Không chỉ quy định việc bồi thường đối với hộ gia đình, cá nhân, pháp luật đất đai hiện hành còn quy định cụ thể việc bồi thường, hỗ trợ đối với đất nông nghiệp, đất phi nông nghiệp của tổ chức khi Nhà nước thu hồi đất; cụ thể:
a) Tổ chức đang SDĐ nông nghiệp, đất phi nông nghiệp được Nhà nước giao đã nộp tiền SDĐ hoặc nhận chuyển nhượng từ người SDĐ hợp pháp, mà tiền SDĐ đã nộp, tiền trả cho việc nhận chuyển nhượng quyền SDĐ khơng có nguồn gốc từ ngân sách Nhà nước thì được bồi thường khi Nhà nước thu hồi đất;
b) Tổ chức được Nhà nước cho thuê đất hoặc giao đất không phải nộp tiền SDĐ hoặc đã nộp tiền SDĐ bằng tiền có nguồn gốc từ ngân sách Nhà nước thì khơng được bồi thường về đất khi Nhà nước thu hồi đất; nếu tiền chi phí đầu tư vào đất cịn lại khơng có nguồn gốc từ ngân sách Nhà nước thì tiền chi phí đầu tư này được bồi thường;
c) Cơ sở của tổ chức tôn giáo đang SDĐ ổn định, nếu là đất được Nhà nước giao khơng thu tiền SDĐ hoặc th đất thì khơng được bồi thường, nhưng được bồi thường chi phí đầu tư vào đất cịn lại;
d) Tổ chức bị thu hồi đất mà không được bồi thường theo quy định tại điểm (b) nói trên, nếu phải di dời đến cơ sở mới thì được hỗ trợ bằng tiền theo dự án đầu tư được cấp có thẩm quyền phê duyệt; mức hỗ trợ tối đa không quá mức bồi thường đất bị thu hồi do tổ chức, cá nhân được Nhà nước giao đất, cho thuê đất chi trả.