Được sự quan tâm, đầu tư của Nhà nước thông qua chương trình phát triển NTTS nên nghề nuôi thủy sản có sự phát triển vượt bậc về mọi mặt: đối tượng nuôi ngày càng đa dạng, diện tích, năng suất NTTS không ngừng tăng lên qua các năm. Tốc
độ tăng trưởng sản lượng nuôi trồng không ngừng tăng lên qua các năm. Tốc độ tăng trưởng sản lượng NTTS trong những năm gần đây khá cao (bình quân hàng năm giai
đoạn (2000-2005) đạt 17.3 %/năm) trong đó nổi bật là sự phát triển vượt bậc của nghề
nuôi tôm sú. Năm 2005, sản lượng NTTS đạt 18000 tấn. Trong thời gian này, Tỉnh đã chủ trương tập trung vào phát triển các đối tượng có giá trị xuất khẩu như tôm sú, cá rô phi đơn tính,.. Cụ thể:
Ø Nhóm sản phẩm tôm:
Tôm sú là đối tượng nuôi chủ lực phục vụ xuất khẩu ở Nghệ An. Trong những năm gần đây , nghề nuôi tôm sú phát triển rất nhanh. Tính đến năm 2005, diệm tích nuôi tôm thâm canh và bán thâm canh là 800 ha, sản lượng đạt 1500 tấn. Năng suất nuôi tôm bình quân toàn tỉnh đạt gần 1 tấn/ha, năng suất tôm thâm canh đạt 1.9 tấn/ha.
Tôm thẻ chân trắng đã du nhập vào nuôi trong tỉnh nhưng mới ở mức khảo nghiệm. Do vậy, loài tôm này chưa có sản lượng cung cấp cho chế biến xuất khẩu.
Ø Cá rô phi đơn tính: là đối tượng nuôi nước ngọt có tiềm năng phục vụ xuất khẩu. Từ năm 2003 Tỉnh đã triển khai chương trình phát triển nuôi cá rô phi. Năm 2005, sản lượng cá rô phi xuất khẩu đạt 2500 tấn tăng 277.7 % so với năm 2003. Tuy nhiên do kích cỡ cá nuôi nhỏ không đáp ứng yêu cầu của chế biến xuất khẩu. Vì vậy chỉ dùng cho tiêu thụ nội địa.
Ø Nhóm cá nước mặn: Đã bước đầu quan tâm nhưng sản lượng chưa nhiều, chủ
yếu tiêu thụ nội địa. Đối tượng nuôi chủ yếu là cá gìp, cá mú, cá vược… Năm 2005 có 35 lồng nuôi trên biển. Trong những năm gần đây do ảnh hưởng của thiên tai nên phong trào nuôi trên biển phát triển chưa mạnh, chưa xứng với tiềm năng phát triển của vùng. Theo số liệu điều tra, diện tích có khả năng nuôi biển là 1300 ha. Vì vậy, nó có thể được xem là nguồn cung cấp nguyên liệu cho chế biến và xuất khẩu. Hiện nay,Tỉnh Nghệ An đang có chủ trương quan tâm, khôi phục và phát triển nghề nuôi này.
Ø Nhóm nhuyễn thể: Đối tượng nuôi hiện nay ở Nghệ An chủ yếu là ngao. Năm 2005, diện tích nuôi ngao gần 100 ha, năng suất bình quân đạt 14 tấn/ha. Tuy nhiên, nghề nuôi ngao vẫn trong tình trạng nuôi quảng canh, nhỏ lẻ, dựa vào nguồn giống tự
nhiên là chính. Sản phẩm chủ yếu tiêu thụ nội địa.
Ø Nhóm sản phẩm cua:
Nghề nuôi cua đang được phát triển nhưng mới chỉ ở qui mô nhỏ tại các huyện thị ven biển. Sản phẩm chủ yếu xuất sang thị trường Trung Quốc theo đường tiêu thụ tiểu ngạch và tiêu thụ nội địa. Hiện nay ở Nghệ An đã sản xuất nhân tạo được giống cua, là điều kiện thuận lợi cho việc nuôi cua thương phẩm.
Ghẹ biển là sản phẩm có thị trường tiêu thụ rộng nhưng sản lượng khai thác còn hạn chế. Hơn nữa, Tỉnh vẫn chưa chủ động được giống và công nghệ nuôi nên chưa kích thích được nghề nuôi ghẹ phát triển.