Hoàn thiện nội dung chính sách thuế, xem xét sửa đổi luật quản lý thuế hiện hành cho phù với những biến động của nền kinh tế thị trường đồng thời tháo gỡ được những khó khăn cho DN. Cụ thể:
- Điều 4 Thông tư 219/2013/TT-BTC có quy định về những đối tượng thuộc đối tượng không chịu thuế, trong đó liên quan đến nguồn nguyên liệu đầu vào của các DN CBTS. Tuy nhiên, Thông tư ban hành ngày 31/12/2013 thì có hiệu lực ngày 01/01/2014, dẫn đến khi thực hiện, nhiều DN đã gặp vướng mắc trong xử lý hóa đơn do vướng thủ tục thuế xuất. Do vậy, kiến nghị Bộ Tài chính nên kéo dãn thời gian chuyển tiếp giữa các Thông tư quy định thay thế để mọi đối tượng nộp thuế đều có thể tiếp cận được những thay đổi mới về chính sách, từ đó có thời gian chuẩn bị để tránh bỡ ngỡ sai sót khi chính sách mới có hiệu lực.
- Đánh giá lại đầy đủ các yếu tố của thực tế sản xuất ngành nông lâm thủy sản hiện nay để có quy định rõ ràng về định nghĩa "sơ chế", tránh ảnh hưởng tác động
tiêu cực đến nhiều DN. Thông qua đó kiến nghị Bộ Tài chính xem xét lại quy định trên để tháo gỡ vướng mắc cho DN.
- Thuế xuất thuế GTGT quy định không rõ ràng, cùng một loại hàng hóa có nhiều quy định về thuế xuất khác nhau, dẫn đến cách hiểu và áp dụng khác nhau không thống nhất tại các địa phương. Như Khoản 5 Điều 5, Khoản 5 Điều 10 và Khoản 7 Điều 10 cùng quy định về thuế xuất sản phẩm thủy sản chưa qua sơ chế nhưng mỗi điều quy định thuế xuất khác nhau (vừa 5% vừa 10%). Về vấn đề này kiến nghị Bộ Tài chính xem xét thống nhất lại mức thuế xuất nhằm đơn giản dễ áp dụng cho CQT và DN.
- Về thủ tục hoàn thuế GTGT phải kèm báo cáo tồn kho, kiến nghị bỏ quy định phân bổ hàng tồn kho tại Khoản 4, Điều 18, Thông tư 219 nhằm tăng tính khả thi thủ tục hoàn thuế GTGT cho DN xuất khẩu thủy sản, phù hợp với quy định tại Điều 10, 12 của Luật thuế GTGT.
- Kiến nghị Bộ Tài chính xem xét và chỉ đạo tháo gỡ để hỗ trợ DN nói chung và DN CBTS nói riêng được thực hiện đúng theo Thông tư số 30/2013/TT-BTC ngày 18/3/2013 về việc hướng dẫn hoàn lại tiền thuế bảo vệ môi trường đối với túi ni lông làm bao bì đóng gói sẵn hàng hóa; nhằm giúp DN tháo gỡ được vấn đề tồn đọng vốn.
- Kiến nghị Bộ Tài chính đề xuất với Chính phủ mở rộng quyền hạn điều tra cho CQT để hạn chế bớt việc phụ thuộc vào các cơ quan pháp luật khi điều tra các vi phạm pháp luật về thuế.