Cơ cấu bộ mỏy quản lý của Cụng ty được tổ chức bao gồm cỏc phũng ban và đơn vị trực thuộc cú mối quan hệ hữu cơ được chuyờn mụn hoỏ, cú phõn cấp trỏch nhiệm quyền hạn nhằm đảm bảo chức năng quản lý và điều hành sản xuất một cỏch cú hiệu quả, tiết kiệm. Cụng ty đó xõy dựng và ban hành bộ quy chế quản lý bao gồm 14 quy chế ỏp dụng riờng cho từng lĩnh vực quản lý và hoạt động của cụng ty.
Mụ hỡnh cơ cấu tổ chức của Cụng ty TNHH Song Việt là mụ hỡnh tổ chức trực tuyến chức năng. Đõy là mụ hỡnh thường được ỏp dụng cho cỏc doanh nghiệp xõy dựng nói chung. Mụ hỡnh này đảm bảo được quyền lực của người lónh đạo và sử dụng được cỏc chuyờn gia trong từng lĩnh vực như: Kỹ thuật, kế hoạch, tài chớnh - kế toỏn, mỏy múc thiết bị, vật tư…. Với mụ hỡnh này sẽ đảm bảo tớnh thống nhất từ trờn xuống. Bờn cạnh đú, trong tổ chức quản lý của cụng ty vẫn cũn tồn tại những điểm cần phải khắc phục.
Vớ dụ cụng tỏc điều độ sản xuất được giao cho Phũng quản lý dự ỏn thực hiện nhưng việc lập kế hoạch lại do Phũng kinh tế kế hoạch thực hiện. Nh vậy phải đũi hỏi sự phối hợp nhõn lực của hai phũng mới thực hiện được một cụng việc lập, theo dừi, và bỏo cỏo kết quả sản xuất hàng thỏng của cụng ty. Phũng kinh tế kế hoạch lập kế hoạch sản xuất nhưng khụng trực tiếp theo dừi, đụn đốc, phối hợp cỏc đơn vị thực hiện nờn khụng nắm chắc cỏc nguồn lực và điều kiện thi cụng
ở cụng trường bằng cỏn bộ điều độ nờn chất lượng kế hoạch sản xuất lập ra khụng cao. Kế hoạch sản xuất là căn cứ để lập ra cỏc kế hoạc về vật tư, thiết bị, nhõn lực, tài chớnh...nờn nếu kế hoạch sản xuất cú chất lượng thấp thỡ sẽ dẫn đến hiệu quả sản xuất kinh doanh kộm.
Vớ dụ thứ 2 là cụng tỏc quản lý chi phớ đầu vào nằm ở quỏ nhiều bộ phận, khụng cú bộ phận nào cú trỏch nhiệm tổng hợp trong qỳa trỡnh sản xuất để cú đề xuất điều chỉnh. Phũng kinh tế kế hoạch quản lý thầu phụ, phũng vật tư quản lý chi phớ về vật tư, phũng mỏy thiết bị quản lý về chi phớ mỏy, phũng quản lý dự ỏn quản lý chi phớ nhõn cụng và chi phớ chung của cỏc cụng trỡnh. Phũng tài chớnh kế toỏn là đơn vị cú chức năng tập hợp giỏ thành nhưng thường chỉ cú kết quả sau khi đơn vị đó chi và cụng trỡnh đó hoàn thành nờn khụng cú tỏc dụng quản trị cao. Bộ mỏy quản lý tại cụng trường khụng được ưu tiờn về số lượng và chất lượng. Cụng trường là nơi phỏt sinh chi phớ chủ yếu của cụng ty nờn nếu bộ mỏy quản lý tại đõy yếu thỡ dễ dẫn đến khụng thực hiện được kế hoạch về giỏ thành sản phẩm.