Chương 4 BÀN LUẬN
4.1.1. Về kết quả thu nhận các gen PB2, PB1 và PA
Kết quả thu nhận các gen PB2, PB1 và PA trong hệ gen 6 biến chủng virus cúm A/H5N1 nghiên cứu, cho thấy:
- Sáu biến chủng virus cúm A/H5N1 nghiên cứu, bao gồm: DkNA72-2007, DkNA114-2007, CkDT382-2008, DkTG926-2009, DkQT801-2011 và DkQT802- 2011, chứa các gen PB2, PB1 và PA thu nhận sau giải trình tự, đều có kích thước lần lượt là 2.280, 2.274 và 2.151 nucleotide theo thứ tự, với bộ ba khởi đầu là ATG và kết thúc là TAG. Đây cũng là tổng số nucleotide của trình tự vốn có của các gen PB2, PB1 và PA trong hệ gen virus cúm A/H5N1 được phân lập, nghiên cứu và công bố từ năm 1996 đến nay [1], [2], [6], [12].
- Kết quả cắt kiểm tra DNA của PB2, PB1, PA cho thấy, có sự bảo tồn các vị trí điểm cắt của enzym EcoRI trong trình tự các gen PB2 (1 vị trí), PB1 (2 vị trí) và PA (2 vị trí), ở 6 biến chủng virus cúm A/H5N1 nghiên cứu so với trình tự tương ứng, của các chủng virus phân lập trên nhiều loài vật chủ từ 2003 đến nay.
- Bên cạnh đó, kết quả đối chiếu trình tự các gen PB2, PB1 và PA thu nhận từ 06 biến chủng virus cúm A/H5N1 nghiên cứu, đều có tỉ lệ tương đồng 97% – 99% ở mức độ so sánh 96% – 100%, với trình tự các gen tương ứng của các chủng virus cúm A/H5N1 được lưu trữ trong Ngân hàng gen từ năm 2007 đến nay.
Các kết quả trên chứng tỏ rằng, trình tự nucleotide các gen PB2, PB1 và PA trong hệ gen của 6 biến chủng virus nghiên cứu, đã được thu nhận đầy đủ toàn vẹn khung đọc mở và chính xác là các gen tương ứng, của virus cúm A/H5N1 đang lưu hành gây bệnh dịch cúm gia cầm A/H5N1 thời gian gần đây. Kết quả cũng cho thấy, trình tự của các gen nói trên đảm bảo độ tin cậy để so sánh, phân tích biến đổi đặc tính di truyền và tìm hiểu phả hệ nguồn gốc chủng loại, với các gen tương ứng của virus cúm A/H5N1 lưu hành gây bệnh từ 2003 đến nay thu thập từ Ngân hàng gen.