Tranh chấp về vấn đề hàng hóa không phù hợp với hợp đồng là vấn đề khá phức tạp. Qua phân tích trên đây có thể thấy nhiều khác nhau trong quy định giữa LTM 2005 và LTM 1997 về vấn đề hàng hóa không phù hợp với hợp đồng. Trong khi LTM 1997 đặt nặng trách nhiệm về giao hàng phù hợp với hợp đồng hoàn toàn cho bên bán thì LTM 2005 đã cho thấy sự linh hoạt hơn khi san sẻ trách nhiệm này cho cả bên bán và bên mua tùy vào từng trường hợp cụ thể. Ngoài ra LTM 2005 cũng đã thể hiện được tính mở hơn khi tôn trọng thỏa thuận giữa các bên trong HĐMBHHQT, chỉ trong trường hợp nếu không có thỏa thuận trước thì khi đó mới áp dụng luật để quy định. Việc nắm vững và vận dụng những vấn đề này có ý nghĩa rất quan trọng, giúp các bên hạn chế và giải quyết tranh chấp có liên quan và giúp cho các cơ quan tài phán có thể xác định quyền và nghĩa vụ pháp lý tương ứng của các bên khi có tranh chấp xảy ra. Thực tế cho thấy các tranh chấp liên quan đến vấn đề này là không hề đơn giản, và việc xét xử không chỉ cần phải dựa vào các quy định của pháp luật mà còn cả sự linh hoạt, công tâm của các cơ quan tài phán trong từng tình huống cụ thể. Các tranh chấp cụ thể liên quan đến các vấn đề chính là căn cứ xác định hàng hóa không phù hợp với hợp đồng, trách nhiệm của bên bán đối với hàng hóa không phù hợp với hợp đồng và quyền của bên mua trong trường hợp người bán giao hàng không phù hợp với hợp đồng. Từ các vụ án đã phân tích, có thể
thấy cơ quan tài phán đã vận dụng tương đối tốt quy định của pháp luật thương mại về vấn đề hàng hóa không phù hợp với hợp đồng.