Trường trung cấp Kinh tế Hà Nội được giao quyền tự chủ, tự chịu trách nhiệm về tài chính và phân loại là đơn vị sự nghiệp tự đảm bảo một phần chi phí hoạt động thường xuyên theo Quyết định số 675/QĐ-SGDĐT ngày 05/03/2007 của Sở Giáo dục và Đào tạo. Nhà trường áp dụng cơ chế tự chủ, tự chịu trách nhiệm về tài chính theo hướng dẫn của Nghị định số 43/2006/NĐ-CP
Năm đầu tiên thời kỳ ổn định phân loại đơn vị sự nghiệp, đối với nguồn kinh phí NSNN cấp, và nguồn thu phí lệ phí, căn cứ vào chức năng nhiệm vụ được giao, chế độ chi tiêu tài chính hiện hành, kết quả hoạt động sự nghiệp, đối tượng thu, mức thu, tình hình thu tài chính của năm trước liền kề, tổ chức bộ máy, cơ sở vật chất, năng lực của trường để lập dự toán thu, chi năm kế hoạch gửi Sở Giáo dục và Đào tạo (Sở Tài chính) theo quy định. Dự toán thu, chi của đơn vị phải có thuyết minh cơ sở tính toán, chi tiết theo nội dung. Trong quá trình thực hiện, đơn vị được điều chỉnh dự toán thu, chi hoạt động sự nghiệp, kinh phí hoạt động thường xuyên đã được giao cho phù hợp với tình hình thực tế của đơn vị, gửi Sở Giáo dục và Đào tạo.
Hai năm tiếp theo trong thời kỳ ổn định: Căn cứ quy định của Nhà nước, trường lập dự toán thu, chi của năm kế hoạch. Trong đó kinh phí NSNN bảo đảm hoạt động thường xuyên theo mức kinh phí NSNN bảo đảm hoạt động thường xuyên của năm trước liền kề, cộng (+) hoặc trừ (-) kinh phí của nhiệm vụ tăng hoặc giảm của năm kế hoạch do cơ quan có thẩm quyền quyết định.
Căn cứ vào dự toán NSNN được Sở Tài chính phân bổ, dự toán ban đầu của trường lập và các bản đề nghị điều chỉnh dự toán của trường, SởTài chính xem xét, trình Sở Giáo dục và Đào tạo giao dự toán thu, chi NSNN.
-Dự toán thu, chi hoạt động thường xuyên:
+ Giao dự toán thu: i)Tổng số thu phí, lệ phí (Học phí; Phí, lệ phí; Thu sự nghiệp khác), ii) Số phí, lệ phí được để lại đơn vị sử dụng theo quy định
của cơ quan nhà nước có thẩm quyền đối với từng loại phí, lệ phí.
+ Giao dự toán chi: i) Giao dự toán chi từ nguồn thu phí, lệ phí được để lại sử dụng theo quy định của cơ quan nhà nước có thẩm quyền đối với từng loại phí, lệ phí, ii) Giao dự toán chi hoạt động thường xuyên từ nguồn kinh phí NSNN cấp.
-Đối với hoạt động không thường xuyên, Sở Giáo dục và Đào tạo giao dự toán cho trường thực hiện theo quy định hiện hành.
Sau khi có quyết định giao dự toán của trường, đơn vị gửi Kho bạc nhà nước nơi giao dịch để theo dõi, quản lý, thực hiện thu, chi và kiểm soát chi qua Kho bạc nhà nước.