Trong quỏ trỡnh hoạt động hệ thống kờnh phõn phối sản phẩm phõn đạm của Cụng ty TNHH một thành viờn Phõn đạm và Hoỏ chất Hà Bắc bộc lộ khỏ nhiều mõu thuẫn, xung đột. Trong cỏc mõu thuõn đú cú thể chia ra làm ba loại mõu thuẫn đú là: Mõu thuẫn, xung đột giữa nhà sản xuất và trung gian phõn phối; mõu thuẫn, xung đột ngang; và mõu thuẫn, xung đột dọc.
* Mõu thuẫn, xung đột giữa nhà sản xuất và trung gian phõn phối.
Mõu thuẫn, xung đột giữa nhà sản xuất và trung gian phõn phối chủ yếu phỏt sinh giữa Cụng ty TNHH một thành viờn Phõn đạm và Hoỏ chất Hà Bắc với Cụng ty cổ phần xuất nhập khẩu Hà Anh do hai Cụng ty này cựng tiếp cận cỏc trung gian phõn phối cấp một khỏc là: Cụng ty cổ phần Vật tƣ Nụng sản, Cụng ty cổ phần Vật tƣ Sụng Hồng, Cụng ty TNHH Xuất nhập khẩu Thƣơng mại tổng hợp Tấn Đạt, Cụng ty cổ phần Vật tƣ Kỹ thuật nụng nghiệp Bắc Giang. Theo quy định thỡ sản phẩm Phõn đạm sẽ do Cụng ty TNHH một thành viờn Phõn đạm và Hoỏ chất Hà Bắc cung cấp cho tất cả cỏc trung gian phõn phối bỏn buụn cấp một, tuy nhiờn trờn thực tế cỏc trung gian này nhiều khi phải mua lại sản phẩm Phõn đạm của Cụng ty cổ phần xuất nhập khẩu Hà Anh nhƣ là một trung gian phõn phối cấp hai. Đõy là một mõu thuẫn khỏ trầm trọng ảnh hƣởng lớn đến kết quả và hiệu quả của Hệ thống kờnh phõn phối sản phẩm phõn đạm của Cụng ty.
* Mõu thuẫn, xung đột giữa cỏc trung gian phõn phối cựng cấp
Trong hệ thống kờnh phõn phối sản phẩm phõn đạm của Cụng ty TNHH một thành viờn Phõn đạm và Hoỏ chất Hà Bắc thỡ mõu thuẫn, xung đột giữa cỏc trung gian phõn phối cựng cấp bao gồm: Mõu thuẫn giữa cỏc trung gian bỏn buụn trong việc cung cấp sản phẩm cho cỏc trung gian khỏc và mõu thuẫn giữa cỏc trung gian bỏn lẻ trong việc cung cấp sản phẩm cho khỏch hàng.
Mõu thuẫn, xung đột giữa cỏc trung gian phõn phối sinh giữa cỏc Cụng ty cổ phần xuất nhập khẩu Hà Anh, Cụng ty cổ phần Vật tƣ Nụng sản, Cụng ty cổ phần Vật tƣ Sụng Hồng, Cụng ty TNHH Xuất nhập khẩu Thƣơng mại tổng hợp Tấn Đạt và Cụng ty cổ phần vật tƣ Kỹ thuật nụng nghiệp Bắc Giang, họ khụng chịu chấp hành theo sự phõn chia khu vực mà họ chịu trỏch nhiệm phõn phối, cỏc Cụng ty vật tƣ nụng nghiệp tại cỏc tỉnh miền Bắc luụn luụn là đối tƣợng tiếp cận của nhiều nhà phõn phối cấp một, loại mõu thuẫn này diễn ra khỏ phổ biến làm cho hoạt động phõn phối sản phẩm Phõn đạm của cỏc Cụng ty diễn ra một cỏch chồng chộo, chi phớ đầu tƣ cho hoạt động của Hệ thống kờnh phõn phối sản phẩm phõn đạm của Cụng ty tăng lờn đỏng kể, điều này đồng nghĩa với việc là giảm kết quả và hiệu quả hoạt động của cả hệ thống.
Mõu thuẫn giữa cỏc trung gian bỏn buụn cũn phỏt sinh trong hệ thống kờnh phõn phối sản phẩm phõn đạm của Cụng ty TNHH một thành viờn Phõn đạm và Hoỏ chất Hà Bắc khi hai nhà phõn phối cấp cựng muốn cung cấp hàng cho một trung gian bỏn lẻ, mặc dự cỏc Cụng ty vật tƣ nụng nghiệp thuộc cỏc tỉnh đó phõn chia địa bàn hoạt động theo địa giới hành chớnh một cỏch khỏ rừ ràng, nhƣng mõu thuẫn loại này vẫn xảy ra, thụng thƣờng phỏt sinh tại cỏc trung gian bỏn lẻ cú trụ sở tại cỏc huyện giỏp với tỉnh khỏc, khi đú việc vận chuyển sản phẩm Phõn đạm từ Cụng ty vật tƣ nụng nghiệp của tỉnh khỏc về cỏc trung gian bỏn lẻ này lại gần hơn so với việc vận chuyển sản phẩm Phõn đạm từ Cụng ty vật tƣ nụng nghiệp trong tỉnh.
Ngoài ra mõu thuẫn, xung đột giữa cỏc nhà phõn phõn phối cựng cấp cũn là mõu thuẫn giữa cỏc trung gian bỏn lẻ, loại mõu thuẫn này phỏt sinh khi trờn cựng một địa bàn tồn tại từ hai trung gian bỏn lẻ trở lờn, loại mõu thuẫn này cũng ảnh hƣởng khụng nhỏ tới kết quả phõn phối sản phẩm Phõn đạm của Cụng ty TNHH một thành viờn Phõn đạm và Hoỏ chất Hà Bắc.
Trong Hệ thống kờnh phõn phối sản phẩm phõn đạm của Cụng ty TNHH một thành viờn Phõn đạm và Hoỏ chất Hà Bắc thỡ mõu thuẫn, xung đột giữa cỏc cấp trong cựng một kờnh phỏt sinh do quỏ trỡnh phõn chia lợi ớch giữa cỏc cấp trong cựng một kờnh chƣa thoả đỏng gõy ra sự bất món trong một số trung gian phõn phối, cụ thể là lợi ớch thu đƣợc từ hoạt động phõn phối của Cụng ty TNHH một thành viờn Phõn đạm và Hoỏ chất Hà Bắc của cỏc trung gian bỏn buụn cấp một thu đƣợc quỏ nhiều so với cỏc trung gian bỏn buụn cấp hai và cỏc trung gian bỏn lẻ, tỷ lệ chiết khấu của cỏc trung gian bỏn buụn cấp một là trong khoảng từ 10,93% đến 17,17% tớnh trờn giỏ bỏn lẻ cuối cựng, trong khi đú tỷ lệ của cả trung gian bỏn buụn cấp hai và tỷ lệ của trung gian bỏn lẻ cộng lại mới chỉ đạt trong khoảng từ 10,85% đến 12,02% mà thụi, cụ thể là tỷ lệ mà trung gian bỏn buụn cấp hai nhận đƣợc khoảng từ 4,21% đến 4,80%, cũn tỷ lệ này của trung gian bỏn lẻ vào khoản từ 6,35% đến 6,87% giỏ bỏn lẻ.