Được thành lập theo Quyết định số 127/1998/QĐ-TTg ngày 11/07/1998 của Thủ Tướng Chính phủ và chính thức đi vào hoạt động ngày 28/07/2000 tại Thành phố Hồ Chí Minh, với tên gọi ban đầu là Trung tâm giao dịch chứng khoán TPHCM-HSTC, là đơn vị trực thuộc Ủy ban chứng khốn nhà nước, có chức năng quản lý hệ thống giao dịch chứng khoán niêm yết của Việt Nam. Sự ra đời của HSTC là tất yếu khách quan, là sản phẩm của quá trình chuyển đổi cơ cấu nền kinh tế vận hành theo cơ chế thị trường, có ý nghĩa to lớn trong việc tạo ra kênh huy động vốn mới phục vụ cho nhu cầu phát triển của nền kinh tế trong công cuộc cơng nghiệp hóa, hiện đại hóa.
Ngày giao dịch đầu tiên của HSTC, có hai cơng ty được niêm yết đó là CTCP Cơ điện lạnh và CTCP Cáp và Vật liệu viễn thơng với mã chứng khốn tương ứng là REE và SAM. Cho đến cuối năm 2000, khối lượng giao dịch chỉ đạt ở mức 3,641 triệu cổ phiếu với giá trị giao dịch là 90,215 tỷ đồng. HSTC cũng là một thể chế chính thức mà thơng qua đó, các trái phiếu Chính phủ mới được phát hành. Trung tâm này cịn đóng vai trị là thị trường thứ cấp cho một số trái phiếu phát hành hiện hữu.
Chứng khoán niêm yết tại HSTC bằng đồng Việt Nam, mệnh giá đối với mỗi CP niêm yết là 10.000 đồng, mỗi trái phiếu niêm yết là 100.000 đồng. Cơ chế giao dịch tại HSTC là một hệ thống đặt-khớp lệnh tự động. Chỉ số giá cổ phiếu tại Trung tâm này được gọi là VN-Index. Giá chứng khoán giao dịch hiện nay bị giới hạn biên độ thay đổi hàng ngày là +/- 2% so với giá đóng cửa ngày hơm trước.
Sau 7 năm hoạt động, HSTC đã đạt được nhiều thành tựu đáng khích lệ: số lượng tổ chức đăng ký niêm yết CP ngày càng nhiều, sự tham gia của các nhà đầu tư trong và ngoài nước liên tục tăng, các tổ chức trung gian ra đời và phát triển đã góp phần cho hoạt động của HSTC ngày càng sôi động hơn. Với kết quả đạt được, ngày 08/08/2007, HSTC được chuyển thành SGDCK TPHCM-HOSE theo Quyết định số 599/2007/QĐ-TTg ngày 11/05/2007 của Thủ tướng Chính phủ.