Cùng với vai trò tích cực trên, FDI cũng mang lại mặt trái đối với nước nhận đầu tư. Một số nghiên cứu đã chỉ ra những mặt tiêu cực của FDI như tài nguyên thiên nhiên bị khai thác quá mức, môi trường ô nhiễm… Một số mặt trái chủ yếu là:
Đầu tư trực tiếp nước ngoài gây ra thua thiệt cho nước nhận đầu tư: Hoạt động đầu tư đang diễn ra trong nền kinh tế thị trường cạnh tranh. Các nhà đầu tư nước ngoài ra có nhiều kinh nghiệm trong thực hiện kinh doanh có bên tiếp nhận đầu tư thường thiếu kinh nghiệm, vừa làm vừa học, đặc biệt là thiếu kinh nghiệm trong đàm phán ký kết hợp đồng công trình lớn. Do còn hạn chế này, các nhà đầu tư nước ngoài có thể lợi dụng việc đàm phán, yêu cầu nhiều ưu đãi và các điều kiện công bằng để làm thế nào họ có thể sinh lợi được nhiều nhất. Ngoài ra, nước tiếp nhận đầu tư còn có thể bị "chảy máu chất xám". Việc đào tạo người lao động trong doanh nghiệp nước ngoài không đáp ứng yêu cầu của nước chủ nhà, do nhà đầu tư chuyển giao công nghệ muốn giữ độc quyền công nghệ mới, hoặc chỉ đào tạo công
nhân làm các công việc bộ phận để giảm chi phí đào tạo. Ngoài ra, trong khoảng thời gian ngắn hạn, khi Chính phủ các nước sở tại chưa kịp thay đổi chính sách về mức thu nhập cho lao động của khu vực Chính phủ (thông thường thấp hơn so với các khu vực có vốn FDI, thì người lao động trong khu vực nhà nước sẽ rời doanh nghiệp nhà nước, gia nhập khu vực vốn đầu tư nước ngoài.
Chuyển giao công nghệ: Phần lớn các nhà đầu tư nước ngoài rất hạn chế chuyển giao những công nghệ tiên tiến, vì họ sợ lộ bí mật, mất bản quyền công nghệ. Nhiều nhà đầu tư thường chuyển giao từng phần và thông thường là công nghệ lạc hậu. Nói cách khác, họ mang vào nước nhận đầu tư những công nghệ cũ, công nghệ không phù hợp với điều kiện của các nước đang phát triển, kém sức cạnh tranh, năng suất thấp làm cho chi phí cao và gây ô nhiễm môi trường. Nếu không thận trọng, các nước này có thể trở thành bãi thải công nghiệp của các nước phát triển.
Mất đi nhiều việc làm truyền thống và chưa coi trọng đúng mức về đào tạo cho người lao động. Các nhà đầu tư nước ngoài đã tao ra nhiều công ăn việc làm cho nước nhận đầu tư, nhất là các nước đang phát triển như nước Lào, nơi mà dân số trẻ, lực lượng lao động dồi dào thì việc tạo cho người lao động một nơi làm việc có thu nhập ổn định là vô cùng tốt. Trên thực tế, trong nhiều năm qua khu vực FDI đã tạo ra nhiều triệu lao động trực tiếp và gián tiếp. Tuy nhiên bên cạnh đó đã làm mất đi nhiều việc làm trong các lĩnh vực truyền thống. Với mục tiêu là tối đa hoá lợi nhuận và giảm thiểu những chi phí, các nhà đầu tư nước ngoài còn thiên về khai thác và sử dụng những nguồn lao động có nhân công rẻ, ít qua đào tạo, mang tính thời vụ mà ít chú trọng đến việc đào tạo và sử dụng nhân lực có tay nghề cao và làm việc lâu dài cho các nhà đầu tư.
Ảnh hưởng đối với môi trường tự nhiên và khai thác lãng phí tài nguyên:
Gây ô nhiễm môi trường, có thể nói một trong những tác động tiêu cực nhất của khu vực FDI đối với nước nhận đầu tư là ảnh hưởng đến môi trường. Đặc biệt là tình hình "xuất khẩu" ô nhiễm từ các nước phát triển sang các nước đang phát triển thông qua FDI ngày càng gia tăng. Các nước đang phát triển có nguy cơ trở thành những nước có mức "nhập khẩu" ô nhiễm cao, nhiều nhất là Trung quốc, Ấn Độ, Việt Nam… Ví dụ: Hiện nay vấn đề xử lý nước thải ở Việt Nam chưa được chú
trọng, hầu hết các nhà đầu tư nước ngoài chưa quan tâm đúng mức đến hệ thống xử lý chất thải. Các chương trình giám sát, xử phạt vẫn chưa được thực hiện một cách toàn diện trong khi ngày càng có nhiều các dự án khai thác tài nguyên, vận chuyển dầu với hiểm hoạ tràn dầu có nguy cơ gia tăng trong các năm tới. Nhiều dự án nước ngoài đã gây ô nhiễm môi trường do công nghệ lạc hậu, chạy theo lợi nhuận, tiết kiệm chi phí, không tính đến khâu xử lý nước thải đã gây ô nhiễm môi trường nghiêm trọng.
