Bộ máy quản lý của Trung tâm KTVC gồm có: 01 Giám đốc, 02 Phó giám đốc, Kế toán trưởng và bộ máy giúp việc.
1. Giám đốc Trung tâm do Tổng Công ty bổ nhiệm, miễn nhiệm, khen thưởng, kỷ luật theo đề nghị của Giám đốc Bưu điện thành phố Hà Nội. Giám đốc là đại diện pháp nhân của đơn vị, chịu trách nhiệm trước Bưu điện Tp. Hà Nội và trước pháp luật về quản lý, điều hành hoạt động của đơn vị trong phạm vi, quyền hạn và nghĩa vụ theo quy định.
2. Phó Giám đốc là người giúp việc Giám đốc quản lý, điều hành một hoặc một số lĩnh vực hoạt động của Trung tâm theo sự phân công của Giám đốc, chịu trách nhiệm trước Giám đốc và Pháp luật về nhiệm vụ được phân công.
3. Kế toán trƣởng là người giúp Giám đốc chỉ đạo, tổ chức thực hiện công tác kế toán, thống kê của đơn vị, có các quyền hạn và nghĩa vụ theo quy định của Pháp luật.
4. Bộ máy giúp việc gồm có:
- Khối các phòng chức năng:
+ Phòng hành chính quản trị: Giúp Giám đốc Trung tâm quản lý điều hành mọi mặt hoạt động về công tác hành chính quản trị tại Trung tâm.
+ Phòng Kế hoạch Đầu tư: Tham mưu, giúp Giám đốc quản lý, điều hành và thừa lệnh Giám đốc điều hành các công tác: tổ chức xây dựng và triển khai thực hiện kế hoạch, định mức kinh tế kỹ thuật, giám sát, đánh giá các dự án đầu tư trong phạm vi được giao, cân đối các nguồn vốn phục vụ cho mục tiêu đầu tư phát triển của Trung tâm, quản lý hoạt động của các đơn vị trực thuộc Trung tâm trên lĩnh vực kế hoạch sản xuất kinh doanh.
+ Phòng Kế toán thống kê tài chính: Tham mưu, giúp Giám đốc quản lý điều hành toàn bộ công tác kế toán, thống kê, tài chính trong Trung tâm.
+ Phòng Tiếp thị bán hàng: Tham mưu, giúp Giám đốc và thừa hành Giám đốc điều hành các vấn đề về hoạt động marketing: nghiên cứu thị trường sản phẩm, dịch vụ, giá cước, kênh bán hàng, xúc tiến hỗn hợp và chăm sóc khách hàng đối với các dịch vụ Bưu chính và các sản phẩm khác của Tổng Công ty Bưu chính Việt Nam trong phạm vi hoạt động sản xuất kinh doanh của Trung tâm.