Dịch vụ giao nhận kho vận được đánh giá là ngành tạo ra giá trị gia tăng cao đồng thời đóng vai trò quan trọng trong việc hỗ trợ các dịch vụ logistics khác. Tuy nhiên, cũng như bao công ty cung ứng dịch vụ logistics khác trong nước thì lĩnh vực dịch vụ giao nhận kho vận của Công ty Cổ phần Vận tải đa phương thức vẫn còn ở giai đoạn sơ khai, yếu kém và chưa phát triển cả về chất lẫn về lượng.
Mặc dù nằm trong số những doanh nghiệp hàng đầu trong ngành giao nhận kho vận trên cả nước, có mặt bằng kho bãi xấp xỉ 50.000m2, nhưng vẫn chưa thể đáp ứng nổi nhu cầu và yêu cầu của khách hàng vì kho chưa đủ tiêu chuẩn chất lượng. Cơ sở vật chất chưa được đầu tư nên còn rất sơ sài do đó không đảm bảo an toàn cho hàng hoá, nhiều nơi còn dễ bị ngập nước khi gặp tình trạng mưa lớn kéo dài, dẫn đến tình trạng mất cắp, hư hỏng.
Từ đó có thể nói năng lực cung cấp dịch vụ kho bãi của công ty dù là rất lớn nhưng vẫn không hoạt động kinh doanh có hiệu quả và chưa phù hợp với yêu cầu của khách hàng. Do đó, các khách hàng sử dụng dịch vụ thường đổ về những địa chỉ có hệ thống kho được đầu tư tốt.
Tuy nhiên chi phí đầu tư xây dựng kho bãi đạt chuẩn là rất lớn, ước tính đầu tư xây dựng 1.000 m2 kho phải mất đến 1 tỉ đồng, nếu tính cả tiền thuê đất chi phí sẽ lớn hơn rất nhiều. Nhất là những vị trí thuận lợi để làm kho thì chi phí thuê đất càng là gánh nặng mà công ty khó có thể kham nổi nếu theo đuổi đến cùng dịch vụ này.
Hơn nữa, Cơ chế chính sách phát triển kinh tế của Nhà nước nhiều năm nay mới chỉ tập trung ưu đãi cho sản xuất, mà chưa quan tâm đáng kể đến phát triển dịch vụ mặc dù đây là mảng mang lại hiệu quả lớn cho nền kinh tế. Vốn đầu tư đòi hỏi rất lớn nhưng nhìn chung các dịch vụ trong lĩnh vực giao nhận kho vận không thuộc diện được ưu tiên vay vốn như những ngành sản xuất.
Do vậy, cũng có thể hiểu vì sao dịch vụ kho vận của công ty đến nay vẫn chưa thực sự phát huy được hiệu quả mà đáng lẽ nếu đầu tư sẽ đạt được kết quả tốt hơn.
Trong tương lại, Với việc liên doanh liên kết với Các hãng vận tải nước ngoài vào lĩnh vực giao nhận kho vận thì công ty sẽ nâng cao năng lực dịch vụ này đồng thời tiếp nhận công nghệ quản lý giao nhận kho vận hiện đại của thế giới để phục vụ cho các dịch vụ logistics chiến lược của công ty.