Thứ nhất, hệ thống văn bản hướng dẫn thực hiện Luật BHYT và các văn bản liên quan đến thực hiện chính sách BHYT chưa đồng bộ, hoàn thiện
- Chưa quy định chế tài xử phạt đối với người có trách nhiệm tham gia BHYT; - Chưa có kế hoạch tổng thể thực hiện BHYT toàn dân
- Chưa có hướng dẫn cụ thể trong việc thực hiện BHYT cho nhóm người nghèo, cận nghèo, trẻ em dưới 6 tuổi, HSSV và các đối tượng chính sách xã hội khác dẫn đến việc phân định trách nhiệm chưa rõ ràng trong việc xác định đối tượng, lập danh sách, dự trù kinh phí đóng, hỗ trợ đóng BHYT cho các nhóm đối tượng.
- Văn bản hướng dẫn về hệ thống tổ chức y tế thiếu nhất quán, tổ chức hệ thống y tế không ổn định.
- Văn bản quy định về giá DVYT chậm được sửa đổi, bổ sung theo hướng tính đúng, tính đủ.
- Quy định phân tuyến chuyên môn kỹ thuật, phân hạng bệnh viện chưa nhất quán.
Thứ hai, về công tác quản lý nhà nước về BHYT
- Chức năng nhiệm vụ của các Bộ, ngành chưa rõ ràng, còn chồng chéo, thiếu sự phối hợp, chỉ đạo, điều hành
- Đa số các Sở Y tế chưa có bộ phận chuyên trách tham mưu trong quản lý nhà nước về BHYT, chủ yếu là kiêm nhiệm, nhiều vướng mắc, vấn đề phát sinh trong thực
tế (tuyên truyền, mở rộng đối tượng, tổ chức KCB cho người có thẻ BHYT) chưa được điều chỉnh, giải quyết kịp thời.
- Chưa có quy định cụ thể chức năng tham mưu trong quản lý nhà nước về BHYT của Phòng Y tế.
Thứ ba, về hệ thống tổ chức thực hiện
- Tính không chuyên nghiệp của tổ chức thực hiện chính sách BHYT: Quỹ BHYT, quỹ hưu trí một số quỹ BHXH khác được quản lý trong một tổ chức chung (BHXH Việt Nam), làm mất đi tính chuyên nghiệp, khả năng điều hành và tác nghiệp cần có trong công tác quản lý một quỹ rất đặc thù.
- Mô hình hiện nay khó khuyến khích vai trò chủ động tích cực của các cơ quan trong việc mở rộng đối tượng BHYT, tăng cường hiệu quả hoạt động của quỹ BHYT; vai trò của chính quyền trong quá trình thực hiện, triển khai chính sách BHYT khó được thể hiện rõ.
-Không có cán bộ chuyên trách BHYT cấp xã (nơi giải quyết hầu hết các vướng mắc về BHYT của người dân) thì khó có thể thực hiện BHYT toàn dân.