Tỉnh Quảng Ninh đã phê duyệt Quy hoạch ngành thuỷ sản đến năm 2015, tầm nhìn đến năm 2020 và phê duyệt quy hoạch nuôi trồng thủy sản nước mặn nước lợ đến năm 2015, tầm nhìn đến 2020; Phê duyệt Đề án phát triển giống thuỷ sản đến năm 2020; Đồng thời đang chỉ đạo các địa phương tập trung triển khai các quy hoạch nuôi
trồng thủy sản cấp huyện, đến nay Khu kinh tế Vân Đồn đã được phê duyệt, các địa phương Thành phố Móng Cái, huyện Đầm Hà, huyện Hải Hà đang triển khai thực hiện.
Tuy nhiên, hiện nay Quảng Ninh chưa có quy hoạch riêng cho phát triển nuôi TCT. Đặc biệt là việc quy hoạch chi tiết cho từng vùng nuôi còn nhiều bất cập. Các địa phương thiếu kiên quyết trong việc quản lý quy hoạch nuôi trồng thủy sản. Từ đó dẫn đến việc tự phát xây dựng ao đầm để nuôi trồng thuỷ sản của nông ngư dân, dẫn đến các vùng nuôi trồng thuỷ sản bị phân tán không tập trung, cơ sở hạ tầng không đồng bộ vì vậy không đáp ứng để áp dụng công nghệ nuôi tiên tiến, hệ thống cấp thoát nước ở các vùng nuôi không hoàn chỉnh dẫn đến phát sinh dịch bệnh.
Chất lượng của các bản quy hoạch có nhiều hạn chế, thiếu tính cập nhật các quy hoạch hiện hành, thiếu tầm nhìn chiến lược phát triển ngành… Do vậy, nhiều quy hoạch mới xây dựng xong đã trở lên lạc hậu (quy hoạch 14 vùng nuôi trồng thủy sản tập trung thì có đến 5 dự án phải điều chỉnh quy hoạch theo hướng giảm diện tích để phục vụ mục đích khác; 4 dự án đã triển khai hoặc chưa triển khai nhưng không tiếp tục triển khai do chuyển toàn bộ diện tích sang mục đích sử dụng khác).
Việc quản lý đầu tư theo quy hoạch các dự án của các tổ chức cá nhân thuê đất nuôi trồng thủy sản cũng không chặt chẽ, chậm thu hồi những dự án đã giao đất không triển khai đầu tư dẫn đến tình trạng người muốn Nuôi trồng thủy sản không có đất, người có đất nuôi trồng lại để bỏ hoang.