Luật Kiểm toỏn nhà nước được Quốc hội khoỏ XI thụng qua ngày 14/6/2005 và cú hiệu lực thi hành từ ngày 01/01/2006. Mặc dự, Luật Kiểm toỏn nhà nước khụng quy định cụ thể về thanh tra, kiểm tra nội bộ của Kiểm toỏn Nhà nước, song đó cú những quy định làm cơ sở phỏp lý để tiến hành hoạt động thanh tra, kiểm tra nội bộ như: trỏch nhiệm tăng cường kỷ luật, kỷ cương trong hoạt động kiểm toỏn nhà nước, xử lý vi phạm, giải quyết khiếu nại, tố cỏo về
kiểm toỏn nhà nước…
Cụ thể hoỏ Luật Kiểm toỏn nhà nước, Nghị quyết số 916/2005/NQ- UBTVQH11 ngày 15/9/2005 của Uỷ ban Thường vụ Quốc hội về cơ cấu, tổ
chức của Kiểm toỏn Nhà nước đó quyết định cơ cấu tổ chức Kiểm toỏn Nhà nước gồm cỏc vụ và cỏc đơn vị tương đương cấp vụ, trong đú Vụ Phỏp chế là
đơn vị tham mưu thuộc bộ mỏy điều hành và Tổng Kiểm toỏn Nhà nước quy
định cụ thể chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của từng đơn vị. Ngày 02 thỏng 8 năm 2006, Tổng Kiểm toỏn Nhà nước cú Quyết định số
594/QĐ-KTNN quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và tổ chức của Vụ
Phỏp chế. Theo quyết định này, chức năng của Vụ Phỏp chếđược quy định:“Vụ Phỏp chế là đơn vị trực thuộc Kiểm toỏn Nhà nước cú chức năng tham mưu giỳp Tổng Kiểm toỏn Nhà nước về cụng tỏc quản lý nhà nước bằng phỏp luật trong tổ chức và hoạt động của Kiểm toỏn Nhà nước: tổ chức thực hiện cụng tỏc xõy dựng phỏp luật; thẩm định, rà soỏt, hệ thống hoỏ văn bản quy phạm phỏp luật; phổ biến, giỏo dục phỏp luật và kiểm tra việc thực hiện cỏc văn bản quy phạm phỏp luật về kiểm toỏn nhà nước; thực hiện cụng tỏc thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cỏo trong phạm vi quản lý của Kiểm toỏn Nhà nước theo quy định của phỏp luật”.
Kiểm toỏn Nhà nước giao cho Vụ Phỏp chế. Tuy nhiờn, theo quy định tại khoản 6 Điều 18 Luật Kiểm toỏn nhà nước thỡ Tổng Kiểm toỏn Nhà nước cú thể trỡnh Uỷ ban Thường vụ Quốc hội để thành lập một đơn vị cấp vụ thực hiện chức năng thanh tra, kiểm tra trong phạm vi toàn ngành.