Hoàn thiện quy trình nghiệp vụ đối với công tác kiểm soát chi đầu tư NSNN như các quy trình quản lý, kiểm soát chi vốn đầu tư XDCB thuộc nguồn vốn NSNN qua KBNN và quy định cụ thể cho từng loại nguồn vốn đầu tư, cấp ngân sách khác nhau, cụ thể:
Phạm vi kiểm soát chi: KBNN kiểm soát, thanh toán theo dự toán được duyệt hoặc giá trúng thầu được duyệt và giới hạn trong tổng mức đầu tư, hợp đồng xây dựng của dự án, công trình đã được cấp có thẩm quyền phê duyệt. KBNN không kiểm tra việc áp dụng định mức, đơn giá của dự toán được duyệt, của công việc hoàn thành đề nghị thanh toán, cấp có thẩm quyền phê duyệt dự toán, dự án đầu tư và chủ đầu tư chịu trách nhiệm về việc phê duyệt và đề nghị thanh toán vốn đầu tư từ nguồn NSNN.
dung kiểm tra tài liệu hợp pháp, hợp lệ, chủ thể tham gia ký kết hợp đồng. Nếu uỷ quyền ký hợp đồng thì phải có văn bản uỷ quyền, quy định tài liệu chủ đầu tư gửi KBNN là bản chính, bản công chứng hoặc bản sao y bản chính theo quy định của pháp luật, theo tính chất của từng loại tài liệu. KBNN chỉ kiểm soát, đối chiếu giữa khối lượng, đơn giá đề nghị thanh toán với khối lượng, đơn giá trong dự toán được duyệt hoặc khối lượng, đơn giá trúng thầu và điều kiện cụ thể của hợp đồng giữa chủ đầu tư và nhà thầu. Hướng dẫn rõ ràng và cụ thể về hồ sơ và điều kiện để được tạm ứng cấu kiện, bán thành phẩm và vật tư dự trữ theo mùa, kinh phí tạm ứng được chuyển cho nhà thầu hay đơn vị cung ứng vật tư. Đồng thời, quy trình cũng phải hướng dẫn việc kiểm soát, thanh toán khối lượng hoàn thành khi có vật tư cấu kiện, bán thành phẩm được kết cấu vào công trình đã được nghiệm thu để xử lý giá vật tư tại thời điểm tạm ứng với thời điểm nghiệm thu (đối với trường hợp gói thầu chỉ định thầu).
Kiểm soát chi vốn mua sắm hàng hóa, thiết bị trong các dự án đầu tư:
KBNN căn cứ vào biên bản nghiệm thu mua sắm hàng hóa, thiết bị và hợp đồng mua sắm hàng hóa, thiết bị giữa chủ đầu tư và nhà thầu để thanh toán cho đơn vị thụ hưởng.
Kiểm soát chi vốn đền bù giải phóng mặt bằng: Xây dựng đề án KBNN thực hiện chi trả trực tiếp cho các hộ dân nằm trong diện được đền bù giải tỏa theo đề nghị của chủ đầu tư hoặc hội đồng đền bù giải phóng mặt bằng. Đề án phải nêu rõ phương thức chi trả, nội dung chi trả, hồ sơ tài liệu để làm căn cứ chi trả trực tiếp cho các hộ dân,…
Kiểm soát thanh toán chi phí quản lý dự án đầu tư theo các trường hợp cụ thể như: Đối với các chi phí quản lý dự án do tư vấn thực hiện theo định mức (tỷ lệ %) được kiểm soát thanh toán theo định mức được hưởng; đối với các chi phí quản lý dự án phải lập dự toán thì kiểm soát thanh toán theo dự toán được duyệt; đối với chi phí thuê tư vấn quản lý dự án thì kiểm soát thanh
toán theo hợp đồng giữa chủ đầu tư và tư vấn được thuê.
Kiểm soát chi dự án đầu tư bằng nhiều nguồn vốn, nhiều cấp ngân sách khác nhau: Dự án đầu tư thuộc cấp trung ương, cấp tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương quyết định đầu tư do KBNN tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương kiểm soát và thanh toán phần nguồn vốn của NSTW và NSĐP tham gia đầu tư vào dự án; phần nguồn vốn thuộc ngân sách cấp huyện, xã tham gia đầu tư sẽ do KBNN huyện thanh toán theo chứng từ do KBNN kiểm soát gửi đến và theo đề nghị của chủ đầu tư; Quy định về trình tự, thời gian kiểm soát, hồ sơ tài liệu chủ đầu tư phải gửi KBNN theo từng cấp kiểm soát, thanh toán.
Về mẫu biể và chứng từ kiểm soát chi đầu tư:
- Sửa đổi mẫu số 01/TTVĐT Bảng kê thanh toán chi phí Ban quản lý dự án: cần thiết kế bổ sung thêm nội dung như đơn vị nhận tiền, tài khoản, ngân hàng,… Hiện nay, không có nội dung này trên bảng kê (chứng từ mệnh lệnh do bộ phận Thanh toán vốn đầu tư thụ lý, trình giám đốc duyệt). Tuy nhiên, khi Ban quản lý lập Uỷ nhiệm chi gửi bộ phận kế toán để chuyển tiền cho nhà thầu thì trên Uỷ nhiệm chi lại có nội dung này, nên không có cơ sở đối chiếu với chứng từ mệnh lệnh (Hợp đồng do bộ phận Thanh toán vốn đầu tư lưu không chuyển cho bộ phận kế toán).
- Hướng dẫn sử dụng và lập Bảng xác định giá trị khối lượng công việc hoàn thành theo hợp đồng (phụ lục số 02 ban hành kèm theo Thông tư số 06/2007/TT-BXD ngày 25/7/2007 của Bộ Xây dựng về hướng dẫn hợp đồng trong hoạt động xây dựng).
- Nguyên tắc kiểm soát chi đối với khối lượng thực hiện trước khi Nghị định số 99/2007/NĐ-CP ngày 13/6/2007 của Chính phủ về quản lý chi phí đầu tư xây dựng công trình có hiệu lực thi hành đến nay, chủ đầu tư mới gửi hồ sơ đến KBNN để thanh toán mà những dự án này vẫn quản lý theo Nghị định 16/2005/NĐ-CP.