Thứ nhất, do sự cạnh tranh gay gắt trong kinh doanh
Trong cơ chế thị trường đòi hỏi tính năng động sáng tạo với sự sự cạnh tranh cao, chi nhánh cần đa dạng hóa các hoạt động kinh doanh để tồn tại. Mặt khác một số công ty đứng ra tự giao nhận nên mở rộng thị trường là điều hết sức khó khăn. Sự mất cân đối trong cung và cầu của lĩnh vực đại lý giao nhận vận tải, số lượng các
công ty giao nhận thì lớn, trong khi đó số lượng mặt hàng giao nhận thì hạn chế. Do vậy, chi nhánh muốn tăng thị phần chiếm lĩnh thị trường là rất khó khăn
Thứ hai, do ảnh hưởng của cuộc khủng hoảng toàn cầu
Sự kiện quốc tế ảnh hưởng đến hoạt động của chi nhánh phải kể đến là cuộc khủng hoảng kinh tế thế giới năm 2008,những bất ổn trên thị trường tài chính một số nước khu vực EU, tình trạng chiến tranh ở một số quốc gia. Nó tác động mạnh theo chiều hướng xấu tới công tác kinh doanh của chi nhánh đặc biệt là việc mở rộng thị trường, cung cấp các hoạt động dịch vụ.
Thứ ba, do cơ chế quản lý của Nhà nước
Một chính sách của Nhà nước còn thiếu chất nhất quán, cụ thể là hệ thống thuế, chính sách hải quan còn rườm ra, phức tạp, các khâu không liên kết chặt chẽ với nhau. Làm thủ tục giao nhận tại các cửa khẩu tuy đã được giảm bớt nhưng vẫn còn mất nhiều thời gian, chi phí giao nhận cao. Do đó, khách hàng Việt Nam thường để công ty nước ngoài ủy thác giao nhận những lô hàng nhập khẩu của mình dù giá cao hơn.
Mặt khác hiện nay, nhà nước chưa có một hệ thống luật thống nhất hoàn thiện riêng cho ngành giao nhận. Bởi vậy, thực tế có nhiều tiêu cực tồn tại do tình trạng tranh giành khách hàng, hoặc không cạnh tranh lành mạnh giữa các tổ chức kinh doanh dịch vụ quốc tế lũng đoạn thị trường. Các tổ chức nước ngoài lợi dụng sơ hở luật pháp Việt Nam, những chính sách bảo hiểm ngoại thương của Việt Nam tuy đã được sửa đổi nhưng chưa sát thực. Nên hệ số an toàn của khách hàng thấp, gây khó khăn cho toàn ngành nói chung và cho Công ty Cổ phần giao nhận vận tải Con Ong - chi nhánh Hà Nội nói riêng. Bởi vậy, việc khắc phục những khó khăn này đòi hỏi Nhà nước cần có sự quan tâm và quản lý chặt chẽ hơn so với ngành kinh doanh dịch giao nhận vận tải, nhằm tạo điều kiện cho ngành phát triển hơn nữa đóng góp vào sự phát triển chung của nền kinh tế xã hội.