Quản lý kê khai thuế, nộp thuế là một khâu quan trọng, giúp CQT thu thập, cập nhật thông tin, xây dựng cơ sở dữ liệu của các doanh nghiệp, phục vụ cho các công việc như: Tổng hợp, phân tích, đánh giá tình hình thu NSNN, công tác lập và thực hiện dự toán thu, phân tích mức độ rủi ro để phục vụ công tác thanh tra, kiểm tra, nâng cao hiệu quả của công tác quản lý thuế.
Với vai trò quan trọng nêu trên và thực hiện công tác cải cách thủ tục hành chính, giảm thời gian cho doanh nghiệp trong việc khai, nộp thuế, ngành thuế đã xây dựng hệ thống khai, nộp thuế điện tử hỗ trợ doanh nghiệp có thể nộp tờ khai thuế điện tử, nộp thuế điện tử qua hệ thống kết nối internet mà không cần đến nộp trực tiếp tại CQT, tiết kiệm thời gian cho người nộp thuế. Đến hết năm 2019, hệ thống khai thuế điện tử đã được triển khai tại 63/63 tỉnh, thành phố và 100% Chi cục Thuế trực thuộc, đã có 99,86% trên tổng số doanh nghiệp đang hoạt động trên cả nước sử dụng kê khai thuế qua mạng; 99,49% doanh nghiệp đã đăng ký tham gia sử dụng dịch vụ nộp thuế điện tử với cơ quan thuế. Cơ bản các thủ tục hành chính thuế đã thực hiện qua phương thức điện tử, trong năm 2019 số lượng hồ sơ khai thuế điện tử đã tiếp nhận khoảng 12 triệu hồ sơ.
Đồng thời, cơ quan thuế đã xây dựng Ứng dụng Quản lý thuế tập trung (TMS) với khả năng tích hợp nhiều nguồn dữ liệu về đăng ký, kê khai, nộp thuế,… Thông tin trên tờ khai thuế của doanh nghiệp sẽ được cập nhập vào hệ thống ứng dụng trên của cơ quan thuế. Hệ thống của cơ quan thuế sẽ tự động phân loại tờ khai đúng hạn, tờ khai nộp chậm quá thời hạn quy định và doanh nghiệp không nộp tờ khai thuế. Ứng dụng Quản lý thuế tập trung cho phép CQT thực hiện các công việc quan trọng trong QLT như: xử lý tờ khai thuế, nhập số thuế phải nộp của NNT vào hệ thống, theo dõi tình hình thu nộp thuế, xử lý chứng từ nộp thuế, in các báo cáo thuế theo yêu cầu quản lý về số thuế phải nộp, số thuế đã nộp, số thuế đã hoàn ... Thông tin khai thác từ Ứng dụng Quản lý thuế là tài liệu quan trọng cho việc điều hành công tác QLT của từng CQT cũng như toàn ngành thuế để thực hiện công tác lập dự toán thu, công tác thanh tra, kiểm tra thuế.
Tuy nhiên, đối với khai thuế TNDN từ hoạt động khai thác dầu khí, phù hợp với quy định tại Luật Dầu khí và thực tế hiện nay các HĐDK hầu hết được ký kết dưới hình thức hợp đồng phân chia sản phẩm, mức thuế suất thuế TNDN và tỷ lệ chi phí thu hồi đối với khai thác dầu thô, khí thiên nhiên theo thỏa thuận tại mỗi hợp đồng. Do đó, nội dung hướng dẫn về cách xác định nghĩa vụ thuế TNDN phải nộp, thời hạn nộp hồ sơ khai thuế, thời hạn nộp thuế vào NSNN và các mẫu biểu, tờ khai thuế từ khai thác dầu khí được nghiên cứu và quy định riêng tại Thông tư số 36/2016/TT-BTC của Bộ Tài chính về nghĩa vụ thuế đối với hoạt động tìm kiếm, thăm dò khai thác dầu khí tại Việt Nam. Thuế TNDN tạm tính được khai theo từng lần xuất bán đối với dầu thô và khai theo tháng đối với khí thiên nhiên, cuối năm, nhà thầu thực hiện quyết toán thuế TNDN đối với từng loại sản phẩm.
Với việc các mẫu biểu tờ khai được thiết kế riêng, cùng với việc phạm vi tác động chỉ gồm 21 HĐDK đang vận hành thương mại (không mang tính rộng khắp trên toàn quốc như các sắc thuế khác, các loại hình doanh nghiệp khác) nhưng số thu ngân sách từ dầu khí có vai trò quan trọng trong tổng số thu ngân sách nên công tác kê khai, nộp thuế TNDN đối với khai thác dầu khí đã được quan tâm phân tích để thiết kế phân hệ riêng hỗ trợ các nhà thầu dầu khí có thể kê khai và nộp tờ khai thuế qua mạng. Các phân hệ này được tích hợp trong ứng dụng CNTT chung của ngành đã hỗ trợ thực hiện tự động hóa trong khai, nộp thuế đối với NNT.
