Hoạt động liên ngân hàng bao gồm các hoạt động cho vay, gửi tiền tại các NHTM khác (bên tài sản có), hoặc đi vay, nhận gửi tiền từ các NHTM
khác (bên tài sản nợ). Trước đây khi thị trường liên ngân hàng chưa phát triển,
các NHTM cũng ít phát triển nghiệp vụ này. Ngày này, với sự hỗ trợ của khoa
học công nghệ, các NH liên hệ với nhau qua đường truyền nên các giao dịch được thực hiện tức thì và thông tin được cập nhật liên tục trong ngày, do đó, thị trường liên ngân hàng hoạt động sôi động và mang tính cạnh tranh hơn. Một NHTM thừa vốn đều có thể thông qua thị trường liên ngân hàng để gửi
tiền hoặc cho vay qua đêm với lãi suất cao. Hoặc khi gặp khó khăn về vấn đề
thanh khoản, thông qua thị trường liên ngân hàng, các NHTM có thể vay “nóng” trực tiếp từ các ngân hàng khác một cách nhanh chóng. Như vậy, trong điều kiện bình thường, hoạt động liên ngân hàng thực hiện chức năng vốn có là thiết lập quan hệ vay gửi giữa các NH khác để mở rộng quan hệ đại lý, giúp
cho việc thanh toán của khách hàng được nhanh chóng và thuận tiện hơn. Trong một số trường hợp đặc biệt, khi thị trường thuận lợi hay khó khăn
NHTM có thể tận dụng kênh đầu tư này để tăng lợi nhuận hoặc giải quyết vấn
đề khó khăn về thanh khoản. Do đó, phân tích hoạt động liên ngân hàng cần tập trung phân tích quy mô, tỷ trọng của hoạt động liên ngân hàng so với tổng tài sản để biết xem NHTM có dành nhiều vốn vào kênh sinh lời này không.
Đồng thời phân tích tình hình thị trường để biết được hiệu quả sử dụng vốn của NHTM cũng như mức độ khó khăn về thanh khoản của NH.
Kinh doanh ngoại tệ cũng là một nghiệp vụ chính của NHTM. Kinh doanh ngoại tệ của các NHTM bao gồm các giao dịch mua bán ngoại tệ giao ngay (spot), giao dịch kì hạn (Forward), giao dịch hoán đổi (Swap), giao dịch
quyền chọn (Options) giao dịch tương lai (Futures). Hiện nay các NHTM VN
chủ yếu thực hiện hoạt động giao ngay, kì hạn, quyền chọn và hoán đổi. Nghiệp vụ Futures gần như chưa có ngân hàng nào thực hiện. Phân tích nghiệp vụ kinh doanh ngoại tệ, nhà phân tích thường phân tích về doanh số mua bán
từng ngoại tệ trong kì