H5 GENOTYPE

Một phần của tài liệu Nghiên cứu sự biến đổi di truyền các gen PB2, PB1 và PA polymerase của virus cúm A-H5N1 đương nhiễm tại Việt Nam [FULL] (Trang 46)

Chương 2 ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU

H5 GENOTYPE

1 A/Goose/Guangdong/01/1996(H5N1) A/Goose/Guangdong/1/1996 Trung Quốc 0 GD

2 A/HongKong/156/1997(H5N1) A/HK/156/1997 Trung Quốc 0 GD

3 A/Duck/Guangdong/12/2000(H5N1) A/Dk/Gd/12/2000 Trung Quốc 0 GD

4 A/HongKong/212/2003 (H5N1) A/HK/212/2003 Trung Quốc 1 Z+

5 A/VietNam/UT30850/2005(H5N1) A/VN/UT30850/2005 Việt Nam 1 -

6 A/Cambodia/R0405050/2007(H5N1) A/KH/R0405050/2007 Campuchia 1.1 Z

7 A/Indonesia/5/2005(H5N1) A/ID/5/2005 Indonessia 2.1.3.2 G

8 A/bar headed goose/Qinghai/3/2005(H5N1) A/BHG/QH/3/2005 Trung Quốc 2.2 G

9 A/Xinjiang/1/2006(H5N1) A/Xinjiang/1/2006 Trung Quốc 2.2 Z

10 A/Muscovy duck/VietNam/1455/2006(H5N1) A/MDk/VN/1455/2006 Trung Quốc 2.3.2 G 11 A/Chicken/Guangdong/191/2004(H5N1) A/Ck/Gd/191/2004 Trung Quốc 2.3.2 G 11 A/Chicken/Guangdong/191/2004(H5N1) A/Ck/Gd/191/2004 Trung Quốc 2.3.2 G 12 A/Chicken/India/NIV33487/2006(H5N1) A/Ck/IN/NIV33487/2006 Ấn Độ 2.3.2 G 13 A/Duck/Guangxi/150/2006(H5N1) A/Dk/Gx/150/2006 Trung Quốc 2.3.2 V 14 A/Duck/Hunan/856/2006(H5N1) A/Dk/Hunan/856/2006 Trung Quốc 2.3.2 V 15 A/Duck/Guangxi/13/2004(H5N1) A/Dk/Gx/13/2004 Trung Quốc 2.3.2 G 16 A/China/Guangdong/01/2006(H5N1) A/CN/Gd/01/2006 Trung Quốc 2.3.2 V

17 A/Anhui/1/2005(H5N1) A/Anhui/1/2005 Trung Quốc 2.3.2 V

18 A/Duck/HokkaidoWZ83/2010(H5N1) A/Dk/HokkaidoWZ38/2010 Nhật Bản 2.3.2.1 - 19 A/Muscovy duck/VietNam/LBM14/2011(H5N1) A/MDk/VN/LBM14/2011 Việt Nam 2.3.2.1 - 19 A/Muscovy duck/VietNam/LBM14/2011(H5N1) A/MDk/VN/LBM14/2011 Việt Nam 2.3.2.1 -

20 A/Guangxi/1/2005(H5N1) A/Guangxi/1/2005 Trung Quốc 2.3.4 V

21 A/Fujian/1/2005(H5N1) A/Fujian/1/2005 Trung Quốc 2.3.4 V

22 A/Duck/VietNam/50/2007(H5N1) A/Dk/VN/50/2007 Việt Nam 2.3.4 Z 23 A/Duck/VietNam/43/2007(H5N1) A/Dk/VN/43/2007 Việt Nam 2.3.4 Z 23 A/Duck/VietNam/43/2007(H5N1) A/Dk/VN/43/2007 Việt Nam 2.3.4 Z

24 A/Hunan/02/2009(H5N1) A/Hunan/02/2009 Trung Quốc 2.3.4.1 V

25 A/Guizhou/1/2009(H5N1) A/Guizhou/1/2009 Trung Quốc 2.3.4.1 V 26 A/Duck/Phu tho/07/48/2007(H5N1) A/Dk/Phutho/07/48/2007 Việt Nam 2.3.4.2 V 26 A/Duck/Phu tho/07/48/2007(H5N1) A/Dk/Phutho/07/48/2007 Việt Nam 2.3.4.2 V 27 A/VietNam/HN31432M/2008(H5N1) A/VN/HN31432M/2008 Việt Nam 2.3.4.2 V

28 A/Duck/Lao/975/2010(H5N1) A/Dk/Lao/975/2010 Lào 2.3.4.2 -

29 A/Duck/Ha tinh/07/53/2007(H5N1) A/Dk/Hatinh/07/53/2007 Việt Nam 2.3.4.3 V 30 A/VietNam/UT31412II/2008(H5N1) A/VN/UT31412II/2008 Việt Nam 2.3.4.3 - 30 A/VietNam/UT31412II/2008(H5N1) A/VN/UT31412II/2008 Việt Nam 2.3.4.3 - 31 A/VietNam/UT31239/2007(H5N1) A/VN/UT31239/2007 Việt Nam 2.3.4.3 -

Ghi chú: Clade H5: Phân loại virus cúm A/H5N1 theo các clade gen HA(H5); Genotype: Phân loại virus theo kiểu gen tái tổ hợp 6 phân đoạn gen PB2, PB1, PA, NP, M và NS trong hệ gen virus cúm A/H5N1. Kí hiệu GD, Z+, Z, V và G: tên các genotype virus. Dấu (-): chủng virus chưa được xác định genotype.

Một phần của tài liệu Nghiên cứu sự biến đổi di truyền các gen PB2, PB1 và PA polymerase của virus cúm A-H5N1 đương nhiễm tại Việt Nam [FULL] (Trang 46)