Trong quá trình khảo sát thực địa các công trình của cán bộ kỹ sư trắc địa và kỹ sư thiết kế tổ chức thi công của Công ty không đi sâu tìm hiểu các yếu tố thực tế ảnh hưởng trực tiếp đến hoạt động thiết kế tổ chức thi công. Cụ thể: điều kiện tự nhiên khí hậu, địa hình, khả năng sử dụng mặt bằng thi công, khả năng khai thác vận chuyển nguyên vật liệu trên thị trường, hệ thống giao thông trong vùng, nguồn cung cấp lao động phổ thông và các điều kiện khác.
Mặt khác, công tác quản lý giám giát quản lý thi công của cấp quản lý Công ty và chủ nhiệm công trình còn lỏng lẻo dẫn đến vẫn còn tồn tại một số công trình bị thất thoát nguyên vật liệu và đặc biệt là việc sử dụng tiền ứng thi công không đúng mục đích, không đưa vào chi phí thi công công trình mà sử dụng vào mục đích cá nhân hoặc thi công các công trình gửi bên ngoài Cty.
Trong quá trình thi công xây lắp, Công ty không tìm hiểu kỹ về năng lực thực sự của các chủ nhiệm công trình về tài chính, năng lực tổ chức thi công, năng lực về máy móc thiết bị và năng lực về đội ngũ kỹ sư giúp việc một cách cẩn thận và cặn kẽ. Nhiều cán bộ chủ nhiệm công trình năng lực tổ chức thi công kém, không có người giúp việc cũng được Công ty bố trí làm chỉ huy trưởng công trình và giao khoán khối lượng công việc.
Đặc biệt công tác nghiên cứu và lập kế hoạch tổ chức thi công công trình của các hạng mục chính không được đầu tư triển khai cụ thể vào khoa học. Việc quản lý và lập tiến độ thi công chỉ dựa vào cách lập tiến độ của công việc theo sơ đồ ngang ( sơ đồ Gantt) không phản ánh hết mối quan hệ và ảnh hưởng của từng công việc với nhau.
Công tác quản lý và sử dụng máy móc thiết bị chưa được tính toán cụ thể về yêu cầu máy móc thiết bị cho việc thi công các công trình đã trung thầu hàng năm và các năm tiếp theo. Bị động trong việc điều hành và huy động máy móc thiết bị, Công nghệ máy móc thiết bị thi công lạc hậu, chế độ bảo dưỡng, định kỳ không được quan tâm, tỷ lệ hỏng hóc vặt xảy ra thường xuyên làm giảm tiến độ thi công.
Việc tính toán nguồn vốn và nhu cầu cần dùng của nguyên vật liệu đầu vào của Công ty không được các phòng ban quan tâm giám sát chặt chẽ. Việc ỉ lại cho việc giao khoán hết cho chủ nhiệm công trình đã làm cho cấp quản lý bị động trong kế hoạch sử dụng vốn và quản lý vật liệu đầu vào.
Công tác đào tạo và sử dụng lao động của Cty chưa được chù trọng nâng cao trình độ cán bộ quản lý và đội ngũ kỹ sư công nhân lành nghề. Năng lực thực sự chưa đáp ứng được yêu cầu ngày càng cao của thị trường. Chính sách thu hút nguồn lao động có trình độ cao không được quan tâm và cầu thị. Có rất nhiều cán bộ, kỹ sư sau khi công tác 3 đến 4 năm đã xin chuyển đơn vị . Đội ngũ quản lý, giám sát
chất lượng công trình còn mỏng và yếu. Không thực hiện đúng vai trò, trách nhiệm của mình dẫn đến những sai sót trong quá trình thi công.
Ngoài ra, tinh thần trách nhiệm và ý thức kỷ luật của Cty đối với một số đội trưởng, chủ nhiệm công trình chưa được cao, năng lực yếu kém. Những cũng có chủ nhiệm lại lợi dụng việc buông lỏng quản lý của Cty để lợi dụng chiếm đoạt tài sản, vốn của Công ty, thi công dở dang và đổ hết trách nhiệm quản lý cho Cty.
Cơ sở vật chất và công cụ hỗ trợ quản lý của Cty không được hoàn chỉnh và hiện đại như: vận dụng công nghệ thông tin, phần mềm quản lý tiến độ, quản lý khối lượng trong quản lý thi công....