Thể chế quản lý viên chức khoa học bao gồm hệ thống các văn bản quy phạm pháp luật do cơ quan nhà nước có thẩm quyền ban hành nhằm thống nhất các nội dung quản lý viên chức khoa học, công nghệ - đó là biểu hiện về mặt hình thức của thể chế quản lý viên chức khoa học, công nghệ.
Có nhiều cách thức thể hiện khác nhau các quy định của pháp luật về quản lý viên chức khoa học, công nghệ, nhưng phổ biến nhất hiện nay là các quy định có tính nguyên tắc, quy định khung về quản lý viên chức khoa học, công nghệ sẽ được định ra trong nội dung của các văn bản quy phạm pháp luật như Luật viên chức, Luật Khoa học, công nghệ. Các quy định cụ thể được quy định trong những văn bản có hiệu lực pháp lý thấp hơn để quy định chi tiết, hướng dẫn thi hành luật về các nội dung quản lý viên chức. Có thể một hoặc một nhóm các nội dung của quản lý viên chức khoa học, công nghệ được quy định riêng trong một văn bản quy phạm pháp luật như Nghị định số 29/2012/NĐ-CP ngày 12/4/2012 của Chính phủ quy định về việc tuyển dụng, sử dụng và quản lý viên chức, trong đó quy định và hướng dẫn chi tiết về quyền và nghĩa vụ; tuyển dụng và sử dụng; bổ nhiệm, thay đổi chức danh nghề nghiệp, thay đổi vị trí việc làm; đánh giá, khen thưởng, kỷ luật; đào tạo, bồi dưỡng; chế độ chính sách; lập quản lý hồ sơ, thực hiện chế độ báo cáo về quản lý viên chức khoa học, công nghệ ...
Trong quá trình triển khai thực hiện các văn bản quy phạm pháp luật về quản lý viên chức khoa học, công nghệ, theo thẩm quyền của mình, các cơ quan, bộ, ban, ngành... cũng cụ thể hóa thành các văn bản hướng dẫn thực hiện hoặc có những quy định chi tiết, phù hợp hơn với đặc điểm, tình hình của từng cơ quan. Từ đó tạo thành hệ thống các văn bản quản lý viên chức khoa học, công nghệ - biểu hiện hình thức của thể chế quản lý viên chức khoa học, công nghệ.