Các Cục Thuế địa phương phối hợp cùng Tổng cục Thuế (Vụ DNL, Vụ Kê khai) đã tổ chức thực hiện đúng quy trình kê khai thuế, tăng cường đôn đốc nộp tờ khai; thực hiện kiểm tra, kiểm soát việc khai thuế của người nộp thuế, phát hiện sớm các trường hợp kê khai không đúng, không đủ, không kịp thời số thuế phải nộp để có biện pháp xử lý; triển khai thực hiện ứng dụng kê khai mã vạch hai chiều, hỗ trợ người nộp thuế kê khai và ứng dụng kê khai qua mạng Internet. Qua đó, kết quả công tác quản lý kê khai thuế TNDN đối với hoạt động khai thác dầu khí từ năm 2015 – 2019 như sau:
Bảng 3.9. Kết quả quản lý kê khai thuế TNDN dầu khí giai đoạn 2015 - 2019 Năm Tổng số tờ khai phải nộp Số tờ khai đã nộp Tỷ lệ tờ khai thuế đã nộp/Tổng số tờ khai phải nộp (%) Tỷ lệ tờ khai thuế nộp đúng hạn/Tổng số tờ khai đã nộp (%) Tỷ lệ tờ khai có lỗi/Tổng số tờ khai đã nộp (%) Tỷ lệ tờ khai nộp điện tử/Tổng số tờ khai đã nộp (%) Nộp đúng thời hạn Nộp quá thời hạn 2015 474 466 8 100 98.3 12.5 95 2016 455 449 6 100 98.7 12 95.2 2017 621 614 7 100 98.9 11.3 96 2018 779 773 6 100 99.2 10.5 96.5 2019 854 850 4 100 99.5 10.2 96.2
[Nguồn: Tác giả tổng hợp tờ khai từ Hệ thống Quản lý thuế tập trung của cơ quan thuế]
Thực tế qua các năm 2015-2019, Nhà thầu dầu khí là các doanh nghiệp có quy mô lớn, ý thức tuân thủ pháp luật thuế cao, theo đó, các nhà thầu dầu khí cơ bản đều thực hiện khai thuế tương đối tốt. 100% nhà thầu đã nộp đủ số tờ khai thuế TNDN theo quy định, tỷ lệ tờ khai nộp đúng hạn cao. Có thể thấy mức độ tuân thủ về thời gian nộp tờ khai thuế của nhà thầu dầu khí là khá tốt thông qua các tỷ lệ tờ khai đã nộp so với tổng số tờ khai phải nộp, tỷ lệ tờ khai nộp đúng hạn so với tổng số tờ khai đã nộp. Tuy nhiên, tỷ lệ tờ khai nộp điện tử so với tổng số tờ khai đã nộp vẫn chưa đạt 100%, trong đó số tờ khai có lỗi vẫn bình quân khoảng 11%.
Việc phát sinh một số tờ khai bị quá hạn là do theo thỏa thuận tại các HĐDK thì có hợp đồng quy định nhà điều hành sẽ kê khai nộp thuế thay cho nhà thầu, có hợp đồng quy định nhà điều hành khai thuế và từng nhà thầu sẽ thực hiện nộp thuế. Theo đó phát sinh một số trường hợp nhà thầu tự bán phần sản phẩm của mình và nhà điều hành kê khai thuế, nhà thầu chậm chuyển chứng từ tập hợp chi phí, số liệu xuất bán cho nhà điều hành dẫn đến việc nộp tờ khai bị quá hạn. Tuy nhiên, đối với việc nộp thuế, khi nhận được tiền bán dầu sau 30 ngày kể từ ngày xuất bán, nhà thầu căn cứ theo tỷ lệ thuế tạm tính đã đăng ký với cơ quan thuế để nộp tiền vào NSNN, do đó không phát sinh nộp chậm tiền thuế do kê khai thuế chậm.
Về tính thuế, theo quy định tại Thông tư số 36/2016/TT-BTC thì căn cứ tỷ lệ thu hồi chi phí và sản lượng dầu thô, khí thiên nhiên dự kiến khai thác năm tiếp theo, NNT tự xác định ra tỷ lệ thuế tài nguyên tạm tính, tỷ lệ thuế xuất khẩu tạm tính, tỷ lệ thuế thu nhập doanh nghiệp tạm tính trên cơ sở mức thuế suất theo thỏa thuận tại HĐDK và thông báo cho cơ quan thuế địa phương nơi đăng ký thuế biết chậm nhất là ngày 01 tháng 12 của kỳ tính thuế năm trước, theo mẫu Báo cáo dự kiến sản lượng dầu khí khai thác và tỷ lệ tạm nộp thuế số 01/BCTL-DK. Theo đó, các nhà thầu đều thực hiện tính thuế theo đúng tỷ lệ tạm tính đã đăng ký với cơ quan thuế. Cuối năm, trên cơ sở sản lượng dầu khí thực khai thác và xuất bán, nhà thầu thực hiện quyết toán thuế theo tờ khai mẫu số 02/TNDN – DK.