Việt Nam sẽ cam kết lấy thuế quan làm cụng cụ bảo hộ chớnh, đưa ra một lộ trỡnh cắt giảm dần hàng rào thuế quan, tạo điều kiện thuận lợi cho thương mại. Việc xõy dựng lộ trỡnh cắt giảm thuế quan sẽ dựa trờn cơ sở:
Xỏc định rừ những mặt hàng cần bảo hộ để cú những biện phỏp, chớnh sỏch về thuế và phi thuế quan cho thớch hợp, giỳp cho cỏc ngành sản xuất những mặt hàng đú cú đủ thời gian chuẩn bị lực lượng để vươn lờn cạnh tranh bỡnh đẳng. Những mặt hàng cũn lại chỉ dựng biện phỏp thuế với thuế suất giảm dần.
Những mặt hàng cần được bảo hộ sẽ được phõn định thành những danh mục khỏc nhau cú mức thuế tương ứng, thời hạn cắt giảm thuế thớch hợp với từng loại theo hướng những mặt hàng cần bảo hộ cao sẽ cú mức thuế cao, thời gian bảo hộ dài và ngược lại.
Căn cứ vào việc phõn loại hàng hoỏ núi trờn, Việt Nam sẽ cam kết mức thuế trần để định giới hạn từ đú giảm dần, phự hợp với trỡnh độ phỏt triển và nhu cầu của nền kinh tế.
Hệ thống thuế hiện tại sẽ được phõn thành ba loại: Loại thuế phổ thụng, Loại thuế Đói ngộ Tối huệ quốc (MFN), Loại thuế ưu đói riờng dành cho cỏc khu vực kinh tế mà Việt Nam tham gia là thành viờn, ỏp dụng trờn cơ sở cú đi cú lại và là cụng cụ để đàm phỏn với cỏc nước nhằm mở cửa thị trường.
Về cụ thể cần phải điều chỉnh thuế nhập khẩu, theo hướng giảm bớt mức thuế và giảm dần thuế suất. Hiện nay, thuế suất của Việt Nam cũn dàn trải quỏ rộng. Về mặt kinh tế, thuế suất dàn trải là cú hại, thậm chớ cú hại hơn thuế suất cao mà thống nhất, vỡ chỳng cú thể đưa cỏc nguồn lực vào những hoạt động khụng hiệu quả. Về mức thuế chỉ nờn ỏp dụng 5-6 mức: 0%, 5%, 10%, 20% và 30%. Thuế suất cao nhất đỏnh vào hàng nhập khẩu chỉ nờn là 50%. Bộ Tài chớnh đó và đang điều chỉnh thuế nhập khẩu bằng cỏch một mặt giảm thuế suất đối với một số mặt hàng cú thuế suất cao và quỏ cao (trờn 50%), mặt khỏc nõng mức thuế suất cỏc mặt hàng cú thuế suất dưới 5%.
Theo luật thuế hiện hành thỡ cỏc hàng hoỏ nhập khẩu vào Việt Nam sau đõy được miễn thuế: 1) Hàng hoỏ của cỏc doanh nghiệp cú vốn đầu tư nước ngoài nhập vào Việt Nam để tạo tài sản cố định hoặc mở rộng quy mụ dự ỏn; 2) Hàng viện trợ khụng hoàn lại, tạm nhập tỏi xuất, tạm xuất tỏi nhập để dự hội trợ triển lóm, hàng trả nợ nước ngoài của chớnh phủ, hàng nhập khẩu chuyờn dựng cho an ninh, quốc phũng, nghiờn cứu khoa học, giỏo dục và đào tạo, hàng xuất nhập của cỏc doanh nghiệp cú vốn đầu tư nước ngoài, hàng gia cụng xuất khẩu, hàng là quà biếu.
Việc quy định miễn, giảm thuế là cần thiết nhưng như vậy là ỏp dụng cho quỏ nhiều đối tượng, cơ chế ỏp dụng chưa thống nhất và bỡnh đẳng. Do vậy, nờn quy định là: 1) Hàng gia cụng xuất khẩu, hàng tạm nhập tỏi xuất và nguyờn vật liệu để làm hàng xuất khẩu phải nộp thuế nhập khẩu như bỡnh thường, khi xuất khẩu sẽ được hoàn thuế; 2) Việc miễn thuế cho hàng gia cụng cần ỏp dụng cho mọi đối tượng hàng gia cụng; 3) Hàng hoỏ nhập khẩu theo cỏc dự ỏn đầu tư nước ngoài cho hưởng ưu đói theo chế độ MFN. Cỏc dạng miễn, giảm theo Luật Đầu tư nước ngoài trỏi với nguyờn tắc phải được loại bỏ vỡ nú khụng phự hợp với thụng lệ quốc tế.