Chương 4 BÀN LUẬN
4.3.3.Về kết quả xác định phả hệ nguồn gốc gen PA
+ Tương tự các gen PB2 và PB1, gen PA của 6 biến chủng virus cúm A/H5N1 nghiên cứu và các chủng trong 3 nhóm virus clade 1.1, 2.3.2.1, 2.3.4.3, cũng như nhóm virus clade 1, lần lượt có nguồn gốc từ nguồn gen tương ứng của virus cúm A/H5N1 thuộc 2 genotype Z và V.
- Gen PA của nhóm virus clade 2.3.2.1 gồm 2 biến chủng virus nghiên cứu DkQT801-2011 và DkQT802-2011, phân lập tại Việt Nam và Trung Quốc các năm 2009 – 2012, có quan hệ nguồn gốc gần gũi với gen này của 2 nhóm virus clade 2.3.4.3, 2.3.4, phân lập từ người và gia cầm bệnh tại Việt Nam các năm 2007 – 2008. Đặc biệt, gen PA của 2 biến chủng virus nghiên cứu DkQT801-2011 và DkQT802-2011, cùng với 3 chủng virus clade 2.3.2.1 phân lập từ gia cầm bệnh tại Việt Nam, cũng có quan hệ nguồn gốc gần gũi hơn với gen tương ứng của chủng A/Hubei/1/2010 phân lập tại Trung Quốc, so với các chủng phân lập từ chim hoang dã trong nhóm virus clade 2.3.2.1. Kết quả này cho thấy, gen PA của các chủng virus gây bệnh ở gia cầm trong nhóm virus clade 2.3.2.1, cũng đã có nhiều biến đổi so với các chủng virus gây bệnh ở chim hoang dã.
- Bên cạnh đó, gen PA của 2 nhóm virus clade 2.3.4.3 và 2.3.4 phân lập tại Việt Nam các năm 2007 – 2008 bao gồm 02 biến chủng virus DkNA72-2007 và DkNA114-2007, có nguồn gốc từ nguồn gen tương ứng của nhóm virus clade 2.3.4 thuộc genotype V, hình thành và lưu hành tại Trung Quốc các năm 2005 – 2006.
- Tương tự, gen PA của nhóm virus clade 1.1 gồm 2 biến chủng virus nghiên cứu CkDT382-2008 và DkTG926-2009, phân lập trên gia cầm tại Việt Nam các năm 2009 – 2011, có quan hệ nguồn gốc từ nguồn gen của nhóm virus clade 1.1 thuộc genotype Z, phân lập từ người bệnh tại Campuchia các năm 2007 – 2011. Gen PA của nhóm virus clade 1.1 có quan hệ gần gũi với gen tương ứng của nhóm virus clade 1 thuộc genotype Z, hình thành tại Trung Quốc giai đoạn trước đó và lưu hành gây bệnh dịch tại Việt Nam, Thái Lan giai đoạn 2003 – 2005.
Như vậy, cũng giống như gen PB2 và PB1, gen PA của của các chủng virus phân lập tại Việt Nam từ 2003 đến nay bao gồm cả 6 biến chủng virus cúm A/H5N1 nghiên cứu, biến đổi phân chia thành 4 dưới phân nhánh trong 2 phân nhánh tiến hóa, có nguồn gốc từ nguồn gen tương ứng của virus cúm A/H5N1 thuộc genotype Z và V. Trong đó, gen PA của các chủng virus clade 2.3.2.1 và 2.3.4.3 có nguồn gốc từ virus cúm A/H5N1 thuộc genotype V, gen PA của các chủng virus clade 1 và 1.1 có nguồn gốc từ virus cúm A/H5N1 thuộc genotype Z. Kết quả phân tích phả hệ dựa trên trình tự gen PA ở trên phù hợp với kết quả phân tích biến đổi di truyền ở tiểu mục 3.2.3 cho thấy, gen PA cũng có sự biến đổi tiến hóa tương quan với gen
H5 ở virus cúm A/H5N1, trong 4 nhóm virus clade 1, 1.1, 2.3.4.3 và 2.3.2.1, lưu hành gây bệnh dịch phổ biến ở Việt Nam. Kết quả trên cũng phù hợp với các kết quả nghiên cứu xác định phả hệ nguồn gốc virus cúm A/H5N1, trong 4 nhóm virus nói trên lưu hành tại Việt Nam, Trung Quốc và các quốc gia lân cận từ năm 2003 đến nay [75], [76], [77], [78], [80], [86].
+ Bên cạnh đó, tương tự các gen PB2 và PB1, kết quả phân tích nguồn gốc phả hệ gen PA của một số chủng virus clade 2.2, 2.3.2, 2.3.4 và 2.1.3.2, thuộc genotype Z, V và G phân lập trong các năm 2004 – 2007, tại Trung Quốc, Ấn Độ và Indonesia, cũng cho thấy có sự tái tổ hợp gen H5 và gen PA trong hệ gen của các chủng virus kể trên, từ nguồn gen genotype virus khác nhau hình thành trước đó.
+ Cũng như gen PB2 và PB1, gen PA của chủng virus A/VN/UT30850/2005 clade 1 phân lập tại Việt Nam năm 2005, có chung nguồn gốc với các chủng virus clade 2.3.4 thuộc genotype V. Kết quả này chứng tỏ, gen PA của virus cúm A/H5N1 thuộc genotype V, cũng đã được tái tổ hợp trong các chủng virus cúm A/H5N1 clade 1 lưu hành tại Việt Nam từ năm 2005.
+ Ngoài ra, kết quả phân tích cũng cho thấy, gen PB1 của các chủng virus cúm A/H5N1 lưu hành gây bệnh dịch ở gia cầm từ 2003 đến nay, cũng có nguồn gốc chung từ nguồn gen tương ứng của nhóm virus clade 0 thuộc genotype GD.
Các kết quả phân tích ở trên cho thấy, tương tự gen PB2 và PB1, gen PA trong hệ gen virus cúm A/H5N1 cũng có sự biến đổi tiến hóa mạnh mẽ kể từ khi hình thành các chủng virus đầu tiên từ 1996 đến nay.