1. Đânh chiếm Phú Xuđn
Tại Bắc Hă, năm 1782, Tĩnh Đô vương Trịnh Sđm qua đời, thế tử Trịnh Cân
được lập lăm Điện Đô vương. Phe của người con lớn[g] lă Trịnh Tông lăm binh biến, giết quan phụ chính lă quận Huy Hoăng Tố Lý (châu lêo tướng Hoăng Ngũ Phúc) đưa Trịnh Tông lín ngôi, tức lă Đoan Nam vương (1782-1786). Một tướng theo phe quận Huy lă Nguyễn Hữu Chỉnh không hợp tâc với Trịnh Tông, bỏ chạy văo Nam hăng Tđy Sơn vă được Nguyễn Nhạc rất tín nhiệm.[25] Bắc Hă ngăy một suy yếu. Nguyễn Nhạc quyết định đânh chiếm Phú Xuđn (đất cũ của chúa Nguyễn). Năm 1786, Nguyễn Huệ được cử lăm tổng chỉ huy cùng Nguyễn Lữ đânh ra Bắc.
Về phía Trịnh, sau khi nhận hăng Nguyễn Nhạc, lêo tướng Hoăng Ngũ Phúc rút đại quđn về Bắc (1775), để lại Phạm Ngô Cầu vă Hoăng Đình Thể giữ thănh Phú Xuđn. Sau đó không lđu, Hoăng Ngũ Phúc qua đời.
Nguyễn Huệ lập kế lung lạc chủ tướng Phạm Ngô Cầu. Nguyễn Hữu Chỉnh lại dùng kế ly giân Phạm Ngô Cầu vă phó tướng Hoăng Đình Thể. Quđn Tđy Sơn bất ngờ đânh úp thănh Phú Xuđn. Phạm Ngô Cầu bỏ mặc Hoăng Đình Thể chết trận vă quyết định dđng thănh hăng Tđy Sơn.[26] Trong khi đó thì Nguyễn Lữ đem quđn thủy đânh xong câc đồn từ sông Gianh trở văo
2. Tiến ra Thăng Long
Do sự thuyết phục của Nguyễn Hữu Chỉnh, Nguyễn Huệ quyết định đem quđn ra Bắc đânh Thăng Long để diệt họ Trịnh dù chưa được lệnh của vua anh Nguyễn Nhạc.
Với danh nghĩa “Phù Lí diệt Trịnh”, Nguyễn Huệ sai Nguyễn Hữu Chỉnh lăm tiín phong Bắc tiến. Quđn Trịnh rệu rê nhanh chóng tan vỡ, câc danh tướng phần nhiều nghe tin Phú Xuđn thất thủ đê khiếp sợ, đến khi nghe quđn Tđy Sơn kĩo ra đa số bỏ trốn. Chúa Trịnh bỏ thănh Thăng Long chạy vă bị dđn bắt đem nộp Tđy Sơn. Trín đường âp giải, Trịnh Tông đê tự sât.
Nguyễn Huệ văo thănh Thăng Long yết kiến vua Lí Hiển Tông. Tuy về danh nghĩa Nguyễn Huệ trao trả quyền chính lại cho vua Lí vă nhận phong Nguyín súy Dực chính phù vận Uy quốc công, nhưng trong thực tế ông nắm toăn bộ quyền chính ở Bắc Hă. Do sự sắp xếp của Nguyễn Hữu Chỉnh, vua Lí Hiển Tông gả công chúa Lí Ngọc Hđn cho Nguyễn Huệ.
Thâng 7 năm 1786, vua Lí Hiển Tông qua đời, thọ 70 tuổi. Thể theo ý kiến của công chúa Ngọc Hđn thiín về lập hoăng thđn Lí Duy Cận (anh Ngọc Hđn), Nguyễn Huệ muốn tôn lập Duy Cận lăm vua.[27] Tuy vậy, do âp lực của tôn thất
nhă Lí đối với Ngọc Hđn, Nguyễn Huệ đănh thu xếp cho Lí Duy Kỳ lín ngôi vua, đó lă vua Lí Chiíu Thống. Ít lđu sau, Nguyễn Huệ đem công chúa Ngọc Hđn cùng Nguyễn Nhạc rút quđn về Nam.