Chương 3 KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU
3.1.1. Kết quả tách chiết RNA tổng số và chuyển đổi cDNA hệ gen virus
Sáu mẫu RNA tổng số chứa RNA hệ gen virus của 6 biến chủng virus cúm A/H5N1 trong nghiên cứu, được tách chiết từ các mẫu bệnh phẩm tương ứng và chuyển đổi thành cDNA. Các mẫu cDNA hệ gen của 6 biến chủng virus nói trên được kiểm tra bằng phản ứng PCR, với cặp mồi H5F1 – H5R1 thu nhận một phần gen HA(H5). Sản phẩm sau các phản ứng PCR nói trên được điện di kiểm tra trên thạch agarose 1% và trình bày ở hình 3.1. M 1 2 3 4 0,8kb M 1 2 A B 0,8kb 2,3 kb 2,0 kb 0,5 kb 4,0 kb 2,3 kb 2,0 kb 0,5 kb 4,0 kb
Hình 3.1. Kết quả điện di kiểm tra DNA một phần gen HA(H5) với cặp mồi H5F1 – H5R1 của 6 biến chủng virus cúm A/H5N1 trong nghiên cứu
Ghi chú: (A): DNA một phần gen H5 của 4 biến chủng virus DkNA72-2007, DkNA114-2007, CkDT382-
2008 và DkTG926-2009 (M: Marker Lambda HindIII (λHindIII); 1: DkNA72-2007; 2: DkNA114-2007; 3:
CkDT382-2008; 4: DkTG926-2009). (B): DNA một phần gen H5 của 2 biến chủng virus DkQT801-2011 và
DkQT802-2011 (1: DkQT801-2011 và 2: DkQT802-2011).
Kết quả trong hình 3.1 cho thấy, ở 4 mẫu kiểm tra cDNA hệ gen của các biến chủng virus DkNA72-2007, DkNA114-2007, CkDT382-2008 và DkTG926-2009 (Hình 3.1A), cùng với 2 mẫu của các biến chủng virus DkQT801-2011 và DkQT802-2011 (Hình 3.1B), đều cho 1 băng sáng biểu hiện sản phẩm DNA. Các sản phẩm DNA nói trên có độ dài khoảng 0,8 kb đối chiếu với marker λ HindIII, tương ứng với độ dài đoạn DNA một phần gen H5 dự kiến thu nhận, sau phản ứng PCR từ cDNA hệ gen virus với cặp mồi H5F1 – H5R1.
Kết quả trên chứng tỏ, quá trình tách chiết RNA tổng số và chuyển đổi RNA hệ gen của 6 biến chủng virus cúm A/H5N1 trong nghiên cứu thành cDNA, đã được
thực hiện thành công từ các mẫu bệnh phẩm tương ứng. Sản phẩm cDNA hệ gen virus được lưu giữ bảo quản ở nhiệt độ -200C, và sử dụng làm khuôn mẫu cho thu nhận DNA các gen PB2, PB1 và PA với các cặp mồi đặc hiệu bằng PCR.