Năm 1993, sau Quyết định số 61/QĐ ngày10-3-1993 Bộ Chớnh trị Minh và Nghị định số 44/CP ngày 22- 6-1993 Chớnh phủ về chức năng, nhiệm vụ và tổ chức bộ mỏy Học viện Chớnh trị quốc gia Hồ Chớ Minh. Học viện Chớnh trị quốc gia Hồ Chớ Minh dưới sự chỉ đạo trực tiếp của Ban chấp hành Trung ương Đảng và Chớnh phủ, nờn cụng tỏc lưu trữ của Học viện cũng thuộc hai hệ thống lưu trữ quản lý: Lưu trữ Đảng và lưu trữ Nhà nước. Hai Cục Lưu trữ này đó làm việc với nhau và đó đi tới thống nhất phõn cụng trỏch nhiệm đối với quản lý cụng tỏc lưu trữ ở Học viện. Ban giỏm đốc Học viện đó xõy dựng được một hệ thống tổ chức cụng tỏc lưu trữ đến cỏc Vụ, Viện được thể hiện ở đội ngũ cỏn bộ, thư ký, tư liệu kiờm chức. Học viện đó tổ chức một mạng lưới văn thư lưu trữ ở cỏc Vụ, Viện và Bộ phận lưu trữ phũng Hành chớnh Văn phũng Học viện trong toàn hệ thống Học viện. Điều này núi lờn sự quan tõm của Ban Giỏm đốc Học viện đến cụng tỏc lưu trữ để tổ chức thực hiện cụng tỏc này. Đõy là cơ sở để thu thập, bổ sung tài liệu quan trọng vào kho lưu trữ của Học viện, cơ sở để lập hồ sơ hiện hành ở cỏc Vụ, Viện hàng năm giao nộp lờn Bộ phận lưu trữ của cơ quan. Nhưng hiện nay cỏc tổ chức
này chưa thực hiện được cỏc chỉ đạo, hướng dẫn của Học viện. Vỡ cũn cú nhiều nguyờn nhõn do ý thức tự giỏc của cỏn bộ và lónh đạo ở cỏc đơn vị của Học viện tuõn thủ chưa nghiờm.
Những hạn chế:
Về tổ chức lưu trữ ở cỏc Vụ, Viện và cỏc đơn vị trong Học viện, cỏch tổ chức này đó dẫn đến tài liệu cũn nằm rải rỏc trong cỏc đơn vị, việc thu thập tài liệu về kho lưu trữ của Học viện hàng năm vỡ thế mà gặp nhiều khú khăn. Bộ phận lưu trữ của Văn phũng Học viện phải đi thu gom, tài liệu rời lẻ, số lượng ít, cú một số đơn vị nộp đầy đủ cỏc hồ sơ cũn lại phần lớn cũn để bú gúi. Do đú bộ phận lưu trữ khi nhận tài liệu của cỏc Vụ, Viện, cỏc đơn vị trong Học viện phải lập hồ sơ từ đầu, rất mất nhiều thời gian và cụng sức.