- Phạm vi thu hồi đất: theo quy định tại Nghị định 181 và Nghị định 197 của Chính phủ thì Nhà nước chỉ thực hiện việc thu hồi đất để sử dụng vào mục đích quốc phịng, an ninh, lợi ích quốc gia, lợi ích cơng cộng và phát triển kinh tế. Việc thu hồi đất đối mục
đích phát triển kinh tế nhà nước chỉ thực hiện đối với các dự án lớn, các dự án có vốn đầu tư nước ngồi; cịn với các dự án khác Nhà nước không thực hiện thu hồi và bồi thường đất mà do doanh nghiệp tự thỏa thuận với người có đất; điều này có tích cực là giảm nhẹ công việc và sự can thiệp của Nhà nước đối với thị trường, tăng tính chủ động cho doanh nghiệp. Nhưng từ cuối năm 2004, việc áp dụng chính sách này đã làm cho các doanh nghiệp gặp nhiều khó khăn do trước đây luôn được Nhà nước làm hộ (nhất là doanh nghiệp nhà nước) và việc phải đi tự thỏa thuận giá đền bù với từng hộ dân là rất phức tạp. Điều này tác động xấu đến môi trường đầu tư, ảnh hưởng không tốt đến việc khai thác nguồn lực tài chính từ đất đai, nguồn thu của NSNN.
- Giá đền bù đất của Nhà nước: cùng với phạm vi thu hồi đất của nhà nước đã thu hẹp lại so với trước đây như nêu trên thì cơng tác bồi thường đối với các dự án khi Nhà nước thu hồi đất cũng đang gặp những khó khăn do giá đền bù. Cụ thể là: khi Nhà nước thu hồi đất, giá đền bù hỗ trợ cho người có đất bị thu hồi là giá do UBND các tỉnh, thành phố ban hành (giá thấp và cố định không điều chỉnh); nhưng đối với dự án do doanh nghiệp tự đền bù thì giá đền bù hỗ trợ là giá thỏa thuận giữa hai bên, giá này sát với giá thị trường và luôn cao hơn giá do Nhà nước ban hành. Điều này đã dẫn đến các dự án do Nhà nước thu hồi đất đã khó khăn càng khó khăn hơn vì người bị thu hồi đất khiếu kiện do có giá của doanh nghiệp đề bù để so sánh; ảnh hưởng đến tiến độ thực hiện các dự án đầu tư, hiệu quả sử dụng đất.