Đầu tư trực tiếp nước ngoài gây ra vấn đề ô nhiễm môi trường: Trong việc chuyển giao công nghệ từ các nước công nghiệp sang các nước đang phát triển cũng đồng thời là quá trình chuyển dịch những ngành nghề và thiết bị lỗi thời, ô nhiễm môi trường. Trong khi luật bảo vệ môi trường ở các nước phát triển công nghiệp ngày càng chặt chẽ, đòi hỏi về tiêu chuẩn an toàn và chi phí dành cho bảo vệ môi trường cao, thì khi đưa sang các nước đang phát triển, thiết bị lạc hậu lại không được xử lý để bảo vệ môi trường tương ứng và chặt chẽ, gây ra tình trạng ô nhiễm môi trường sinh tái, làm phát sinh các khoản chi phí lớn để xử lý và điều chỉnh trong tương lai. Hội nghị thế giới 1992 ở Riodejanerro (Baraxin) đã quyết định yêu cầu các nước phát triển phải có trách nhiệm dành 0.7% của tổng sản phẩm quốc gia (GNP) hàng năm để giải quyết vấn đề môi trường, thực hiện chuyển giao công nghệ sạch, tiêu tốn ít năng lượng nguyên liệu cho các nước đang phát triển, nhưng trên thực tế chỉ mới đạt được 0.3% GNP. Các nước phát triển chiếm 25% dân số, tiêu thụ 75% tổng năng lượng, 80% tổng số nguyên liệu.
Tác hại đến môi trường sinh thái càng tăng lên khi chủ đầu tư không áp dụng các biện pháp xử lý chất thải, còn nước chủ nhà lại thiếu biện pháp quản lý,kiểm soát. Tài nguyên cạn kiệt, tác hại môi trường sinh thái cũng ngày càng tăng, các nhà quản lý các nước đang phát triển càng trở nên nhức nhối khi quá trình đô thị hoá nhanh chóng với một lượng lớn rác thải sinh hoạt, rác thải công nghiệp, khôi bụi, tiếng ồn do phương tiện giao thông đông đúc thải loại vào không khí những chất độc hại.
Do các dự án đầu tư tập trung vào các khu đô thị, khu dân cư một cách nhanh chóng, gây nên tình trạng quá tải, do tốc độ xây dựng kết cấu hạ tầng đô thị không
theo kịp. Nạn ách tắc giao thông trở nên thường xuyên hơn, gây nhiều thiệt hại cho nền kinh tế nói chung và các tác hại đến sức khoẻ của con người do ô nhiễm môi trường nói riêng.
Trên đây là những tác động mặt trái có thể có của FDI. Nêu lên những hạn chế của vốn FDI không có nghĩa là phủ nhận tác dụng của nó, mà chỉ cần lưu ý rằng làm thế nào để giảm thiểu những tác hại gián tiếp tiềm tàng mà quá trình thu hút và sử dụng vốn FDI mang lại. Những bất lợi của vốn FDI gây ảnh hưởng như thế nào là còn phụ thuộc vào yếu tố chủ quan của nước nhận đầu tư (quan điểm, nhận thức, chiến lược, thể chế, chính sách, công tác quản lý Nhà nước đối với việc chuyển giao công nghệ). Nếu có sự chuẩn bị có thể hạn chế, giảm thiểu những tác động tiêu cực, bất lợi, áp dụng mặt tích cực của nó tạo lợi ích tổng thể cho tiến trình phát triển kinh tế xã hội của đất nước đúng theo mục tiêu và định hướng của mình.
Đối với nước đầu tư, đầu tư ra nước ngoài mang lại cho họ nhiều lợi ích và ảnh hưởng tiêu cực sau:
Đầu tư ra nước ngoài giúp mở rộng thị trường tiêu thụ sản phẩm, tăng cường bành trướng sức mạnh kinh tế và vai trò ảnh hưởng trên thế giới. Phần lớn các doanh nghiệp có vốn FDI ở các nước là chi nhánh của công ty mẹ ở chính quốc. Việc xây dựng các nhà máy sản xuất, chế tạo hoặc lắp ráp ở nước nhận đầu tư sẽ mở rộng thị trường tiêu thụ sản phẩm, phụ tùng của công ty mẹ ở nước ngoài. Đồng thời, còn là biện pháp thâm nhập thị trường. Đặc biệt là thị trường tiêu thụ, sản phẩm của nước lớn vì phần lớn nước nhận đầu tư được ưu đãi về xuất khẩu hàng hoá với mức thuế thấp hoặc miễn thuế.
Đầu tư nước ngoài đem lại lợi nhuận cao hơn ở trong nước, là yếu tố quan trọng nhất đối với việc đầu tư ra nước ngoài. Dù đầu tư ra nước ngoài làm ảnh hưởng tương đối đến nhu cầu lao động ở trong nước, hay năng suất giảm nhưng việc đầu tư ra nước ngoài kích thích xuất khẩu trực tiếp máy móc thiết bị, đặc biệt là khi đầu tư vào các nước đang phát triển. Chẳng hạn, công ty mẹ cung cấp cho các công ty con ở nước ngoài máy móc thiết bị, linh kiện và nguyên liệu. Nếu công ty mẹ của nước chủ đầu tư muốn chiếm lĩnh thị trường, thì đầu tư ra nước ngoài tác động vào việc xuất khẩu linh kiện tương quan, các sản phẩm tương quan để tăng
kim ngạch xuất khẩu. Trong trường hợp, điều kiện nhập khẩu ngang nhau, họ có thể giảm được giá thành so với nhập từ nước khác. Nếu sử dụng nguồn lao động rẻ từ