nhánh loại 1, 787 chi nhánh loại 2, 3 và hệ thống phòng giao dịch trực thuộc trải dài khắp đất nước từ thành thị đến nông thôn, 3 văn phòng đại diện, 1 chi nhánh nước ngoài, 3 đơn vị sự nghiệp, 1 sở giao dịch, 1 sở quản lý kinh doanh vốn và ngoại tệ, 9 công ty con, 4 công ty liên kết.
Biểu đồ 3.2: Mô hình bộ máy tổ chức của Agribank
Với mục tiêu xây dựng nguồn nhân lực có chất lượng cao, Agribank luôn xem việc đào tạo nhân viên là một trong những nhiệm vụ then chốt. Agribank đã thành lập Trung tâm đào tạo đã góp phần cung cấp nguồn nhân lực đáp ứng cho nhu cầu phát triển của Agrbank.
Cùng với chủ trương cải cách hệ thống ngân hàng của nhà nước, Agribank ban đầu hoạt động chủ yếu trong lĩnh vực nông nghiệp, nông thôn. Tuy nhiên, hiện nay Agribank đã mở rộng hoạt động, cung cấp sản phẩm dịch vụ nhằm đáp ứng tất cả yêu cầu của các loại đối tượng khách hàng khác nhau và đã nhanh chóng phát triển hệ thống kênh phân phối nhằm tiếp cận sâu và rộng đến mọi đối tượng khách hàng cũng như liên tục cải tiến hệ thống công nghệ thông tin nhằm phát triển các sản phẩm dịch vụ dựa trên nền tảng công nghệ hiện đại.
CHI NHÁNH LOẠI II (787) PHÒNG GIAO DỊCH PHÒNG GIAO DỊCH
HỆ THỐNG CÁC BAN CHUYÊN MÔN NGHIỆP VỤ TRUNG TÂM TRỰC THUỘC
CHI NHÁNH NƯỚC NGOÀI (1) CHI NHÁNH LOẠI I (155) VĂN PHÒNG ĐẠI DIỆN (3) ĐƠN VỊ
SỰ NGHIỆP (3) CÔNG TY CON (9) TỔNG GIÁM ĐỐC PHÓ TỔNG GIÁM ĐỐC KẾ TOÁN TRƯỞNG ỦY BAN CHÍNH SÁCH ỦY BAN QUẢN LÝ RỦI RO ỦY BAN NHÂN SỰ HỘI ĐỒNG THÀNH VIÊN
BAN KIỂM SOÁT THƯ KÝ