Ty thể là một bào quan quan trọng trong tế bào Eukaryote có khả năng phân chia, có ADN và bộ máy tổng hợp protein riêng. Chúng phân chia tạo thành một số l−ợng ty thể thích hợp cho tế bàọ ADN trong ty thể có dạng vòng kép, ít hơn 20000nu ở động vật có vú. Trong ty thể, cả hai sợi ADN đ−ợc phiên mã hoàn toàn thành các sản phẩm đơn dàị Các phân tử polymerase di chuyển theo hai h−ớng đối diện khi tổng hợp và luôn luôn theo h−ớng 5’-3’. Sản phẩm phiên mã đơn sơ cấp sau đó đ−ợc chế biến, theo ph−ơng thức mà hiện nay ch−a đ−ợc biết đến, thành các mARN, rARN, tARN. Hệ thống phiên mã ở ty thể có sự trộn lẫn giữa prokaryote và eukaryotẹ Ví dụ ở ty thể động vật có vú, mARN đ−ợc polyadenine hoá (đặc tính của Eukaryote) nh−ng không đ−ợc gắn mũ (đặc tính cuae prokaryote) và không có intron.
Sự chế biến ARN tiền thân có một vai trò quan trọng trong hai hệ thống ty thể đ−ợc nghiên cứu chi tiết là ng−ời và nấm men. ở tế bào ng−ời, cả hai sợi ADN ty thể đ−ợc phiên mã ở cùng tỉ lệ từ một promotor đơn trên mỗi sợi tạo ra hai phân tử ARN khổng lồ, mỗi phân tử chứa đầy đủ chiều dài bản sao của một sợi ADN. Sự phiên mã vì thế mà hoàn toàn đối xứng. Sản phẩm phiên mã tạo ra trên một sợi đ−ợc gọi là sợi nặng (sợi H) bởi khi chế biến bằng nuclease thì tạo ra hai rARN, hầu hết tARN và khoảng 10 ARN chứa poly (A). Còn sợi nhẹ khi đ−ợc chế biến thì tạo ra 8 tARN và một ARN nhỏ chứa poly(A). Sự duy trì 90% sản phẩm này d−ờng nh− không chứa thông tin hữu dụng và bị phân huỷ. ARN chứa poly(A) đ−ợc xem là mARN ty thể, chúng thiếu cấu trúc mũ ở đầu 5’ và mang đuôi poly(A) với khoảng 55nu ở đầu 3’. Đuôi này thêm vào sau phiên mã nhờ enzyme poly(A) polymerase ti thể. Không nh− ở Ng−ời, một số gen ty thể ở nấm men chứa intron, phải đ−ợc loại đi bởi sự ghép nối ARN. Tuy
nhiên, không có sự phiên mã đối xứng ở nấm men: tất cả các gen nh−ng mỗi gen đ−ợc phiên mã từ cùng một sợi ADN, với các promotor tách biệt cho một vài gen.
Sự khám phá ra các intron ở ADN ty thể của nấm men (và cũng ở một ít gen lạp thể) đ−a ra giả thuyết về sự nội cộng sinh của nguồn gốc ty thể, trong khi intron không đ−ợc tìm thấy ở hệ gen vi khuẩn. Thêm vào đó các intron th−ờng có mặt trong một gen ty thể ở một chủng của nấm men nh−ng lại vắng mặt ở chính gen đó ở chủng nấm men khác. Việc tìm thấy intron trong ADN của một số bào quan năng l−ợng biểu hiện các dấu vết của các yếu tố nhảỵ Tuy nhiên nguồn gốc của các gen tách ra ở ADN bào quan và ảnh h−ởng của nó tới sinh vật là ch−a rõ ràng. Có rất ít sự phân biệt trong tổng hợp ARN ở lạp thể với tổng hợp ARN ở Ẹ coli. Nh− mARN vi khuẩn, mARN lạp thể không chứa cấu trúc mũ hoặc đuôi poly (A) nh− ở hầu hết mARN eukaryotẹ Bên cạnh đó hầu nh− không có sự chế biến ARN.